优质鸡肉质性状相关分子标记的筛选

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1、摘要鸡肉品质是当今养禽业和食品加工行业共同关注的课题。鸡肉的脂肪和嫩度是衡量鸡肉质风味和口感的重要指标，从分子生物学和遗传学角度出发，探讨影响鸡肉肉品质的候选基因，寻找肉质性状的分子标记，将成为改善肉品质的有效途径。本研究以过氧化物酶体增殖蛋白激活受体γ（PPARγ）基因为脂肪的候选基因，以钙蛋白酶1（CAPN1）为嫩度的候选基因，以D2系和矮油系鸡群体为研究材料，对其编码区和部分调控区进行SNPs研究，寻找可作为鸡肉脂肪和嫩度的重要标记，为加速改善鸡肉肉质性状奠定理论基础。全文包括两个试验：试

2、验一：筛选鸡肉脂肪和嫩度相关的分子标记，以D2系公母鸡及矮油系母鸡共380个体为实验素材，利用PCR和DNA测序的方法对PPARγ和CAPN1基因编码区和部分调控区的序列进行多态位点检测，结果共检测到18个SNPs，通过质谱SNP分型技术及关联分析，在D2系中发现位点C1589217T、C1589482T、C1589921T与鸡腹脂重显著相关（P＜0.05），由这三个位点组成的单倍型块与腹脂重呈显著相关（P＜0.05）。所以这三个位点及由这三个位点组成的单倍型块可作为D2系腹脂重的有效分子标记。

3、在D2系和矮油系母鸡研究中发现有位点C13719531T、A13719824G与腹脂率和剪切力呈显著相关（P＜0.05）。由这两个位点组成的单倍型块与腹脂率及剪切力呈显著相关（P＜0.05）。所以这两位点及由这两个位点组成的单倍型块可作为D2系和矮油系腹脂率和剪切力的有效分子标记。试验二：筛选优质鸡体脂分布的有效评价指标。通过测定和分析鸡脂肪在体内不X同部位的沉积情况，结果表明：不同品系母鸡皮脂率、腹脂率、IMF含量差异显著X（P＜0.05），其中腹脂率/IMF值与腹脂率及皮脂率均呈显著正相关（

4、P＜0.05），与XIMF呈极显著负相关（P＜0.01）,说明这一指标能够在一定程度上同时反映脂肪在X腹部、肌内和皮下的分布状况。因此，腹脂率/IMF值可作为一个有效且实用的指标来衡量优质鸡的体脂分布，即作为优质鸡品系选育及杂交选育的评价指标之一。关键词：鸡；肉质性状；PPARγ；CAPN1；SNP；单倍型InvestigationofMolecularMarkersLinkedtomeatqualityCharactersofchickenAbstractTodaychickenquality

5、hasbecomeanattentiontopicforbothfoodindustryandanimalhusbandry.Chickenfatcharactersandtendernessareimportantfactorstoevaluatechickenflavorandtaste.Itwillbeaneffectivewaytoimprovechickenqualitytofindoutthecandidategenesandmolecularmarkersfrommolecular

6、biologyandgeneticsaspects.Inthisstudy,weusePPARgammaandCAPN1genesasfattraitsandtendernesscandidategenesrespectively,andD2andBeijingYoupygmychickenbreedsasmaterials,doSNPsstudyoncodingregionandtranscriptionregulationdomain,lookforfeasiblemarkersinflue

7、ncingchickenfatandtendernesscharacters,inordertoestablishatheoreticalfoundationforimprovingchickenquality.Therearetwoteststhisworkincluded:Test1:Screeningmolecularmarkersrelatedtofatandtenderness.Threehundredandeightyoftwochickenbreeds(D2breedandBeij

8、ingYoupygmychicken)wereused,multi-siteandsequencingtestofPPARγandCAPN1codingregionshowedthatatotalof18SNPswereidentifiedwhenitwasappliedtoDNAdirectsequencingandPCRapproach.ItwasfoundthroughMSSNPtypingtechnologyandcorrelationanalysisininvestigationtha