砂梨核心种质ssr标准指纹图谱构建

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1、砂梨核心种质SSR标准指纹图谱构建　　摘要：砂梨[Pyruspyrifolia（Burm.f.）Nakai]一般为二倍体植物，染色体基数为17，从分布在砂梨17条不同的染色体上的60对简单序列重复标记（Simplesequencerepeats，SSR）引物中筛选出分别位于17条染色体的17对多态性引物对97份砂梨核心种质进行扩增，共检测到等位基因276个，每对引物检测到的等位基因数在8～26个，平均为16.4个，表明所选引物具有较高的鉴别力。多态信息含量指数（PIC）变幅为0.670（CH03d12）～0.926（CH0

2、3d02），平均为0.817，显示出较高的多态性信息，表明砂梨核心种质蕴含有极为丰富的遗传多样性，具有极高的代表性。试验建立起一套基于SSR分子标记的引物组合与鉴定体系标准，通过反映不同染色体上的遗传信息，在同一平台上可以同时将数百份甚至上千份的品种资源区分开来，这对梨科研、教学及生产中的资源收集保存、品种鉴别、品种权保护具有十分重要的意义。　　关键词：砂梨[Pyruspyrifolia（Burm.f.）Nakai]；核心种质；简单序列重复标记；指纹图谱　　中图分类号：S661.2文献标识码：A文章编号：0439-8114

3、（2015）24-6284-06　　DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.24.048　　Abstract：17primerpairswithclearpolymorphicbandswereselectedfrom60pairsofSimplesequencerepeats（SSR）locusthat7covering17linkagegroupsofPyruspyrifolia（Burm.f.）Nakaigeneticmap，andwerethenamplifiedin97var

4、ietiesofP.pyrifoliacorecollection.Atotalof276polymorphicbandswereobtainedwith8to26bandsperprimerlocus（averaging16.4bands）.Thepolymerphisminformationcontent（PIC）ofthe17SSRlocirangedfrom0.670to0.926withanaverageof0.817，whichshowabundantgeneticpolymorphisminP.pyrifol

5、iacorecollections.ResultsfromthesestandardsetsofSSRsarepresentedandcanbeusedtofacilitatecomparisonofdatasetsfromdifferentgermplasmcollectionstodetectduplicatesandsynonyms.　　Keywords：Pyruspyrifolia（Burm.f.）Nakai；corecollections；simplesequencerepeats；fingerprint　　关于

6、种质资源的指纹图谱或分子身份证构建是当前资源鉴定评价研究的热点之一。国际植物品种权保护联盟（UPOV）已将DNA分子标记鉴定纳入农作物品种DUS（Distinctness，uniformity，stability）测试内容，并在BMT测试指南草案中将构建DNA指纹数据库的标记方法确定为简单序列重复标记（Simplesequencerepeats，SSR）和单核苷酸多态性（Singlenucleotidepolymorphism，SNP）。而SSR标记因具有多态性高、重复性好、共显性遗传和易于检测等优点，已被UPOV7生物化

7、学和分子技术工作组验证为植物新品种保护最广泛应用的标记体系[1]。SSR分子标记已经被广泛用于包括果树在内的各种作物指纹图谱构建研究。然而，一个普遍存在的问题是由于不同的资源保存单位所保存的相同种质资源常常由于彼此研究所使用的鉴定体系或引物组合不同而难以相互比较，这使得其资源圃中存在的同物异名、同名异物等问题的种质难以得到准确鉴定和发现，这给种质资源的利用带来一定风险。因此，建立一套标准的SSR引物组合和鉴定方法将会有助于解决这一难题。　　国家果树种质武昌砂梨圃多年来一直致力于砂梨[Pyruspyrifolia（Burm.

8、f.）Nakai]种质资源的收集保存、鉴定评价、提供利用等工作。目前共收集保存砂梨资源800余份，并已经开展核心种质构建工作[2]。试验拟建立一套基于SSR分子标记的引物组合和鉴定体系标准，并将砂梨核心种质的参考指纹图谱作为种质资源保护的依据，同时也为不同研究单位的砂梨种质鉴定等研究提供方便。　　1材料