应用不同分型方法对布鲁氏菌临床分离株基因分型的研究

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时间:2019-03-14

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1、分类巧S841363235.4+4学号S20四川巧处大学专化硕dtr学位论文应用不同分型方法对布鲁氏菌临巧分离蛛基因分型的研究庄抒冰%??、指导教师彭广能教授校外导师膝泽良研究员)(军事医学科学院学位类别兽医硕±领域名称临巧兽医学研巧方向临床分子诊断与应用^4-*.%‘:‘?2015年5月_:'’諫.*????,VSichuanAriculturalUniversitgyMasterDeree

2、Thesisg'Analysisoftheenotinfor公7?cc//aclinicalgypgisolat:esusindifferenttinmethodsgypgByZhuangYubingDirec化dbProf.PenGuannenygggResearchdirectionMasterofVeterinarMed:yicineMa20巧y论文独创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研巧工作所取得的成果。尽我所知,除

3、了文中特别加注和致谢的地方外,学位论文中不包含其他个!^标人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得四川农业大学或其它教育机一构的学位或证书所使用过的材料。与我同工作的同志对本研巧所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研巧生签名:《年^月曰i关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留,;学校有权保留并向国家有、使用学位论文的规定即关部口或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅,可y、采用影印、缩印或扫描等复制手段保存>、、汇编学位论文。同意四川农业大

4、学可1^1用不同方式在不同媒体上发表传播学位论文的全部或部分内容。□本论文不保密。□本论文保密,在解密后适用本授权。__年□内划""(请在W上V)"研究生签名;〇年^々八1^月/若曰导师签名:年月曰如作重少//文摘要布鲁巧菌病(Brucellosis)是由布鲁氏菌航0属的细菌侵入机体引起一的类全球性分布的传染-变态反应性人畜共患传染病。该病不仅会给畜牧业带。来重大的经济损失,还严重危害人类健康依据对宿主偏好性、培养特性W及生物学特性的不同,将布鲁氏菌分为6个经典的种,分别为牛种、羊种、

5、猪种、犬种、绵羊附睾种和沙林鼠种,其中牛种和羊种是最为常见的人布病的病原体。目前布鲁氏菌的分型方法主要有表型分型和基因分型,其中基因分型方法在布鲁巧菌快速种型鉴定,病原的溯源分析W及菌株之间的差异与联系等方面起到一。了重要作用本研究旨在寻找种快速、分辨率高的分型方法,对布鲁民菌临床分离株进行基因分型,分析菌株的遗传多态性,建立菌株之间的系统发育关系,为我国布鲁氏茵病的分子流行病学和病原溯源研究提供依据。本研究通过收集临床分离的23株布鲁氏菌,综合运用16SrDNA、AMOS-PCR、改良后的多位

6、点序列分型MultiplelocussequencetinMLST|y>(ypg,):及多位点可变数目串联重复序列分析(Multilocusvariablenumbertandemrepeatanalysis,MLVA)等技术,对布鲁氏茜进行基因分型,分析各方法的特点并探讨临床分离株的遗传进化关系。23株布鲁氏菌分离株的1化rDNA序列经BLAST比对后,结果显示与布鲁;上。核酸序列相似性达到了99氏菌的同源性最高9%.85%,达到了91^1,但不能-PC民对23株区分种、型。采用AMO

7、S布鲁氏菌分离株进行种型鉴定,其中22株为羊种1、2或3型。1株为牛种1、2或4型。为了提高MLST方法的分析效率,本研究通过重新巧计引物,加长扩增产物长度,使扩增产物的长度在巧Obp左右,建立了改良型MLST方法(EMLST)。传统MLST方法(CMLST)九个基因的有效序列长度在422bp至589bp之间,而改良型MLST方法的有效序列长度在611bp至759bp之间,改良型MLST方21b-302b法每个基因参与分型的有效序列长度增加了1pp,增加的比例在24的%-71..56%么间。对23株

8、布鲁氏菌进行了0的1^8了和6^化8了的分析〇]^化31,方法定义了5个ST型,EMLST方法定义了10个ST型。九个基因中,挪:、gyr公和基因増加了1个基因型。多态性位点的数量与该基因型别的多少成正1比,通过加长每个基因的扩增序列,4个

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