中国平胸龟的系统发生和遗传多样性研究

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1、中国平胸龟的系统发生和遗传多样性研究论文作者签名：毛&杰指导教师签名：论文评阅人1：评阅人2：评阅人3：评阅人4：评阅人5：答辩委员会主席：委员1：委员2：委员3：委员4：委员5：杭州师范大学研究生学位论文独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他入已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得抗趔嘘菹烂或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我～同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：壶∥彩签字日期：2014

2、年5月26日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解篮州娅范太堂有权保留并向国家有关部门或机构送交本论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权抗趟!匝范太堂可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名：易结导师签名：—裥签字日期：2014年5月26日杭州师范大学硕士学位论文中国平胸龟的系统发生和遗传多样性研究摘要平胸龟(Platysternonmegacephalum)为珍稀濒危物种，其在系统发生中的地位尚存在争议。本

3、文应用四个分子标记f两个线粒体DNA：12S核糖体RNA(i2SrRNA)和细胞色素b(Cytb)；两个核DNA：RNA指纹蛋白35(R35)和重组激活基因1(RAGl)】，探讨中国平胸龟的系统发生情况，确定其在系统发生中所处的位置。同时，基于Cytb和控制区(CR)两个线粒体DNA分子标记研究中国9个野生平胸龟种群(浙江泰顺TS、浙江奉化FH、安徽黄山HS、江西崇仁ChR、湖南邙山MS、湖南东安DA、广西荔浦LP、广西贺县HX和广东普宁PN)的遗传结构，了解其遗传多样性信患，推测种群历史分布动态，确定分类保护单元，提出科学合理的保护措施。实验结果如下

4、：l、基于线粒体DNA序列和核DNA序列并综合系统进化树和遗传距离结果发现：基于12SrRNA的平胸龟的系统发生与泽龟科比较近；基于Cytb的平胸龟的系统发生与鳄龟科比较近；基于I认Gl的平胸龟的系统发生与鳄龟科比较近，其他科与平胸龟的遗传距离要远大于鳄龟科与平胸龟的距离；基于R35的平胸龟的系统发生与海龟科比较近，与海龟科相比，其它科与平胸龟的遗传距离并不是相差很大。关于四种分子标记的分析显示，平胸龟的系统发生并不完全一致，其系统发生地位相对比较独立。2、分析9个平胸龟种群的Cytb序列。A+T含量较高，其平均值达到58．80％；序列长度为1144b

5、p，保守位点1077个，变异位点67个，转换突变位点数为57，颠换突变位点数为9。两者兼有位点突变数为l；9个平胸龟种群共存在26种单倍型；种群的单倍型多样性(删)为0．88350，平均核苷酸变异数(七)为10．30976，核苷酸多样性(p)为0．00901；26种单倍型总体平均遗传距离为0．252334-0．04184，9个种群的总体平均遗传距离为0．009114-O．00100；遗传固定分化指数Fst为0．78710，基因流Nm为0．07；系统发生和单倍型网状图显示平胸龟主要分为4个大的类群，即LP和HX类群，PN、MS和DA类群，TS类群，C1恹

6、、FH和HS类群。3、分析9个平胸龟种群的CR序列。A+T含量较高，其平均值达到65224％；序列长度为663bp，保守位点606个，插入／缺失位点12个，碱基变异位点45杭州师范大学硕士学位论文中国平胸龟的系统发生和遗传多样性研究个，转换突变位点数为34，颠换突变位点数为10，两者兼有位点突变数为1；9个平胸龟种群共存在23种单倍型；种群的单倍型多样性(刚)为O．88750，平均核苷酸变异数(七)为10．30976，核苷酸多样性(p)为0．01584；23种单倍型总体平均遗传距离为0．46387士0．08881，9个种群的总体平均遗传距离为0．016

7、27士O．00293；遗传固定分化指数凡t为0．85978，基因流Nm为O．04：系统发生和单倍型网状图显示平胸龟主要分为5个大的类群，即ChR和FH类群，HS类群，TS类群，PN、MS和DA类群，LP和HX类群。关键词：平胸龟；系统发生；Cytb；CR；遗传多样性Ⅱ杭州师范大学硕士学位论文中国平胸龟的系统发生和遗传多样性研究AbstractPlatysternonmegacephalumisallendangeredspecies，anditspositioninthephylogenyofturtlesremainsdebated．Inordert

8、odeterminethephylogeneticstatusofthisturtle，Ius