基于全基因组测序的副溶血弧菌种群进化研究

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1、分类号.密级_UDC保密期限硕士学位论文题基于全基因组测序的副溶血弧菌种群进化研究作者姓名杨献伟指导教师杨瑞馥研究员崔玉军副研究员培养单位微生物流行病研究所专业名称军事预防医学论文提交日期2015年5月15日学位授予单位中国人民解放军军事医学科学院答辩委员会主席朱宝利研究员中国人民解放军军事医学科学院制军事医学科学院研究生学位论文独创性声明秉承军事医学科学院严谨的学风和科研作风，本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下独立进行的研究工作和取得的研究成果，除了文中特别加以标注和致谢之处外，论文中不包含其他人巳经发表或撰写过的研究成果，也不叙含为获得军事医学科学院或其它教育机构的学

2、位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均巳在论文中作了明确的说明并表示了谢意。论文作者签字签字日期：2vJC年、月>日军事医学科学院保护知识产权声明本学位论文作者完全了解军事医学科学院对研究生在学其间撰写的论文知识产权保护的相关规定。本人撰写的论文是在导师具体指导下，并得到相关研究经费支持下完成，其数据和研究成杲归属于导师和作者本人，知识产权单位属军事医学科学院。本人保证毕业后，以本论文数据和资料发表论文或使用论文工作成果时署名第一单位仍然为军事医学科学院。军事医学科学院有权保留学位论文及其电子版，通过网站公布论文的全部或部分内容，可以采用影印、缩印或其

3、他复制手段保存论文、汇编以供查阅和借阅。(涉密和延期公开学位论文在解密后适用本声明）论文作者签字：签字日期：年；月>日指导教师签字：年签字日期：二。/c年；^月日目录目录缩略词表...................................................................................................................................1摘要......................................................................

4、.....................................................................2Abstract.....................................................................................................................................5前言...............................................................................

5、............................................................9第一章菌株选择与全基因组测序.......................................................................................14小结与讨论.................................................................................................................15第二章全基因组变异

6、分析...................................................................................................171分析策略和工具.....................................................................................................171.1变异检测策略......................................................................

7、............................171.2数据处理环境及平台......................................................................................172变异分析过程与结果.............................................................................................182.1基因组片