《高能计算介绍》ppt课件

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1、高性能计算介绍什么是高性能计算?(HPC)1.高速运算2.大内存3.海量存储常见的高性能计算的实现1.多CPU共享内存结构（SGIAltix3000)2.集群(cluster)结构(联想计算集群）操作系统Unix,Linux,Windows并行开发软件MPI,OpenMPSGIAltix3700体系结构一系统模块1.Cbrick:32个1.3GHz/3MIntelItanium2cpu2.Mbrick:32G内存3.Rbrick：路由4.IXbrick：输入/输出5.Dbrick:硬盘扩展（连接1

2、T盘阵）二体系结构：NUMAflex全局共享内存的结构所有内存统一编址,全局共享本地与远端内存的存取速度不同优点：均衡的、可扩充的性能低延迟的内存访问适于HPC的优化的操作环境容易配置操作系统系统软件：64位LinuxAdvancedServer+SGIHPCProPack编译器：IntelC,C++,Fortran,MathKernelLibraryMPI并行OpenMP并行并行计算SGIHPC并行开发软件包：SGI®MPT™(MessagePassingToolkit)优化的MPI和SHMEM

3、并行编程库MPT在多个分区系统的性能和在SSI上一样，在跨节点时无性能损失SGI®NUMA工具集:包含指定cpu、内存的管理工具：cpuset,memset,dplaceSGI®集群软件(ArrayServices)定义和管理集群的配置,管理运行在集群上的作业集SGI®PerformanceCo-Pilot:图形化的性能监测工具SGI®FFIO:对特定I/O传输的控制SGI®科学函数库SCSL用户使用初步一:用户登录：在windows操作系统下：1.安装xmanager等软件模拟xwindows图

4、形化界面2.利用ssh-client软件远程登录在Linux系统下直接使用ssh命令登录二：上传下载文件：在windows操作系统下：利用ssh-client软件的sftp功能在Linux系统下直接使用sftp命令Linux基本命令：whoami>listsyourloginnamels>listsfilenamesinworkingdirectoryls-l>samelistwithadditionalinformationls-l

5、more>iflisttoolong;pagedown

6、withspacebarcpfile1file2>copiesfile1tofile2(NB:existsalready?)mvfile3file4>file3isrenamedfile4rmfile1>discardsfile1.Cleanupfromtimetotime.mkdirdir1>createsnewdirectorywithnamedir1mvfile2dir1/file2>movesfile2todirectorydir1mvfile2dir1/>doesprecis

7、elythesamecddir1>changeworkingdirectorytodir1cd..>goback(onebranchdownthetree)rmdirdir1>discarddir1(worksonlywhenempty)pwd>listspathtoworkingdirectoryps-ef>listofactivitiesofcomputerps-ef

8、more>iflististoolongefc-O2prog.f-oprog>seefile'Howto.txt

9、'fordetailsprog>output1>runprogramprog;outputinfile`output1'progoutput1>thesameusinginputfilenamed`input2'progoutput1&>thesame`inbackground'control-c>ifcursordoesnotreturn:killtask编译普通程序：1.howtocompileafortranprogram?efc-O2–tpp2you

10、rprog.f-oyourprog.out2.howtocompileaCprogram?ecc-O2-tpp2yourprog.c-oyourprog.out编译并行程序：1.openmpparalleledfortranprogramefc-O2-tpp2-fpp-openmpyourprog.f-oyourprog.out2.mpiparalleledfortranprogramefc-O2-tpp2yourprog.f-oyourprog.out-lmpi3.openmpp