脆弱类杆菌荧光定量pcr法检测论文

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1、脆弱类杆菌荧光定量PCR法检测论文【关键词】脆弱类杆菌;荧光定量PCR;SYBR,Green,I摘要:目的探讨荧光定量PCR技术检测脆弱类杆菌。方法用特异性引物和荧光染料实时PCR扩增并检测产物。结果脆弱类杆菌标准株(ATCC25285)和4株分离株均有特异扩增曲线,灵敏度达102个菌;而大肠埃希菌、保加利亚乳杆菌、嗜热链球菌无特异扩增曲线。结论荧光染料实时PCR技术可特异并定量检测脆弱类杆菌关键词:脆弱类杆菌;荧光定量PCR;SYBRGreenIDetectionbacteriafragilebySYBRGreenreal-timePCRAbstract:Obje

2、ctiveToidentifythebacteriafragiles(B.fragiles)by16StargetrRNArealtimePCR.MethodsApairofspecificprimersePCR.ResultsTheB.fragilisATCC25285and4separativestrainsofB.fragilisappearedinthespecialamplificationproductcurve,ophilusdidnot.TheflourescentqantificativePCRcandetect102bacteria.Conclu

3、sion16SrRNAtargetedprimerandfluorescentquantifiverealtimePCRcanbeapplicablefortheidentificationandquantificationofB.fragilis.Keyp5700,美国Perkin-Elmer公司),离心机;细菌基因组提取试剂盒、ExTaqDNA聚合酶、10×缓冲液、SYBRPremixExTaqTM(perfectReal-time)荧光染料〔TakaRa宝生物工程(大连)有限公司〕。12方法121引物设计在16SrRNA序列中第831-864位点和982-10

4、07位点,通过分析软件Blast(ncbinlmnihgov)同GenBank中大肠埃希菌等基因序列相比较.freell,倍比稀释使每1μl提取液中含有107,106,105,104,103,102,10,1个细菌的DNA,进行荧光定量PCR。扩增产物的融解曲线用配套分析软件中的DissociationProtocol程序制图和分析。124SYBRGreenⅠ嵌和荧光染料实时PCR反应体系及条件10×Buffer(含SYBRGreen染料Mg2+dNTPTaq酶)5μl;正反向引物各02μl(10μmol);待检样品1μl,加水34μl混匀后,按95℃10s,95℃

5、5s,60℃34s,共进行40个循环。2结果21特异性PCR结果显示,5株脆弱类杆菌均有特异扩增曲线,而大肠埃希菌、保加利亚乳杆菌、嗜热链球菌无特异扩增曲线。22灵敏度(图1)图1可见,荧光信号强度(Rn)维持在基线(0对应的横线)上,15个循环后,Rn开始上升。107,106,105的扩增曲线在30个循环后到平台期,104,.freeluRinttil,etal.parisonofreal-timePCRicrobiology,2003,149:269-277.〔3〕卞广林,罗予.16SrRNAPCR鉴定脆弱类杆菌[J].生物技术通讯,2006,17(1):066

6、-067.〔4〕沈永才,袁佩娜.16SrRNA荧光PCR法检测双歧杆菌[J].中国微生态学杂志,2001,13(2):66-69,72.

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