基于生活污水监测的诺如病毒分子流行病学研究

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1、病毒学报ChineseJournalofVirologyISSN1000-8721,CN11-1865/R《病毒学报》网络首发论文题目：基于生活污水监测的诺如病毒分子流行病学研究作者：刘姗姗，陶泽新，王素婷，周楠，林小娟，宋艳艳，徐爱强DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003356收稿日期：2018-01-16网络首发日期：2018-04-08引用格式：刘姗姗，陶泽新，王素婷，周楠，林小娟，宋艳艳，徐爱强．基于生活污水监测的诺如病毒分子流行病学研究．病毒学报.https://doi.org/1

2、0.13242/j.cnki.bingduxuebao.003356网络首发：在编辑部工作流程中，稿件从录用到出版要经历录用定稿、排版定稿、整期汇编定稿等阶段。录用定稿指内容已经确定，且通过同行评议、主编终审同意刊用的稿件。排版定稿指录用定稿按照期刊特定版式（包括网络呈现版式）排版后的稿件，可暂不确定出版年、卷、期和页码。整期汇编定稿指出版年、卷、期、页码均已确定的印刷或数字出版的整期汇编稿件。录用定稿网络首发稿件内容必须符合《出版管理条例》和《期刊出版管理规定》的有关规定；学术研究成果具有创新性、科学性和先进性，符合编辑部

3、对刊文的录用要求，不存在学术不端行为及其他侵权行为；稿件内容应基本符合国家有关书刊编辑、出版的技术标准，正确使用和统一规范语言文字、符号、数字、外文字母、法定计量单位及地图标注等。为确保录用定稿网络首发的严肃性，录用定稿一经发布，不得修改论文题目、作者、机构名称和学术内容，只可基于编辑规范进行少量文字的修改。出版确认：纸质期刊编辑部通过与《中国学术期刊（光盘版）》电子杂志社有限公司签约，在《中国学术期刊（网络版）》出版传播平台上创办与纸质期刊内容一致的网络版，以单篇或整期出版形式，在印刷出版之前刊发论文的录用定稿、排版定稿、

4、整期汇编定稿。因为《中国学术期刊（网络版）》是国家新闻出版广电总局批准的网络连续型出版物（ISSN2096-4188，CN11-6037/Z），所以签约期刊的网络版上网络首发论文视为正式出版。DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003356网络首发时间：2018-04-0813:23:00网络首发地址：http://kns.cnki.net/kcms/detail/11.1865.R.20180406.1825.008.html病毒学报CHINESEJOURNALOFVIROLOGY基于生活污水

5、监测的诺如病毒分子流行病学研究122121*1，2*刘姗姗，陶泽新，王素婷，周楠，林小娟，宋艳艳，徐爱强（1.山东大学公共卫生学院，济南250012；2.山东省疾病预防控制中心山东大学预防医学研究院山东省传染病预防控制重点实验室，济南250014）摘要：为了解生活污水中诺如病毒（Norovirus，NoV）检出情况、基因型分布和分子流行病学特征，进一步探索环境监测技术用于研究病毒性胃肠炎病原区域性流行的必要性，本研究于2016年1~12月在山东省济南和临沂两地采集生活污水，通过阴离子膜吸附洗脱法对收集到的24份污水样品进行浓

6、缩后，提取核酸，经过逆转录-聚合酶链反应扩增NoVVP1基因片段，经TA克隆后测序，进行分型和系统进化树分析。结果显示，监测地区生活污水标本中GI的检出率为100%，GII为95.8%。共获得412条NoV序列，分别属于6个GI基因型和8个GII基因型，其中GI.6（32.3%，133/412）、GII.3（14.1%，58/412）和GII.17（25.7%，106/412）检出数量最多。GII.17检出序列均属于Ka⁃wasaki308变异株，而前些年大流行的GII.4的检出序列占比仅1.0%，属于Sydney2012变

7、异株。本研究描述了2016年山东省本地流行的诺如病毒基因型分布和序列特征，证明了可以通过对城市污水进行监测来探索人群中循环的诺如病毒的遗传多样性。关键词：诺如病毒；急性胃肠炎；分子流行病学；环境监测中图分类号：R373.2文献标识码：A诺如病毒（Norovirus，NoV），属于人类杯状病系统报告，在2012~2016年间我国24个省96个城毒科（HumanCalicivirus，HuCV）诺如病毒属，于市共发生313次由NoV引起的暴发事件，其中2016［3］1972年通过免疫电镜技术首次在美国俄亥俄州诺年NoV暴发109

8、次。由于NoV无症状携带者和瓦克地区暴发的流行性腹泻疫情中发现，是首个被不选择就医的轻症患者较多，所以临床病例的监测［1］数据不能完全反映病原真正的流行病学特征，生活确认的引起人类急性胃肠炎的病毒。NoV基因组为单股正链RNA，全长约7.5kb，分为三个开放阅污水中检测到的NoV序列和人群