nacl胁迫对黄瓜种子萌发的影响及dna甲基化的msap分析

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1、中国农业科学2013,46(8):1646-1656ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864/j.issn.0578-1752.2013.08.014NaCl胁迫对黄瓜种子萌发的影响及DNA甲基化的MSAP分析黄韫宇,张海军,邢燕霞,齐艳,孙倩倩,周春蕾,赵冰,郭仰东(中国农业大学农学与生物技术学院,北京100193)摘要:【目的】研究黄瓜种子萌发过程中DNA甲基化动态变化情况以及外源施加NaCl对种子萌发及种子DNA甲基化水平的影响,探索DNA甲基化在黄瓜种子萌发过程及NaCl胁迫反应

2、中的作用。【方法】运用甲基化敏感扩-1增多态性(methylationsensitiveamplifiedpolymorphism,MSAP)技术,分析0、150、200mmol·LNaCl处理下,黄瓜种子萌发过程(0、1、2、4、6、8d)的DNA甲基化水平及动态变化情况。【结果】MSAP结果显示,黄瓜种子CCGG位点的甲基化水平约15.25%,以双链甲基化方式为主。种子中DNA甲基化水平在萌发1—2d略有升高,而在整个萌发过程中呈下降趋势;NaCl处理加剧了甲基化的变化幅度,并使萌发末期的甲基化水平更低。萌发过程中

3、甲基化升高和降低同时发生,分别在不同萌发时期占主导,不同变化类型中CG/CHG(H=A,T,C)位点胞嘧啶甲基化同时变化的类型占主导。甲基化变化同时发生在编码序列和非编码序列中。【结论】黄瓜种子萌发过程的DNA甲基化表现出复杂性,甲基化和去甲基化进程同时进行,并具有时空特异性。NaCl处理降低了种子基因组甲基化水平的稳定性,对种子萌发有抑制作用。关键词:黄瓜;萌发;DNA甲基化;NaCl;甲基化敏感扩增多态性EffectsofNaClStressonSeedGerminationandDNAMethylationSta

4、tusDetectedbyMSAPAnalysisinCucumberHUANGYun-yu,ZHANGHai-jun,XINGYan-xia,QIYan,SUNQian-qian,ZHOUChun-lei,ZHAOBing,GUOYang-dong(CollegeofAgricultureandBiotechnology,ChinaAgriculturalUniversity,Beijing100193)Abstract:【Objective】Theobjectivesofthisstudyweretoanalyze

5、thecytosinemethylationdynamicsduringcucumberseedgerminationandtoassesstheeffectofNaCltreatmentonseedgerminationandDNAmethylationstatus.Moreover,theroleofDNAmethylationonseedgerminationandsaltstressadaptationwasstudiedatthesametime.【Method】Methylationsensitiveamp

6、lifiedpolymorphism(MSAP)methodwasusedtoanalyzethelevelandvariationpatternsofDNAmethylationatdifferenttimes(0,1,2,4,6,8d)duringcucumberseedgerminationindifferentNaCltreatments(0,150,200mmol·L-1).【Result】MSAPresultsshowedthatthemethylationlevelincucumberdryseedswa

7、s15.25%,mainlyinfullmethylationpattern.ThelevelofglobalDNAmethylationdecreasedduringthewholegerminationprocess,withaslightincreaseattheearlystages(1-2d).NaCltreatmentaggravatedthesechanges,andmadethefinallevelofDNAmethylationlower.Hypermethylationandhypomethylat

8、ionhappenedsimultaneously,andpredominatedatdifferentgerminationstages.Amongdifferentchangetypes,CG/CHG(H=A,T,C)simultaneouschangeswerethedominatingtypes.DNAmethylatio

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