人类外周血单核细胞蛋白质组学研究

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1、分类号学校代码10542密级学号2QQ9丑411004人类外周血单核细胞蛋白质组学研究ProteomeofHumanPeripheralBloodMonocyte指导教师姓名、职称邓红文教授湖南师范大学学位评定委员会办公室二零一二年四月中文摘要IIIIIUIIIIIIIIItlIIlY2148869蛋白质作为基因表达的产物，生命活动的体现者及功能最终执行者，在生物体内有着及其重要的作用。随着后基因组时代的推进，蛋白质组学的研究逐渐成为近期生物科学研究的中心之一。蛋白质组学的研究不仅能揭示生命活动的基本规律，也为许多复杂疾病的发病机理及攻克措施提供了

2、理论依据。系统而全面性的蛋白质组学研究的主要任务是鉴定和编目在人体某一类细胞或组织中产生的所有蛋白质，然后利用生物信息学的处理方法，例如：实验获得的蛋白质数据与已建立的数据库进行匹配，蛋白质功能及细胞内分布位点的归类和分析，与蛋白质相对应的基因功能的注释(如：基因本体论分析)等，进一步来阐述它们的生物学和细胞学功能，进而帮助更有效的进行某些相关疾病的诊断和治疗。系统而全面的呈现蛋白质及其相对应的基因的信息主要包括以下内容：蛋白质的鉴定、定位以及定量分析，蛋白质所对应的基因的功能注释、归类等。本研究是针对人类外周血单核细胞(PBM)的蛋白质组学研究。

3、人类外周血单核细胞(PBM)是一种特殊的白细胞，同时也是破骨细胞的前体，它在免疫、血液、骨骼、肿瘤等相关的生理过程中扮演者重要的角色。它涉及到许多人类复杂疾病的生理或病理过程，例如：自身免疫缺陷，HIV，癌症，骨质疏松等。到目前为止，关于人类PBM的蛋白质组学的研究还十分有限，在蛋白质水平上揭示许多与PBM相关疾病的发病机理仍有一定的困难，到目前为止，尚未有一个系统编目人类PBM中蛋白质的数据库确立。本研究中基于76个随机的不相干的高加索人群，利用现代蛋白质组学研究的最新技术即液相色谱．质谱联用技术，获得76个独立、有效的PBM蛋白质组学数据，我们

4、建立第一个关于人类PBM的蛋白质组学数据库。这个数据库包含了以下信息：鉴定了在PBMeP表达的蛋白，这些蛋白的含量以及它们的生化指数(分子量和等电点)，这些蛋白质的功能(包括细胞器的定位，分子功能及参与的生物学过程)。本研究总共鉴定T2413种在PBM中表达的蛋白。所有这些蛋白对应的基因通过基因本体论(GeneOntology)的分析分别进行了注释和分类。基因本体论的术语主要分为三个方面：生化过程、细胞组成、分子功能。这些基因被分类到相应的基因本体论术语中。通过这些注释，能直观清晰的呈现基因及其表达产物蛋白质与机体生理、生化过程之间关系。在这些注释

5、中，一些熟知的基因被报道与人类的免疫反应、血液相关生理、骨重建、癌症等密切相关。总之，本研究为人类PBM建立了一个全新的蛋白质组学的数据库，这个数据库包含着相对全面而丰富的信息，’从整体水平上加深了我们对人类PBM生物学功能的理解。作为第一个针对PBM的蛋白质组学数据库，其具有重要的意义。本数据库能为今后PBM以及PBM相关疾病的深入研究提供重要的参考的价值。关键词：人类，外周血单核细胞，蛋白质组学，数据库，基因本体论IIAbstractThemissionoftheinternationalHumanProteomeProject(HPP)ist

6、ohelpelucidatebiologicalandmolecularfunctionandadvancediagnosisandtreatmentofdiseasesbysystematicallycataloguingalltheproteinsmanufacturedinthehumanbody—whattheyare，wheretheyare，andinwhatabundance．Humanperipheralbloodmonocyte(PBM)isanimportantcelltype，whichisinvolvedinvarioush

7、umancomplexdiseases，suchasautoimmunedeficiency,HIVcancers，osteoporosis，etc．Sofar，humanPBMproteomehasnotbeentackledbytheHumanProteomeOrganization(HUPO)Initiatives．Thus，acatalogueofhumanPBMproteinshasyettobeestablished．Inthisstudy,throughintegrating76independentPBMproteomedatase

8、tsacquiredfor76unrelatedCaucasians，weestablishedthefirstPBMpr