胃癌lkf6、cdx2基因遗传不稳定和甲基化及蛋白表达关系

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时间:2019-02-01

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1、杭州师范大学硕士学位论文胃癌KLF6、CD)【2基因遗传不稳定与甲基化及蛋白表达的关系研究目的摘要研究KLF6基因KLF6M1、KLF6M2、KLF6M4、D10S1716位点和CDX2基因D13S220位点的微卫星不稳定性(microsatelliteinstablility,MSI)和杂合性缺失(10ssofheterozygosity,LOH)、KLF6基因在胃癌组织和SGC-7901细胞系中启动子区域甲基化水平对其蛋白表达的影响,阐明KLF6基因遗传不稳定性、启动子区域甲基化与胃癌肿瘤进展的关系,为揭示抑癌基因作用机制和肿瘤发生发展机制,提供实验依据。研究方

2、法(1)苯酚一氯仿抽提法,提取冰冻的胃癌组织和SGC-7901细胞系基因组DNA。(2)PCR一单链构象多态性(Single—StrandConformationPolymorphism,SSCP)、常规银染检测位点的遗传不稳定性。(3)WesternBlot检测蛋白表达。(4)甲基化特异性PCR检测启动子区域甲基化水平。(5)SPSS16.0软件统计分析相关性。研究结果(1)胃癌KLF6基因微卫星位点LOH的检出率为24.49%(12/49),与胃癌分化程度、浆膜浸润和临床TNM分期无相关性,但与淋巴转移密切相关(P

3、0.77%(12/39)明显高于无淋巴结转移组的0.00%(0/10)。MSI检出率为16.32%(8/49),MSI与胃癌的分化程度、浆膜浸润程度、淋巴转移和临床TNM分期均无相关性。在胃癌组织中,KLF6的表达缺失率分别为47.83%(22/46),在癌旁组织中的表达缺失率仅为4.35%(2/46)。KLF6在91.30%(42/46)的胃癌组织中表达较对应正常组织下降,且下降50%以上。49例胃癌组织甲基化频率为81.63%,癌旁正常对照组织甲基化频率为75.51%,无统计学差异(P>O.05)。SGC一7901细胞株中KLF6启动子处于异常高甲基化状态,经过

4、5’.Aza.CdR处理96h后高甲基化的启动子呈去甲基化状态。经过5'-Aza.CdR处理24h后,KLF6蛋白表达增加,且表达强度呈时间依赖关系。杭州师范大学硕士学位论文胃癌KLF6、CDX2基因遗传不稳定与甲基化及蛋白表达的关系(2)胃癌CDX2基因D13S220位点MSI发生率为8.00%,LOH发生率为18.00%,而LOH的检出率与胃癌分化程度负相关,与淋巴转移正相关,且随着肿瘤TNM分期的增加而降低,但与浆膜浸润、TNM分期无相关性。结论KLF6基因LOH的发生率与与淋巴转移正相关。KLF6基因LOH多发生于有淋巴结转移的胃癌,可作为胃癌组织恶变、预后

5、转归的的判断指标之一。在胃癌组织中存在KLF6的明显缺失,5'-Aza—CdR能较好地逆转胃癌细胞SGC-7901的DNA高甲基化,诱导该基因的表达。在胃癌组织中KLF6基因启动子区域存在高甲基化,提示CpG岛高甲基化在胃癌的早期阶段己存在,可能是胃癌发生的因素之一。所以KLF6可能是胃癌发生的重要相关抑癌基因。CDX2基因D13S220位点LOH的发生率与分化程度负相关,与淋巴转移正相关。D13S220位点LOH多发生于中低分化程度和有淋巴结转移的胃癌,可作为胃癌组织恶变、预后转归的的判断指标之一。D13S220位点的LOH可以调控胃癌的发生、进展,LOH可能是C

6、DX2基因失活的重要机制。关键词:胃癌;KLF6;CDX2;遗传不稳定性;甲基化;Westernblot杭州师范大学硕士学位论文胃癌KLF6、CDX2基因遗传不稳定与甲基化及蛋白表达的关系objectiveABSTRACTToinvestigateMSIandLOHoflocusKLF6M1、KLF6M2、KLF6M4、D10S1716ofKLF6gene,D13S220ofCDX2geneanddetectthemethylationstatusofKFL6geneandtheexpressionofproteiningastriccancertissuesand

7、SGC一7901cells,whichwouldrevealthefunctionmechanismofanti—oncogeneandprovideexperimentalbasisformetastasismechanismofcancer.Methods(1)Phenol-chloroformmethodforextractingDNAfromfrozengastriccarcinomatissuesandSGC-7901cells.(2)Polymerasechainreaction—singlestrandconformationpolymorphis

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