大白菜pol cms育性相关基因的表达谱分析

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1、ShandongAgriculturalUniversityPh．D．DISSERTATIONGeneExpressionProfilingofpolCMSFertility-—relatedGenesinChineseCabbageDepartment：CollegeofHorticultureScienceandEngineeringMajor：GeneticBreedingandBiotechnologyofVegetableCropsPh．D．Candidate：XuWenlingSupe

2、rvisor：ProfessorHeQiwei‘December,2013煳炒关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文，是在导师指导下，独立进行科学研究所取得的成果。对在论文研究期间给予指导、帮助和做出重要贡献的个人或集体，均在文中明确说明。本声明的法律责任由本人承担。本人完全了解山东农业大学有关保留和使用学位论文的规定，同意学校保留和按要求向国家有关部门或机构送交论文纸质本和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权山东农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可

3、以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文，同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》，并向社会公众提供信息服务。保密论文在解密后应遵守此规定。论文作者签名：缝童趟导师签名：算之参一一日期：趁f王丛丛符号说明AFLP：Amplifiedfragmentlengthpolymorphism，扩增片段长度多态性AMS：abortedmicrospores，败育小孢子基因APG：花药特异的富含脯氨酸的蛋白biologicalprocess：参与的生物过程CDP

4、K：Calciumdependentproteinkirtle，钙依赖型蛋白激酶cellularcomponent：所处的细胞位置cleantags：干净标签CMS：cytoplasmicmalesterility，植物细胞质雄性不育CorrectedP．value：校正后的P值cpDNA：叶绿体DNADEGs-DifferentiallyExpressedGenes，差异表达基因DGE：digitalgeneexpressionprofiling，数字基因表达谱distincttags：标签种类

5、Down—regulated：下调基因FDR：FalseDiscoveryRate，错误发现率GMS：细胞核雄性不育GO：GeneOntology，基因功能显著性富集分析KEGG：KyotoencyclopediaofGenesandGenomes，京都基因与基因组百科全书l092Ratio(S2／S1)：l092差异表达倍数(处理组／对照组)M-F：malesterility-fertility，雄性不育．育性恢复株系M—S：malesterility—sterility，雄性不育一不育株系MM

6、：MissMatch，错误匹配molecularfunction：分子功能mONA：mitochondrialDNA，线粒体DNAOgaraCMS：萝卜细胞质雄性不育ORF：Openreadingframe，开放阅读框Pathway：通路PG：polygalacturonase，多聚半乳糖醛酸酶PM(Antisense)．表示完全比对到反义链的tagPMGenome1tag->1position：一个tag比对到基因组一个位置PMGenome1tag一>nposition．一个tag比对到基因组多

7、个位置PM：PerfectMatch，完全匹配PM(Sense)：表示完全比对到正义链的tagPolCMS：Polima细胞质雄性不育Pvalue：超几何检验的P值rawtags：原始标签肼nuclearrestorergeneforfertility，恢复系的核基因RT-qPCR"real-timequantitativePCR，orreal-timeqPCR，实时荧光定量PCRTag：标签term：词条、节点TF：转录因子，transcriptionfactorTPM：TranscriptPe

8、rMillion，是～个标准化的指标，指每一百万cleantag或gene中包含该种转录本的拷贝数。totaltags-总标签数TS．S：temperaturesensitive．sterile，温度敏感一不育株系TS．F：temperaturesensitive．fertile，温度敏感一可育株系TS．F／TS．S或M．F／M．S：处理组／对照组TS．FVSTS—S或M—FVSM．S：对照组VS处理组UnknowTag：都没有比对上的tagUp—regulated：上调基因目录中