化学化工常用软件介绍

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1、主讲:谭世语重庆大学化学化工学院化学化工 常用软件介绍化学化工常用软件介绍本讲主要内容1.数据处理工具2.分子模拟计算软件3.辅助设计软件4.过程模拟软件5.虚拟仪器平台6.化工物性数据网站1数据处理工具1.1MATLABMATLAB是一种用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算的高级技术计算语言和交互式环境。MATLAB是矩阵实验室的简称,和Mathematica、Maple并称为三大数学软件。MATLAB是一种由美国MathWorks公司出品的商业数学软件,是一种数值计算环境和编程语言,主要包括MATLAB和Simulink两大部分。MATLAB可以进行矩阵运算

2、、绘制函数和数据图、实现算法、创建用户界面、连接其他编程语言的程序等,主要应用于工程计算、控制设计、信号处理与通讯、图像处理、信号检测等。MATLAB的基本数据单位是矩阵,它的指令表达式与数学,工程中常用的形式十分相似,可支持和调用C,FORTRAN,C++,JAVA。MATLAB窗口MATLAB的图形功能强大1.2OriginOrigin为OriginLab公司出品的较流行的专业函数绘图软件,是公认的简单易学、操作灵活、功能强大的软件,既可以满足一般用户的制图需要,也可以满足高级用户数据分析、函数拟合的需要。Origin具有两大主要功能:数据分析和绘图。Origin的数

3、据分析主要包括统计、信号处理、图像处理、峰值分析和曲线拟合等各种完善的数学分析功能。Origin的绘图是基于模板的绘图,它本身提供了几十种二维和三维绘图模板而且允许用户自己定制模板。用户可以自定义数学函数、图形样式和绘图模板;可以和各种数据库软件、办公软件、图像处理软件等方便的连接;可导入包括ASCII、Excel、pClamp在内的多种数据;可以把Origin图形输出到多种格式的图像文件,譬如JPEG、GIF、EPS、TIFF等等。Origin窗口Origin图形在Word中的编辑2分子模拟软件6.2.1HyperCam6.2.2ChemOffice6.2.3Gauss

4、ian6.2.4GAMESS2.1HyperCamHyperCam是一款以高质量,灵活易操作而闻名的分子模拟软件。通过利用3D对量子化学计算,分子力学及动力学进行模拟动画,HyperCam为您提供比其它Windows软件更多的模拟工具。图形界面,有半经验方法(AM1,PM3等),UHF,RHF和CI和7.0版新增加的密度泛函。可进行单点能,几何优化,分子轨道分析,预测可见-紫外光谱,蒙特卡罗和分子力学计算。功能包括:1.结构输入和对分子操作。2.显示分子。3.化学计算。用量子化学或经典势能曲面方法,进行单点、几何优化和过渡态寻找计算。可以进行的计算类型有:单点能,几何优化

5、,计算振动频率得到简正模式,过渡态寻找,分子动力学模拟Langevin动力学模拟,MetropolisMonteCarlo模拟。支持的计算方法有:从头计算,半经验方法,分子力学,混合计算。4.可以用来研究的分子特性有:同位素的相对稳定性;生成热;活化能;原子电荷;HOMO-LUMO能量间隔;电离势;电子亲和力;偶极矩;电子能级;MP2电子相关能;CI激发态能量;过渡态结构和能量;非键相互作用能;UV-VIS吸收谱;IR吸收谱;同位素对振动的影响;对结构特性的碰撞影响;团簇的稳定性。2.1HyperCam5.支持用户定制的外部程序。6.其它模块:RAYTRACE模块,RMS

6、Fit,SEQUENCE编辑器,晶体构造器;糖类构造器,构像搜寻,QSAR特性,脚本编辑器。7.新的力场方法:Amber2,Amber3,用于糖类的Amber,Amber94,Amber96。8.ESR谱(电子自旋共振)。9.电极化率。10.二维和三维势能图。11.蛋白质设计。12.电场。13.梯度的图形显示。14.新增功能:密度泛函理论(DFT)计算;NMR模拟;数据库;Charmm蛋白质模拟;半经验方法TNDO;磁场中分子计算;激发态几何优化;MP2相关结构优化;新的芳香环图;交互式参数控制;增强的聚合物构造功能;新增基组。HyperCam窗口2.2ChemOffic

7、eChemoffice分为功能不同的几个版本。其ChemOfficeUltra版本包含了:ChemDrawUltra(化学结构绘图)、Chem3DUltra(分子模型及仿真)和ChemFinderPro(化学信息搜寻整合系统)。此外还加入了E-NotebookUltra8.0,BioAssayPro8.0,量化软件MOPAC、Gaussian和GAMESS的界面,ChemSARServerExcel,CLogP,CombiChem/Excel等等,ChemOfficePro还包含了全套ChemInfo数据库,有ChemACX和

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