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1、遗传HEREDITAS(Beijing)28(12):1541~1548,2006研究报告DOI:10.1360/yc-006-1541微卫星DNA标记探讨镜鲤的种群结构与遗传变异1,21,3111全迎春,李大宇,曹鼎辰,孙效文,梁利群(1.黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,哈尔滨150070;2.上海水产大学生命科学与技术学院,上海200090;3.大连水产学院生命科学与技术学院,大连116023)摘要:采用30个微卫星分子标记,对5个镜鲤群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、
2、多态信息含量(PIC)和有2效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,以χ检验估计Hardy-Weinberg平衡,以近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化。同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA聚类图,并进行bootstrap自举检验验证进化树的可靠性。在德国镜鲤选育系(ScatteredCyprinuscarpioL.)和来自4个不同养殖场(松浦、东岗、奉城和辽中)的德国镜鲤群体中共检测到7083个扩增片
3、段,长度在102~446bp之间,在群体内扩增出等位基因1~16个不等,共计356个等位基因。结果表明:(1)5个群体检测的有效等位基因数在1.07~12.30个不等,平均多态信息含量为0.74、0.74、0.69、0.75和0.75,无偏期望杂合度的平均值为0.74、0.78、0.70、0.76和0.78,说明这几个群体属于高度多态,遗传多样性水平较高。(2)群体间相似系数在0.52以上,相似性较高。聚类分析显示,东岗、奉城和辽中3个养殖场的德国镜鲤群体聚类成一个分支,而德国镜鲤选育系与松浦群体聚类成另
4、一分支。聚类的先后与它们在地理分布上距离远近有一定的相关性。(3)在与功能基因相关的多个微卫星基因座位上,扩增产物呈现不同程度的缺失现象,这些无效等位基因的产生可能与结构基因在育种中受到人工选择的影响较大有关。关键词:微卫星;群体多样性;镜鲤;分子标记中图分类号:Q953文献标识码:A文章编号:0253-9772(2006)12-1541-08PopulationGeneticVariationandStructureAnalysisonFivePopula-tionsofMirrorCarpCyprin
5、uscarpioL.UsingMicrosatellites1,21,3111QUANYing-Chun,LIDa-Yu,CAODing-Chen,SUNXiao-Wen,LIANGLi-Qun(1.HeilongjiangFisheriesResearchInstitute,ChineseAcademyofFisherySciences,Harbin150070,China;2.CollegeofAqua-lifeScienceandTechnology,ShanghaiFisheriesUnivers
6、ity,Shanghai200090,China;3.CollegeofAqua-lifeScienceandTechnology,DalianFisheriesUniversity,Dalian1160023,China)Abstract:Inthispaper,populationgeneticvariabilityandgeneticstructureoffivepopulationsofanimportantcultivationspecies,mirrorcarp(CyprinuscarpioL
7、.)wereanalyzedusing30microsatelliteloci.Theobserved(Ho)andexpected(He)heterozygosityvalues,polymorphicinformationcontent(PIC)andnumberofeffectivealleles(Ae)werealldetermined.ThegeneticsimilaritycoefficientandNei’sstandardgeneticdistancewerecomputedbasedon
8、theallelefrequencies.2TheHardy-Weinbergequilibriumwascheckedbyχtest.Geneticdifferentiationandhierarchicalpartitionofgenetic收稿日期:2006-03-22;修回日期:2006-04-10基金项目:国家重大基础研究计划资助项目(编号:2004CB117405)资助[SupportedbyKeyProjecto
