镜鲤肝脏、前肠及后肠三个不同组织sod酶的qtl定位

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1、学校代码：10264研究生学号：M090101102上上海海海海洋洋大大学学硕士学位论文硕士学位论文镜鲤肝脏、前肠及后肠三个不同组织题目：SOD酶的QTL定位StudiesonQuantitativeTraitLocirelated英文题目：toSuperoxideDismutaseinMirrorCarp(CyprinuscarpioL.)专业：水产养殖研究方向：鱼类遗传育种姓名：徐玉兰指导教师：孙效文二O一二年五月二十五日I上海海洋大学硕士学位论文上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是

2、本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编

3、本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月II上海海洋大学硕士学位论文镜鲤肝脏、前肠及后肠三个不同组织SOD酶的QTL定位摘要鲤鱼是我国淡水鱼类中分布最广的鱼类之一。镜鲤作为鲤鱼的一个品种，由于其生长快、抗病强、高的肌肉转化率和非常少的鳞被数而在水产业中占有越来越大的比重。本研究以随机选取来源于不同家系的且表型性状有明显差异的镜鲤为父母本，将其产生的F1代作为作图群体。利用992个具有多态性的微卫星标记对192个个体进行个体的基因型分析，构建遗传连锁图谱，QTL定位以

4、及最后与斑马鱼基因组进行比对，其结果如下：（1）F1代190个个体在孵化后400天对其超氧化物歧化酶（SOD）性状进行表型值测量。结果表明其SOD活性在肝脏、前肠和后肠中其平均值分别为179.56±5.49,27.51±0.81和50.61±1.31U，并利用SPSS13.0软件对其进行正态分布检测。（2）用JionMap4.0软件共构建出了51个高密度连锁群。该连锁群所覆盖的总的重组距离为5183.9cM，标记之间的平均图距为5.226cM。最大的同时也是分辨率最低的连锁群为51号连锁群即LG51,它由9个微卫星标记组成，连锁群长度为148.

5、8cM，平均图距为16.53cM；最短的连锁群为LG9，它由10个标记组成，连锁群长度为42.2cM；分辨率最大的连锁群为LG1，它由40个标记构成，长度为72.4cM，平均图距为1.81cM。（3）使用MapQTL6.0软件中的复合区间作图法对该群体的肝、前肠、后肠三个不同组织中的超氧化物歧化酶（SOD）活量进行数量性状定位（QTL），结果显示：1）在肝脏中共检测出了7个影响SOD性状的显著性区间(P<0.05)。在LG2的一个QTL区间为HLJ3794-HLJ3663,且该区间大小为7.6cM，可解释的的表型变异率为10.4%。在LG8的一

6、个QTL区间为HLJ1244-HLJ1897,且该区间大小为9.4cM，可解释的的表型变异率为8.3-18.5%。在LG23共检测到3个显著性QTL区间，其分别为HLJ3022-HLJ2217,HLJ2218-HLJ3387,HLJ2108-HLJE27，其区间大小分别为3.9cM，4.6cM,4.0cM,可解释的的表型变异率为8.1-12.4%。在LG49中中共检测到2个显著性区间，分别为CA227-HLJ3369,CA2238-HLJ2463,其大小分别为4.1和5.1cM，可解释的遗传变异率范围是10.9-12.6%。III上海海洋大学硕

7、士学位论文2）在前肠组织中共检测到5个影响SOD性状的显著性QTL区间(P<0.05)。在LG8的一个QTL区间为HLJ1897-E623,且该区间大小为4.4cM，可解释的的表型变异率为7.3-8.7%%。在LG10的一个QTL区间为HLJ1690-HLJ1147,且该区间大小为7.8cM，可解释的的表型变异率为7.9-10.9%。在LG14的一个QTL区间为CA2152-CA2299，该区间大小为2.97，可解释的表型变异率为6.9-8.8%。在LG36中共检测到2个显著性区间，分别为CA1873-HLJ3751,CA1623-HLJ345

8、1,其大小分别为9.6和5.0cM，可解释的遗传变异率范围是8.0-11.1%。3）在后肠组织中共检测到6个影响SOD性状的显著性QTL区间(P<0.