大数据时代提高生物专业研究生科研创新实践能力教学改革探索

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1、为了确保“教学点数字教育资源全覆盖”项目设备正常使用，我校做到安装、教师培训同步进行。设备安装到位后，中心校组织各学点管理人员统一到县教师进修学校进行培训，熟悉系统的使用和维护。大数据时代提高生物专业研究生科研创新实践能力教学改革探索　　摘要：该文针对地方本科院校研究生生物信息学课程设置存在的一些问题，从教学内容、教学方式和考核方式等几方面提出对于该课程进行改革和建议，为培养具备创新实践能力的研究生人才提供参考。　　关键词：生物信息学；研究生；创新实践能力　　中图分类号文献标识码A文章编号1007--0140-02　　Abstract：Aimingatsomeproble

2、msoflocalcollegestudentsbioinformaticscoursesexist，fromtheaspectsofteachingcontent，teachingmethodsandassessmentmethods，suggestionsareputforwardforprovidingreferenceforthecurriculumreform，thetrainingofinnovativepracticeabilityofstudents.　　Keywords：Bioinformatics；Graduatestudent；Innovativep

3、racticeability为了充分发挥“教学点数字教育资源全覆盖”项目设备的作用，我们不仅把资源运用于课堂教学，还利用系统的特色栏目开展课外活动，对学生进行安全教育、健康教育、反邪教教育等丰富学生的课余文化生活。为了确保“教学点数字教育资源全覆盖”项目设备正常使用，我校做到安装、教师培训同步进行。设备安装到位后，中心校组织各学点管理人员统一到县教师进修学校进行培训，熟悉系统的使用和维护。　　生物信息学是20世纪80年代未随着人类基因组计划的启动而兴起的一门新的交叉学科[1]。它涉及生物学、数学、计算机科学和工程学，依赖于计算机科学、工程学和应用数学的基础，依赖于生物实验

4、和衍生数据的大量储存。生物信息学是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，是多学科之间的交叉领域。随着基因组学的不断深入研究和高通量测序数据的大量涌现，生命科学已经进入到大数据时代，基因组、转录组、蛋白质组以及代谢组等生物信息数据正呈爆炸性增长[2-3]。在大数据背景下运用生物信息学技术来分析数据并解决实际问题显得尤为重要，这就需要越来越多的生物信息学人才，尤其是研究生来参与这项工作。本文以提高研究生创新实践能力为角度，结合生物大数据时代的特点，针对目前生物类专业研究生生物信息学教学中存在的问题提出自己的建议和方法，供大家借鉴。　　1《生物信息学》课程中存在的问题　　目

5、前，我国大多数高校都在研究生阶段开设了《生物信息学》课程，通过对大多数院校调查发现该门课程开设过程中存在以下问题：生物类研究生本科背景存在一定差异，部分学生在本科高年级阶段就已经学过《生物信息学》这门课程，有些学生没有学过该门课程，但是具有相关分子生物学基础知识；还有一部分跨专业学生没有相关课程基础。教材相对滞后，由于网络时代发展和数据更新速度太快，导致书籍印刷时一些网址和软件介绍就已经落后，无法满足教学要求。教师教学方式还是以填鸭式为主，于本科教学方式毫无差异。课程上机实践学时较少，学生难以理解和消化所学内容，实际解决问题的能力较差。因此，有必要结合本校实际情况对研究生

6、《生物信息学》课程进行改革，提高研究生的科研创新能力和实践能力。为了充分发挥“教学点数字教育资源全覆盖”项目设备的作用，我们不仅把资源运用于课堂教学，还利用系统的特色栏目开展课外活动，对学生进行安全教育、健康教育、反邪教教育等丰富学生的课余文化生活。为了确保“教学点数字教育资源全覆盖”项目设备正常使用，我校做到安装、教师培训同步进行。设备安装到位后，中心校组织各学点管理人员统一到县教师进修学校进行培训，熟悉系统的使用和维护。　　2改革《生物信息学》教学模式，提高研究生创新实践能力　　教学内容设置改革教师可以参考不同的教材和网络最新软件使用方法，精心设计教学内容，可以按照3

7、个模块完成《生物信息学》教学安排。第一个模块为基础知识和基础软件使用方法介绍，包括生物信息学发展历史介绍、常用数据库检索、引物设计、核酸和蛋白质序列分析、分子进化和RNA分析等。第二个模块为生物信息学实例应用，可以包括对某个基因序列从下载到设计引物再到功能预测，或者对某个蛋白质进行理化性质、跨膜区、二级结构和三级结构的预测和分析等练习。第三个模块为生物信息学前沿课题介绍，包括最新的转录组和代谢组分析方面的知识。并且针对生物专业背景研究生要减少程序和算法的讲解，而以实际操作讲解为主。同时，教师还要考虑不同背景的学生学习能力的差异