试述物理系毕业论文格式模板示例

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1、试述物理系毕业论文格式模板示例试述物理系毕业论文格式模板示例_导读：德州学院物电学院2014届物理学专业一毕业论文（毕业设计）二选Chignolin蛋白的高压变性研究（题目：小二号黑体加黑）王贞营（小四黑体）(德州学院物电学院，山东德州253023)（院系：五号黑体）摘要随着计算机模拟技术的发展，本文利用GROMACS软件，对Chignolin在2000bar和10000bar两个压强下进行的独立的分子动力学模拟，以揭示压强对蛋白质去折叠（变性）的影响并探讨其机理。通过分析模拟结果发现：Chignolin蛋白在高温

2、下RMSD最大时去折叠程度明显不同;小蛋白随着压强的增加其折叠与去折叠过程有一个反复阶段;高压下的蛋白质去折叠不是完全折叠;高压对Chignolin的构象影响较大，变性明显，甚至出现了完全去折叠的情况。关键词Chignolin；分子动力学模拟；去折叠；高压（“摘要”和“关键词”字样用五号黑体字，后空一格用五号宋体字单倍行距打印摘要内容，“摘要”两字中间空两空格，关键词用五号宋体，每个关键词后用“；”再空两格。摘要内容在200-300字之间，不分段。）1绪论（一级标题：小三号黑体，顶格写）（正文部分均用小四号宋体，1

3、.5倍行距）蛋白质是一切生命活动的主要物质基础，结构决定其功能。蛋白质折叠和去折叠问题是当前生物信息学、生物物理学等生命科学领域面临的一项长期而具有极其重要地位的课题。其重要任务之一便是通过施加外界驱动力（如温度，压强，机械力等）来致使蛋白质变性，通过研究其去折叠过程探索蛋白质的折叠和去折叠机制。近年来随着实验手段和计算机水平的不断提高，许多实验仪器和理论方法被用来研究蛋白质的折叠和去折叠过程。从实验上研究蛋白质高压去折叠存在着各种问题,如时间周期长，设备复杂、昂贵；且技术难度大等，无法在原子层次和飞秒分辨率下进行

4、研究。用计算机模拟的理论方法研究蛋白质的高压去折叠是实验研究的有利补充，可以在原子层次和很高的时间分辨率上研究实验无法实现的新现象，对实验研究有重要的指导作用。分子动力学模拟可以从原子水平和飞秒分辨率上研究蛋白质的高压去折叠，这一点目前实验上无法实现。目前对蛋白质折叠的研究采取的策略之一就是用加速去折叠过程来研究蛋白质的折叠问题。蛋白质去折叠可以通过诱导变性条件加速其进程，这样可以对蛋白质构象膨胀的早期阶段进行观察，而这种过程在一定程度上反映了蛋白质的折叠过程[1]。蛋白质高压去折叠（变性）的研究是当今蛋白质工程中

5、还未完全解决的一项重要内容。对温度导致去折叠过程已经进行了广泛的研究,而对压强导致蛋白质去折叠（变性）的研究相对较少，仅做了少量的模拟研究[1]。（页码居右下角）1德州学院物电学院2014届物理学专业一毕5678910试述物理系毕业论文格式模板示例_(2)导读：业论文（毕业设计）二选上角标[1]：表示试述物理系毕业论文格式模板示例_(3)导读：顿第二定律：Fimiaimiri（2-2）（重要公式的标注：同图标，以章节为基础，如：2-1、2-2、…等）这里的Fi是所有其它粒子作用到粒子i上的合力，这可以由N个粒子的位

6、能函数V的负梯度表示，即：VFiri（2-3）在笛卡尔座标中，可以用它的3个分量来表示。若Xi(t)是时刻t粒子i在x方向的座标。使用泰勒（Taylor）展开，我们可以得到：(t)tX(t)t2/2....Xi(tt)Xi(t)Xii(t)tX(t)t2/2....Xi(tt)Xi(t)Xii（2-4）（2-5）(t)和X(t)分别表示t时刻粒子i在方向的速度和加速度。其中X上述两式的方程是精ii确的，但是含有无限项。在实际中我们通常用Verlet方法进行近似求解。方法如下：将2-4和2-5两式分别相加和相减得到：

7、(t)t2Xi(tt)2Xi(t)Xi(tt)Xi（2-6）（页码居右下角）3德州学院物电学院2014届物理学专业一毕业论文（毕业设计）二选（2-7）f/mX(t)[X(tt)X(tt)]/2t其中：Xixiiiii由于在t和t-△t时刻，第i个粒子位置是知道的，加速度可以从位能函数的负梯度求出。所以以后任何时刻粒子的位置，速度和加速度都可迭代求解。这就是计算牛顿运动方程的Verlet方法。分子力学模型是从量子力学模型简化得到的。在分子力学模型中，每个粒子通常代表一个原子，有时也可以代表一个非极性基团，例如甲基基团

8、。从理论上来说，分子力学中体系的能量应该等于对同样的体系在量子力学分子力学模型是从量子力学模型简化得到的。通常体系的能量被经验性的划分为若干个能量项，每个能量项用一个简单的函数形式来表示。其一般的形式为EbondsK(bb)b0dihedrals2anglesK()02K(1cos(M))/2Rijr6ijimproperK(0)2ijAijr12ijijq