基于基因芯片分析的药物分子作用靶标预测

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1、学校代码：10200研究生学号：2012102542分类号：TP31L5密级：无硕士学位论文基于基因茂;•分析的苗物分子作用测Predictionofmultipledrugtargetinteractionsbasedonmicroarraydataanalysis作者.•董艳指导教师：黄艳新一级学科：软件工程二级学科：软件工程研究方向：生物信悤学学位类型•.学术硕士一士』c;‘二.，、:.东北师范大学学位评定委员会2015年e月独创性声明本人郑重声明：所提交的学位论文是本人在导师指导下独立进行研究工作所取得的成果。据我所知，除了特别加以标注和致谢

2、的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果。对本人的研宄做出重要贡献的个人和集体，均己在文中作了明确的说明。本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：H日期：__^学位论文使用授权书本学位论文作者完全了解东北师范大学有关保留、使用学位论文的规定，即：东北师范大学有权保留并向国家有关部门或机构送交学位论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权东北师范大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或其它复制手段保存、汇编本学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：指导教师签名

3、：^务咏T日期：b�8日期：^'亡*/•f学位论文作者毕业后去向：工作单位：电话:通讯地址：由口编：摘要癌症被称为人类第一杀手。癌症的发生发展过程涉及多种分子功能和生物学过程，研究与这些分子功能和生物学过程相关的基因表达模式及其相互作用关系，在肿瘤发生途径以及抗肿瘤药物作用机制方面具有重要意义。组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi，HistoneDeacetylaseInhibitor）可以通过组蛋白去乙酰化酶（HDAC，HistoneDeacetylase）活性造成组蛋白乙酰化/去乙酰化失衡，引起染色质重构，进而调控基因的表达，在真核生物细胞的发育、

4、表观遗传基因和基因表达调控等方面发挥重要作用。尤其是，HDACi可选择性诱导癌症细胞凋亡，因而被广泛地用于抗肿瘤药物研究。伏立诺他（Vorinostat/SAHA）是第一个被美国食品药品管理局（FDA）批准的可以用于皮肤T细胞淋巴瘤治疗的HDAC抑制剂。尽管实验证实SAHA可以选择性诱导多种癌症细胞的凋亡，但其凋亡诱导的作用机制尚未完全阐明。本文对SAHA处理的正常人皮肤纤维细胞和转化的人皮肤癌症细胞（癌症细胞）的时序性芯片数据进行分析，采用一种改进的Kruskal-Wallis秩和检验（H-scorere方法）研究SAHA对不同细胞通路内与通路外的

5、基因表达一致性的影响，研究发现SAHA处理使肿瘤细胞中与代谢、有机体组成、细胞周期调控等功能相关的通路内基因表达模式发生变化。通过基因通路分析软件IPA以及差异表达基因功能富集分析，进一步确定SAHA是通过调控DNA损伤修复、细胞周期以及线粒体细胞凋亡等多个信号转导通路诱导细胞的凋亡。最后，本文预测分析了SAHA作用的主要靶标（或通路）以及这些靶标（或通路）间的相互作用关系。关键词：基因芯片；H-score方法；DNA损伤与修复；线粒体功能障碍；细胞凋亡IAbstractCancerisknownas"thefirstkillerofhumanbei

6、ngs".Occurrenceanddevelopmentofcancerinvolvemanymolecularfunctionsandbiologicalprocesses.Studyontheexpressionpatternandinteractionofthegenesinvolvedinthesemolecularfunctionsandbiologicalprocesshasimportantsignificancetorevealthetumorigenesispathwayandthemechanismofactionofantit

7、umordrugaction.HistoneDeacetylaseInhibitors(HDACi)playacriticalroleintheprocessofeukaryoticcellgrowth,epigeneticmemoryandregulationofgeneexpressionviatheinhibitionofHDACactivitywhichresultsintheimbalanceofhistoneacetylationanddeacetylationandthechromatinremodeling.Especially,HD

8、ACicanselectivelyinducetumorcellapoptosisandthusiswide