gcbi测序系列5-生物样本的收集方法及建库流程

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1、生物样本的收集保存方法及测序建库的基本流程刘艳奎GCBI生物技术中心上海其明信息技术有限公司生物样本的收集保存方法Page2生物样本类型细胞组织血液Page3其他细胞收集保存方法Page4提取RNA:贴壁细胞:细胞培养好后,去除培养液,用PBS快速的洗一遍,将PBS弃干净,直接加入TRIZOL,并吹打裂解细胞,待细胞裂解完全后,即可收集样本,-80储存。(不必胰酶消化)悬浮细胞:细胞培养好后,3000RPM离心5MIN,去除培养液,用PBS快速的洗一遍,将PBS弃干净,直接加入TRIZOL,并吹打裂解细胞,待细胞裂解完全后,-80储存。TRIZOL用量:

2、106的细胞需要1MLTRIZOL。提取DNA:收集细胞后,离心去除培养液,PBS快速洗2次,弃掉PBS,保存于-80°C冰箱。组织样本的收集方法Page5提取RNA:样本离体后,用生理盐水迅速洗一遍,装管后迅速投入液氮速冻30分钟,转移至-80度保存。RNALATER作用:如样本无法立即液氮,分离组织(薄膜状的组织等)注:植物样本处理方法均可参照组织样本。组织样本的用量:以脂肪组织为例,一般黄豆大小的样本即可提出5-10UG的TOTALRNA。提取DNA:样本离体后,用生理盐水迅速洗一遍,装管后迅速投入液氮速冻30分钟,转移至-80度保存。注意事项:1

3、、要用冻存管保存组织样本(不可用EP管),并且管盖不宜拧的过紧,以防止从液氮取出时管子炸裂,样本损失。2、用油性记号笔直接在样本管上标记样本名称,如果用标签纸或胶带粘贴,在长期的低温状态下很容易脱落,照成样本信息丢失。血液样本的收集保存方法Page6提取DNA:血液抗凝收集后,-80度保存提取RNA:1、采用PAXgenebloodRNAtube收集,注意收集血液后混合均匀需室温至少放置2小时,详细操作参照PAXgene说明书。2、全血加TRIZOLLS裂解液保存,详细操作参照TRIZOLLS说明书。如需血液中的特定细胞:需新鲜血液抗凝分离细胞,按照细胞

4、样本处理保存。注:抗凝剂不可以使用肝素其他样本类型收集保存方法石蜡样本:石蜡块或石蜡切片常温保存血清、血浆、尿液等液体样本提取DNA:样本收集后,-80保存。提取RNA:样本收集后,加入3倍体积的TRIZOL,迅速摇匀后,-80保存。外泌体:提取DNA:样本收集后,-80保存。提取RNA:样本收集后,加入TRIZOL,放置5分钟后,-80保存。Page7测序建库的基本流程Page2生物样本类型DNA建库RNA建库Page3DNA建库Page5RNA建库Page5预告第六讲全基因组测序结果解读_SNP4月28日星期四20:00Page13联系我们微信QQ服

5、务热线4006004643

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