金华猪遗传结构及其与太湖猪遗传分化的研究

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1、生物多样性2008,16(4):339–345doi:10.3724/SP.J.1003.2008.07399BiodiversitySciencehttp://www.biodiversity-science.net金华猪遗传结构及其与太湖猪遗传分化的研究111*22赵晓枫吴俊红徐宁迎胡晓湘李宁1(浙江大学动物科学学院,杭州310029)2(中国农业大学农业与生物技术国家重点实验室,北京100094)摘要:本研究利用65个微卫星标记结合荧光标记检测技术,对金华猪I系、II系、III系共271个个体以及嘉兴黑猪、中梅山猪、小梅山猪和二花脸猪等

2、4个太湖猪品种和嵊县花猪各30头的基因型进行了检测,统计分析了金华猪各品系的遗传结构及各猪种群间的遗传分化。结果显示:金华猪品系间具有丰富的遗传变异,平均有效等位基因数以金华猪I系最高,为3.5;其次是II系和III系,分别是2.8和2.5,金华猪3个品系的平均多态信息含量均高于0.5;I、II、III系的平均观察杂合度分别是0.381、0.399和0.442。金华猪3个品系偏离Hardy-Weinberg平衡的程度不一:I系偏离较大,III系次之,II系相对较小。分析认为金华猪各品系存在一定程度的近交,品系间存在不同的等位基因。遗传分化结果

3、显示:金华猪II系和III系间遗传分化相对较小(FST=0.1883),但它们与I系间的遗传分化较大,FST值分别是0.3663和0.3619。同时,金华猪各品系与太湖猪的遗传关系较近,其中与中梅山猪群体遗传分化相对较小,FST值分别为0.3581、0.3560和0.3572。而金华猪各品系与嵊县花猪的遗传分化最大,FST值分别为0.4499,0.4654和0.4801,由此可见,金华猪不同于其他浙江省地方品种,有着独立的起源和驯化进程。关键词:金华猪,微卫星,多态信息含量,杂合度,遗传多样性GeneticstructureofJinhuap

4、igandgeneticdifferentiationofJinhuapigandTaihupigbreedsbasedonmicrosatelliteDNAmarkers111*22XiaofengZhao,JunhongWu,NingyingXu,XiaoxiangHu,NingLi1CollegeofAnimalScience,ZhejiangUniversity,Hangzhou3100292StateKeyLaboratoryforAgrobiotechnology,ChinaAgricultureUniversity,Beijin

5、g100094Abstract:ThegenotypesofJinhua(linesI,II,andIII),Shengxianhua,andfourTaihupigs(JiaxingBlack,MiddleMeishan,SmallMeishan,Erhualian)wereinvestigatedusing65microsatelliteDNAmarkersthroughfluorescencePCR.OurobjectivesweretoinvestigatethegeneticstructurewithinJinhuapigsaswe

6、llasge-neticdifferentiationofJinhuapigsfromtheotherfivebreeds.WefoundalargerangeofgeneticvariationinJinhuapigs.LineIhadthehighestaveragenumberofeffectivealleles(Ne=3.5),followedbyLineII(Ne=2.8),andLineIII(Ne=2.5).Theaveragepolymorphisminformationcontent(PIC)ineachlinewasabo

7、ve0.5,withanaverageobservedheterozygosityof0.381,0.399,and0.442,inlinesI,II,andIII,respectively.Furthermore,adecreasingnumberofmicrosatellitelocithatdeviatedfromHardy-WeinbergequilibriumwerefoundinlinesI,III,andII,respectively.InbreedinghasoccurredtosomeextentineachoftheJin

8、hualines.AnalysesshowedthatdifferentiationbetweenJinhualinesIIIandIIwasrelativelys

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