长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析

《长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。

1、动物学研究2009，Feb.30(1)：1–10CN53-1040/QISSN0254-5853ZoologicalResearchDOI：10.3724/SP.J.1141.2009.01001长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析***刘至治，杨金权，王正琦，唐文乔（上海海洋大学鱼类研究室，水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室，上海200090）摘要：应用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术及细胞色素b（Cytｂ）基因序列，分析了长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼（Boleophthalmuspecinirostris

2、）群体遗传结构及种群历史，结果显示这一区域大弹涂鱼群体的遗传多样性水平很高。（1）RAPD分析结果：从100个10碱基随机引物中筛选出30个多态性引物，对长江口九段沙湿地、浙江舟山定海、福建霞浦群体各20个体进行RAPD分析，3个群体分别获得236、270、274条带，共301个有效位点。3群体多态位点比例（P）、Nei基因多样性指数（H）、Shannon多样性指数（I）分别在93.02%—96.35%、0.3890—0.4219、0.5618—0.6044。分子方差分析（AMOVA）表明，大弹涂鱼群体间存在显著的遗传分化（Fst=0.0

3、3004-0.03254，P<0.05），但仅3.2%的遗传变异来自群体间。（2）Cytｂ基因序列分析结果：从采自九段沙、定海、霞浦及浙江慈溪的42尾大弹涂鱼样本中，共获得33个Cytｂ基因单倍型（序列长1141bp）。4群体的平均单倍型多样性（h）、核甘酸多样性（π）分别为0.9814、0.0048。4群体间的遗传分化指数Fst为0.00043—0.07814，仅1.93%的变异来自群体间（AMOVA分析），而基因交流值却达14.50—30.79，群体间K2-P遗传距离为0.0040—0.0056，从而显示大弹涂鱼群体间没有发生明显的地

4、理分化。以Cytb基因序列构建的NJ树揭示4个群体的个体组成2个谱系，但这2个谱系与地理分布并不相关。中性检验、错配分析和网络亲缘关系分析皆表明大弹涂鱼群体有过种群扩张，扩张时间约在更新世末期的0.057—0.023百万年前。关键词：大弹涂鱼；细胞色素b；RAPD，种群遗传结构；长江口中图分类号：Q959.483;Q349文章标识码：A文章编号：0254-5853（2009）01-0001-010GeneticStructureandPopulationHistoryofBeleophthalmuspetinirostrisinYangt

5、zeRiverEstuaryandItsSouthernAdjacentRegions***LIUZhi-zhi,YANGJin-quan,WANGZheng-qi,TANGWen-qiao(LaboratoryofFishes,ShanghaiOceanUniversity;KeyLaboratoryofExplorationandUtilizationofAquaticGeneticResources,MinistryofEducation,Shanghai200090,China)Abstract:Inordertoanalysis

6、thegeneticstructureanddemographichistoryofBoleophthalmuspectinirostris,therandomamplifiedpolymorphicDNA(RAPD)technologyandmitochondrialcytochromeb(Cytb)genesequenceswereusedinthestudy.TheresultsshowedthattherewashighlevelgeneticdiversityinthepopulationsofB.pecinirostrisin

7、YangtzeRiverestuaryanditssouthernwet-landadjacentregions.(1)RAPDwasconductedtoanalysisthegeneticvariationofB.pecinirostrisinJiuduansha(JDS),Dinghai（DH）andXiapu（XP）for20individualsperpopulation,with30polymorphic10-basedrandomprimersselectedfrom100ones.Intotal,236,270and274

8、bandswereobtainedforJDS,DHandXP,respectivelyandtherewas301usefulloci.Therangeofproportionofpolym