黄藤遗传多样性的rapd分析

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1、林业科学研究鶫文章编号!"#黄藤遗传多样性的分析!杨华!尹光天!甘四明!白嘉雨!李荣生!杨锦昌!陈和明中国林业科学研究院热带林业研究所广东广州浙江省林业科学研究院浙江杭州福建农林大学林学院福建福州摘要!利用标记从水平对收集的个天然黄藤种群进行遗传多样性分析条引物扩增得到条片段整个种的多态性位点比率为指数为信息指数为黄藤种的遗传多样性为种群间的遗传分化系数为各种群间的遗传变异非常小个种群间的遗传相似性分析结果显示毛感乡和尖峰岭种群间的遗传相似度最高吊罗山和坝王岭种群间的遗传相似度最低分析结果表明种群间基因分化系数为大部分遗传变异来源于群体内研究结果揭示收集的天然黄藤种群具有较高的遗传多样性

2、有良好的保存和利用价值尖峰岭种群可以作为重点保护关键词!黄藤遗传多样性遗传分化中图分类号!文献标识码!黄藤具刺攀援藤本是中国特有种天然分布以海南岛为属棕榈科省藤亚科省藤族中心延伸至以南的广东和广西南部地黄藤属为区由于黄藤天然分布正在缩小现有天然资源收稿日期基金项目国家十五攻关课题棕榈藤种质资源培育及利用技术作者简介杨华女江苏扬州人博士生森林培育专业主要研究方向为热带植物遗传育种林业科学研究第卷多集中于海南岛中部及西南部山区在广东和广西为采集地采集点的基本情况见表对生长良好已基本找不到天然生长的黄藤仅在一些次生林及的藤丛采集同母半同胞家系的果实分株标记每两人工林中仍有生长个个体的间距在以上

3、果实采后立即去皮国内外对棕榈藤天然资源的研究多集中在收集沙藏育苗年月初种子陆续出苗后移苗于及保存上对其遗传多样性研究凤毛麟角特别是黄营养袋中年月每个家系随机选择一个子藤尚未有报道遗传多样性的研究可以分析种质代采当年生嫩叶用于遗传多样性分析因不同地资源的多样性状况为种质资源的开发利用提供依点种群个体数量及年结果量不同部分地区采集的据为育种材料的选择提供信息有些物种虽然已样本数比较少采取措施进行保存但所保存的遗传多样性并不能基因组的提取和反应体系及扩代表该物种的遗传多样性如夏蜡梅增程序见参考文献选择扩增条带较多且清楚的引物条电泳图谱中每一扩增条带代表的迁地保护就未能有效保护其遗传多引物的一个

4、结合位点视为有效的分子标记对样性因此对种质资源进行遗传多样性的研究照标准分子量标记根据各也是检验已采取的措施是否有效的一种途径应用分子标记的迁移率将电泳图谱中较为清晰的条表型分析同工酶及分子标记技术分析棕榈藤遗带包括弱带计作无则计为转换成传多样性是实施育种计划的重要背景知识是育二元矩阵在已有的研究中扩增产种研究的趋势标记方法简便易行高效而物的长度一般在鶫之间此范围内广泛在遗传多样性的分析中已得到广泛应用的扩增片段被认为是有效稳定可重复的运本研究也采用该种方法从整个基因组的角度对黄用软件计算多态性位点比率指藤天然种群的遗传结构和遗传多样性进行分析为数信息指数遗传距离和遗传相似系保护天然黄藤

5、制定合理措施及基本育种群体的建立数并运用软件进行类平均法提供基础资料聚类分析同时应用对几个种群进行种群内和种群间的分子变异分析材料与方法年月下旬以黄藤的主要天然分布区表各种群的基本情况种群采样地点林分起源藤林起源样本数经度纬度海拔尖峰岭海南乐东县尖峰岭天然林天然鶫鶫鶫毛感乡海南保亭县毛感乡南昌村天然林天然鶫鶫鶫吊罗山海南陵水县吊罗山国家森林公园天然林天然鶫鶫鶫坝王岭海南昌江县坝王岭保护区天然林天然鶫鶫鶫鶫之间变化表多态性最高的种群结果与分析在尖峰岭多态性最低的种群在坝王岭个种扩增片段的多态性群的多态性位点比率平均为整个种条引物对个黄藤种群的个个体进的多态性位点比率为高于任一个种行扩增得到

6、条片段每个引物扩增的条带群多态性位点比率的估算与种群内个体数有数从条到条平均每条引物可扩增得到一定的关系由于吊罗山和坝王岭种群采样个条片段不同种群同一引物的多态性位点体数较少多态性位点比率也不高而尖峰岭种和多态性位点比率是不一样的表多态性群样本数最多为个多态性位点比率也最位点比率的变化范围为鶫不高为这也反映了在尖峰岭有相对更同种群所有引物的多态性位点比率在广泛的遗传基础第期杨华等黄藤遗传多样性的分析表黄藤各种群不同引物的多态性位点和多态性位点比率不同地种群引物尖峰岭毛感乡吊罗山坝王岭总扩增带数多态性多态性位点多态性多态性位点多态性多态性位点多态性多态性位点位点比率位点比率位点比率位点比率

7、表黄藤不同种群所有引物的多态性应用软件分析原始二元矩阵计算位点比率及遗传多样性得到黄藤种的遗传多样性为种群内遗传多多态性位点遗传多样性样性为种群间遗传多样性种群单态性多态性多态性位点指数为种群间的遗传分化系数为位点数位点数比率信息指数尖峰岭由遗传分化系数可知种群间的遗传变异比较毛感乡小只占总变异的种群间的遗传相似度吊罗山坝王岭和遗传距离见表由表可见毛感乡和尖峰岭种平均群间的遗传相似度最高遗传距离为吊罗物种山和坝王岭种群间的遗传相似度