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《基于表达序列标签的微卫星标记_est_ssrs_研究进展》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、植物遗传资源学报2004,5(1)91~95JournalofPlantGeneticResources基于表达序列标签的微卫星标记(EST-SSRs)研究进展1,2312李永强,李宏伟,高丽锋,何蓓如(1中国农业科学院作物品种资源研究所/农业部作物种质资源与生物技术重点实验室,北京100081;2西北农林科技大学农学院,杨凌712100;3中国科学院遗传与发育生物学研究所,北京100101)摘要:作为一种新型分子标记,EST-SSR来自表达基因,因而除具备传统基因组来源的SSR标记所有优势外,可能与基因功能表达具有直接或间接关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。本文综述了
2、近几年来EST-SSR用于遗传图谱构建、基因定位、比较基因组学及重要基因筛选和发掘等方面的研究。关键词:EST-SSR;微卫星;分子标记PrograssofSimpleSequenceRepeatsDderivedfromExpressedSequenceTags1,2312LIYong-qiang,LIHong-wei,GAOL-ifeng,HEBe-iru1(KeylabofCropGermplasm&Biotechnology,MOA/InstituteofCropGermplasmResources,CAAS,Beijing100081;2DepartmentofAgron
3、omy,NorthwestSci-TechUniversityofAgricultureandForestry,Yangling712100;3InstituteofGeneticsandDevelopmentalBiology,CAS;Beijing100101)Abstract:Asanewkindofmolecularmarker,EST-SSRmarkershavemoreadvantagesthanthetraditionalgenomic-derivedSSRsbecausetheyarepartofexpressedgenes.Therefore,EST-SSRsmi
4、ghtbeinvolvedingenefunctioningdirectlyorindirectly.TheabilityofSSRmarkerswillbegreatlyenhanced.Here,wegiveabriefreviewontheapplicationofEST-SSRsingeneticmaping,genetagging,comparativegenomics,genescreeninganddiscovery,andsoon.Keywords:EST-SSR;Microsatellite;Molecularmarker基因组EST(ExpressedSeque
5、nceTags,表达序表1NCBI网站公布的主要农作物的ESTs序列数列标签)计划由美国科学家Venter于1989年提(截至2003年10月31日)出[1],并首先应用于人类基因组研究,之后被广泛Table1EST-numberofsomecropplantsreleasedbydbEST用于植物基因组研究,它是通过大规模的cDNA随inNCBIweb-October31,2003机测序,从而获得对基因组认识的一种研究策略。作物ESTs数目作物ESTs数目CropsNo.ofESTSCropsNo.ofESTs目前,许多国家和组织正在开展某些作物基因组小麦Wheat500,902
6、马铃薯Potato94,525[2]EST计划的研究,如成立于1998年的国际小麦大麦Barley348,233高粱Sorghum89,619族EST协作网(InternationalTriteaceESTcoorpera-大豆Soybean341,578油菜Oilseedrape37,159玉米Maize383,759燕麦Oat501tion,ITEC),就是致力于麦类EST研究和开发的。水稻Rice260,890烟草Tobacco10,332近几年,国际公共数据库中的ESTs序列呈指数增番茄Tomato150,228豌豆Pea3,035长,截止到2003年10月31日,美国生物
7、信息中心(NCBI)数据库Genebank已公布涉及529种生物共快速增长的ESTs数据为SSR标记的开发提供18971362条ESTs序列。表1列举了小麦、大麦、水了一个巨大的有价值的来源。首先,避免了传统SSR稻等十二种主要农作物的ESTs数目。标记开发需要构建基因组DNA文库等烦琐步骤,而收稿日期:2003-12-04修回日期:2003-12-23作者简介:李永强(1978-),男,陕西南郑人,在读硕士研究生,E-mail:yongqiangl@hotmail.
