中国汉族人群umodl1基因多态性与高度近视的关联研究

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1、浙江大学博士学位论文中国汉族人群UMODL1基因多态性与高度近视的关联研究姓名：朱苗苗申请学位级别：博士专业：眼科学指导教师：顾扬顺20120517浙江大学博士学位论文中文摘要中国汉族人群聊舭J基因多态性与高度近视的关联研究浙江大学医学院博士研究生导师中文摘要眼科学朱苗苗顾扬顺目的：基于日本全基因组关联分析研究结果，选择新候选基因【功抑D￡，为目的基因，研究该基因单核苷酸多态性与中国汉族人群高度近视的关联性，进而为研究近视的发病机制奠定基础。材料和方法：采用病例．对照关联分析方法，共收集2组研究对象，其中组l含356名高度近视(双眼近视屈光度>．8．00D)和356名正常对照(双

2、眼屈光度在±1．00D之间)个体；组2含526名高度近视和394名正常对照个体。两组研究对象入选标准相同．所有样本提取全血DNA．应用HapMap数据库在研究区域内选取59个标签SNP，进行初步关联分析研究。采用多引物延伸结合MALDI．TOFMS、PCR-I江LP、PE．DHPLC技术检测基因型。运用SPSS软件进行研究对象的基本数据和眼部参数分析；运用Plink软件进行单个SNP在5种遗传模式(等位基因、基因型、加性、显性、隐性)下与高度近视的关联分析；运用Haploview、PliIll【、Be砷e软件分别进行基于连锁不平衡模型、滑动窗口模型、局部单体型簇模型的单体型关联分

3、析；采用10000次的置换检验进行多重检验矫正。初步关联组研究的阳性结果进行后续的扩大样本量研究(组2)，共检测了4个标签sNP(rs220168、rS220170，瑙1191127l和rS3819142)。第二表型关联分析采用SPI也G2．O程序进行，结果经FDR多重检验矫正。最后，进行荟萃分析综合评价本研究及相关研究。Ⅱ浙江大学博士学位论文中文摘要结果：初步关联研究(组1)显示，57个SNPs的单个SNP等位基因或基因型频率与高度近视均无显著关联性。另有2个sNPS(rSl571737、rs220279)因不处于Hardy．Weinbe唱平衡而未被纳入分析．基于局部单体型簇的

4、单体型分析显示由SNPsrs220168_rS220170．rsll91127l组成的单体型GCT与超高度近视(近视屈光度≥．12．00D)存在关联性(严0．0015，OR：3．78)。这3个SNP以及与其在同一个LD内的非同义鲫婵rs3819142被纳入扩大样本量关联研究(组2)。扩大样本量关联研究显示，sNPrs3819142与超高度近视组(近视屈光度>．10．00D)存在关联性(尸=o．002l，矫正卢o．0168)。然而该关联性在合并组(组l与组2)研究中不能被重复验证。第二表型关联研究显示sNPrs220120的c等位基因与前房深度之间存在关联性(P=0．001，矫正尸

5、==0．046)，回归系数为．O．066(95％CI：．0．104～一0．027)。当高度近视标准设为≥．10．00D时，该关联性信号加强(P：0．0003，矫正P=0．019)。结论：中国汉族人群聊龇J『基因及其上下游3Kb区域单核苷酸多态性与高度近视无显著关联性。但与前房深度相关联，该结果还需覆盖其他种族人群的研究来进一步确认。关键词：高度近视；(胁抑D己J基因；单核苷酸多态性；单体型；关联分析；第二表型分析ⅡI浙江大学博上学位论文英文摘要AssociationStudyofUM眦JGenePolymorphismswithHighMyopiainaHanChinesePop

6、ulationDepanrnentofOphmalmolo鼢SchoolofMedicine，ZhejiangUrniVers毋Ph．D．C2uldidate：ZhuMiaomiaoSupervisor：GuⅥmgshunAbstractPurpose：Thel瑚胁odulin—like1((脚己J)gene、v弱foulldt0beaSsociated谢tllhi曲myopiainJapalle∞．111isstudyaimedtoinVeStigatetllisgenefor私sociation晰t11hi曲myopiaillClline∞．Methods：C雒e—contm

7、l鹤sociationstudy、糯usediIl“ss砌【y．TwogroupsofⅧ鹏latedH锄Ctlinese舶mHongKongwererecmitedusingmes锄ecriteria：S锄plc．Setlcom埘sing356con们ls(sph嘶calequiValent，SE，witllin士1．OOdiopterorD)and356caSes(SE<一8．00D)，aIldS锄pleSet2comprising394controlsa11d526c嬲es．