鹦鹉热嗜衣原体急性感染与持续性感染差异表达基因筛选

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时间:2019-03-15

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3、2委:员李巧玉,教授,硕导,南华大学委3:员陈超群,,副教授,硕导南华大学4委员硕导南华大学:陆春雪,副教授,,;15年月2日答辩日期2052南华大学学位论文原创性声明本人声明,所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得。的研究成果尽我所知,除了论义中特别加1^^示注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得南华大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在论文中作了明确的说明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。作者签名-;年王月巧

4、日南华大学学位论文版权使用授权书本学位论文是本人在南华大学攻读硕±学位期间在导师指导下完成的学。本论文的研究成果归南华大学所有位论文,本论文的研究内容不得其它单。、位的名义发表本人同意南华大学有关保留使用学位论文的规定,即:学校,允许学位论文被查阅和借阅有权保留学位论文;学校可W公布学位论文的全部或部分内容,^1采用复印、缩印或其它手段保留学位论文可1;学校可根据国家或湖南省有关部口规定送交学位论文。同意学校将论文加入《中国优秀博硕±学位论文全文数据库》,并按《中国优秀博硕±学位论文全文数据库出版章程》规定享受相关权益。同意授权中国科

5、学信息技术研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》,并通过网络向社会公众提供信息服务。对于涉密的学。位论文,解密后适用该授权^:夺签日作者名月^:>心0导师签名年月皆I^鹦鹉热嗜衣原体急性感染与持续性感染差异表达基因筛选摘要:[目的]基因芯片检测鹦鹉热嗜衣原体(Chlamydophilapsittaci,Cps)急性感染与持续性感染的差异表达基因,筛选与Cps6BC持续性感染有关的关键基因,探讨Cps持续性感染发生的可能分子机制。[方法]1.Cps6BC诱导细胞的急性感染:用Cps6BC标准株感染HeLa细胞,培养2h后从培养箱中取出,

6、吸弃感染液,更换为DMEM+10%FBS,37℃培养。2.Cps6BC诱导细胞的持续性感染:用Cps6BC标准株感染HeLa细胞,并在感染液中加入35ng/mLrhIFN-γ,培养2h后从培养箱中取出,吸弃感染液,更换为含35ng/mLrhIFN-γ的衣原体生长培养基,37℃培养。3.分别收集6、12、24、36、48、60hCps6BC急性感染与持续性感染的HeLa细胞,提取CpsRNA后,采用Agilent8×15KCps全基因组表达谱芯片检测、比较分析急性感染与持续性感染中Cps的差异表达基因,然后用AbsoluteFoldchange≥2为显著上调,Foldch

7、ange≤0.5为显著下调,同时Flag标记为Detected的标准进行差异基因筛选,运用GO分类、KEGG代谢通路及DAVID在线软件对差异基因进行功能聚类及通路分析,并通过Realtime-PCR确证部分差异基因。[结果]通过比较Cps急性感染与持续性感染,发现在12~60h共有持续性感染差异表达基因287个,包括74个表达上调基因,以及213个表达下调基因,GO分类的BP分析显示,21个持续性感染表达上调基因参与1个与翻I译相关的BP分类“translation”,EASEscore为3.58E-09,58个持续性感染表达下调基因参

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