长链非编码rna在胰腺导管腺癌表达谱分析

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1、第军医大学硕士学位论文长链非编码RNA在胰腺导管腺癌表达谱分析AnalysisofthedifferentiallyexpressionlongnoncodingRNAprofilesinpancreaticductaladenocarcinoma研究生:彭智勇学科专业:外科学研究方向:胰腺癌的诊断与外科治疗导师:邵成浩副教授培养单位:第二军医大学第一附属医院导师组成员:金刚副教授胡先贵教授第二军医大学二。一四年五月二独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作。除了文中特别加以标注和致谢的地方

2、外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。本人承担本声明的法律责任。学位论文作者签名:锄锄真签字日期:矽,矽年瑚矽日学位论文使用授权书声明本人完全了解第二军医大学有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权第二军医大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)导师

3、签名:刁删彳签字日期:.撕少年霸矽日勇锄尹勃叼月一f●●名年签垆者州储加文期沦日位字学签目录摘要⋯⋯⋯⋯.⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.一1一英文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一3一英文缩略词表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..一5一前言⋯...⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..⋯⋯⋯⋯⋯.一6一月IJ舌⋯...⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..⋯⋯⋯⋯⋯.一6一长链非编码RNA在胰腺导管腺癌表达谱分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯.一9一材料与方法⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一9一结果.⋯⋯...⋯⋯..⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..一20一拿口木.⋯⋯...⋯

4、⋯..⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..一么U一讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯....⋯⋯⋯⋯.一31一参考文献⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯.⋯⋯.⋯⋯⋯.⋯.一35一全文小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..一41一综烫盎⋯⋯..⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..一42一在读期间发表论文和参加科研工作情况⋯⋯⋯.⋯..⋯⋯.一52一致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯一53—长链非编码RNA在胰腺导管腺癌表达谱分析摘要【研究目的】本实验旨在观察长链非编码RNA(10ngnoncodingRNA,lncRNA)在胰腺导管腺癌(pancreaticd

5、uctaladenocarcinoma,PDAC)及相应癌旁组织中表达谱的变化,建立胰腺导管腺癌组织差异lncRNA/mRNA共表达网络,筛选差异表达的lncRNA并初步探讨其在胰腺导管腺癌中的作用机制。【研究方法】提取胰腺导管腺癌及相应癌旁组织的总RNA并纯化,检验RNA质量,合成cRNA,使用高通量生物微阵列芯片检测癌及癌旁组织中的IncRNA/mRNA,比较癌及癌旁组织中lncRNA/mRNA差异表达情况,筛选出差异表达的IncRNA/mRNA,建立IncRNA/mRNA共表达网络。经过差异倍数分析、网络邻近编码

6、基因分析等生物信息学方法筛选可能在胰腺导管腺癌中发挥重要作用的IncRNA,验证其在胰腺导管腺癌中的表达,结合文献分析共表达网络中基因在胰腺癌中的作用,初步探讨差异表达lncRNA在胰腺导管腺癌中的可能作用机制。【结果11.与癌旁组织相比,胰腺导管腺癌组织的IncRNA/mRNA表达谱发生了明显变化,差异具有统计学意义(尸<0.05)。2倍以上变化的lncRNA有4634条,其中上调的共2365条,下调的共2269条;5倍以上变化的共612条,其中上调的共477条,下调的共135条。2倍以上变化的mRNA有4862条,

7、其中上调的共3857条,下调的共1005条;5倍以上变化的共976条,其中上调的共885条,下调的共91条。据此构建了胰腺导管腺癌组织IncRNA/mRNA共表达网络。2.生物信息学分析提示lncRNAAKl23493可能在胰腺导管腺癌发生发展中发挥了重要的作用。RT-PCR证实lncRNAAKl23493在癌组织中的表达量明显高于癌旁组织且差异具有统计学意义(氏0.05)。文献分析提示lncRNAAKl23493可能通过一种或多种途径参与了胰腺癌的发生发展过程。【结论11.与癌旁组织相比,胰腺导管腺癌组织IncRNA

8、存在差异表达。第二军医大学硕士学位论文2.LncRNAAKl23493可能通过一种或多种途径参与了胰腺导管腺癌的发生发展过程。【关键词1长链非编码RNA,胰腺导管腺癌,表达谱长链非编码RNA在胰腺导管腺癌表达谱分析objectiveAbstractThisstudywasdesignedtoinvestigatethechange

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