三七根际土壤微生物的群落特征

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1、_...,-...〔‘■、；■丨伽―的丨丨丨：■‘■，丄■■顯■——：；—■■—，、”‘学院（所、中心）生命科举举院专业名称研究生姓名亩翠苹学号师姓名徐丽华职称研究员职称研究员‘二：；二二：：二二”反巧華巧：’必》二零一五年五月。：：；：一：々二、：’、、”？一‘■二’■”“一、—■”；二―——”⋯一，，々，：‘：”二‘”、，、，，，一、二：、■■：—‘卞、、。■，、■MicrobialcommunitycharacteristicsinrhizospheresoilofPanaxnotoginsengAdissertationSubmitedtoYu

2、nnanUniversityinfulfillmentoftherequirementfortheawardoftheDoctor'sDegreeByCui-PingMiaoSupervisedbyProf.Li-HuaXuProf.You-WeiChenYunnanUniversity,Kunming，扉页：论文独创性声明及使用授权本论文是作者在导师指导下取得的研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，不存在剽窃或抄袭行为。与作者一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢

3、意。现就论文的使用对云南大学授权如下：学校有权保留本论文（含电子版），也可以釆用影印、缩印或其他复制手段保存论文，学校有权公布论文的全部或部分内容，可以将论文用于查阅或借阅服务；学校有权向有关机构送交学位论文用于学术规范审查、社会监督或评奖；学校有权将学位论文的全部或部分内容录入有关数据库用于检索服务。内部或保密的论文在解密后应遵循此规定）研究生签名导师签名曰摘要摘要三七（为五加科人参属植物，是我国特有的名贵中药材，具有止血散瘀、定痛消肿的功效。三七长期庇荫，潮湿，免耕作的生活环境造成了土壤环境的微生态失衡，以根腐病为主的土传病害日益突出，至今仍未得到

4、有效的缓解。研究三七根际土壤的微生物的群落组成及多样性将为该类土传病害的发生、传播、有效治理及解决三七连作障碍提供重要依据。本文采用高通量测序和方法，研究三七栽培过程中根际真菌、细菌的群落结构和丰度动态，通过与环境理化因子进行相关性分析，阐明驱动根际微生物类群动态变化的关键因子；比较三七根腐病与健康植株根际土壤真菌、细菌群落结构的差异，寻找与发病有关的微生物因子。通过纯培养，分析其可培养真菌、细菌的多样性及种群分布，以三七病原菌为靶标，筛选防治根腐病的活性资源。结果如下一、样品信息年月至年月间，每年月和月两个生长高峰期于砚山三七试验田釆集健康三七根际土

5、壤（共份），每一份取小份用于高通量测序及荧光定量来研究三七栽培过程中根际真菌、细菌的群落结构及丰度动态。一小份甩于传统的真菌和放线菌的分离，用于研究纯培养真菌和放线菌的种群分布及多样性，所分离到的菌株进一步用于三七根腐病生防资源的筛选。剩余部分用于分析土壤理化性质。分别于砚山试验田和金川种植大田中采集黄腐型和急性青枯型根腐病三七根际土样，以及各自作为对照的健康三七根际土样，用于分析根腐病发病植株根际微生物群落结构，并与健康组作比较，研究引起根腐病发生的微生物因子。二、荧光定量分析表明三七根际土壤中真菌和细菌的数量均在移栽半年前显著增加，随后逐渐减少，一

6、年半后数量翻倍增加。相关性分析显示真菌数量与土壤含水量显著正相关（，。香农多样性指数表明，真菌多样性开始随真菌数量的增多而降低，半年后随真菌数量的减少而上升，但是在一年半后随着数量的增加明显升高；细菌多样性半年前随着其数量的增多而升高，之后随其数量减少而降低，仍然在一年半后大幅提高。高通量数据分析显示三七裉际土壤微生物群落呈明显的动态变化，真菌群落中有大量的被孢霉类群存在，其在移栽半年时丰度显著提高，之后逐渐降低一年半后趋于平稳，摘要丰度变化幅度不大。在门分类水平上，和为优势类群，的变化随的变化而变化，而丰度则在移栽半年前骤减，之后逐步增多。细菌群落以

7、和■为优势类群，丰度随时间增长逐渐高，而丰度则随时间增长逐渐降低。随着种植周期的增长，病原菌种类增多，有益菌减少，三七生长环境日趋恶化。相关性分析和冗余分析表明主要真菌类群受土壤中总氮（的影响，但均未达到显著水平；总磷（、有效磷（和水解氮（是影响细菌群落结构的重要因子。三、对砚山和马塘两地的根腐病三七根际微生物群落结构进行了研究。荧光定量显示根腐病三七根际土壤中真菌和细菌的数量均高于健康对照。与健康植株的相比，病株根际真菌、细菌群落结构发生了明显的变化，主要表现为根际土壤中丰度大幅下降，多种病原菌大量增殖而成为优势类群。优势真菌病原有、、、、、、及其有

8、性型优势细菌病原有、。三七根腐病的发生与这些病原菌的积累有密切的关系，并且呈现多种病原并存的现