北方粳稻dna指纹图谱的构建

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1、硕士学位论文北方粳稻DNA指纹图谱的构建CONSTRUCTIONOFDNAFINGERPRINTOFNORTHERNJAPONICARICE李溪盛哈尔滨工业大学2014年6月万方数据国内图书分类号：TS210.7学校代码：10213国际图书分类号：63密级：公开工学硕士学位论文北方粳稻DNA指纹图谱的构建硕士研究生：李溪盛导师：马莺教授申请学位：工学硕士学科：食品科学与工程所在单位：食品科学与工程学院答辩日期：2014年6月授予学位单位：哈尔滨工业大学万方数据ClassifiedIndex:TS210.7U.D.C:63DissertationfortheMasterDegreeinEn

2、gineeringCONSTRUCTIONOFDNAFINGERPRINTOFNORTHERNJAPONICARICECandidate：LiXishengSupervisor：Prof.MaYingAcademicDegreeAppliedfor：MasterofEngineeringSpeciality：FoodScienceandEngineeringAffiliation：SchoolofFoodScienceandEngineeringDateofDefence：June,2014Degree-Conferring-Institution：HarbinInstituteofTe

3、chnology万方数据哈尔滨工业大学工学硕士学位论文摘要北方粳稻食用品质优良，商业价值巨大，深受人们的欢迎。近年来，稻米的掺假现象不断发生，但由于稻米掺假检测手段的缺失，无法对稻米真伪进行识别。本研究通过建立适用于北方粳稻品种的扩增片段长度多态性（Amplifiedfragmentlengthpolymorphism，AFLP）分子标记体系，构建了北方粳稻的DNA指纹数据库，同时设计了可用于北方粳稻品种查询与识别的数据库系统，为进一步开发北方粳稻品种识别的系统平台奠定基础。本研究对DNA提取方法进行改进，直接从稻米干粉中提取到满足AFLP实验要求的粳稻基因组DNA。根据限制性内切酶组合

4、的选取并且对64对选择性引物组合的筛选，确立了以EcoRⅠ与MseⅠ限制性内切酶作为AFLP体系的酶切组合，并筛选得到8对多态性高、扩增条带清晰的多态性引物组合，用于大规模构建粳稻DNA指纹图谱库。根据所建立的AFLP分析体系，对70个粳稻基因组DNA进行指纹图谱的构建。通过对DNA指纹数据的分析，统计多态性条带数目与特异性位点情况：8对多态性引物对70个粳稻样品共扩增出1451条带，且全部为多态性位点，每对引物组合产生多态性位点数目不等，其中E4/M3最多为193个，E4/M6最少为147个，平均扩增181.4个，并且70个稻米样品中64个粳稻样品具有特异性位点，揭示了不同粳稻DNA指

5、纹的多样性。基于DNA指纹数据，对70个粳稻品种进行遗传相似性分析，结合粳稻的遗传背景及系谱图，对AFLP分子标记产生的聚类结果进行比较。结果表明：部分粳稻样品聚类分析结果与理论的遗传背景信息有一定偏差，但总体上，利用AFLP分子标记手段可以揭示不同品种粳稻的亲缘关系，能够区分开不同亲缘关系的粳稻品种。根据70个北方粳稻的DNA指纹图谱数据，基于MicrosoftOfficeAccess对70个北方粳稻DNA指纹数据库进行构建。该数据库可用于粳稻DNA指纹数据的管理，查询与维护。为借助Internet技术进行数据的共享以及开发一套基于DNA指纹信息来识别粳稻品种的计算机功能平台，设计一套

6、北方粳稻品种识别数据库系统。根据功能需求分析，设计包括用户管理，北方粳稻DNA指纹数据管理，粳稻DNA指纹查询与粳稻品种识别分析四个功能模块，同时设计了该系统的UI界面设计图，为下一步软件开发人员实现该数据库系统奠定基础。关键词：粳稻；DNA提取；AFLP；DNA指纹图谱；数据库-I-万方数据哈尔滨工业大学工学硕士学位论文AbstractNorthernjaponicarice‘seatingqualityisexcellentandcommercialvalueishuge.Northernjaponicariceisfavoredbyconsumers.Soithasahigherp

7、riceinthedomesticmarket.Butinrecentyears,theadulterationofriceoccursfrequently.Giventhelackofresearchondetectiontechnologyofriceadulteration,theauthenticityofricecouldnotbeidentified.Thisstudyestablishedamplifiedfragme