草鱼GH基因3′部分序列多态性与生长性状及肌肉成分的相关

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1、第41卷第9期水产学报Vol.41,No.92017年9月JOURNALOFFISHERIESOFCHINASept.,2017文章编号:1000-0615(2017)09-1329-09DOI:10.11964/jfc.20160910546草鱼GH基因3′部分序列多态性与生长性状及肌肉成分的相关性分析王沈同，张猛，沈玉帮，李家乐*(上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室，上海201306)摘要：为了解草鱼GH基因多态性与早期生长性状及肌肉成分的相关性，实验利用直接测序法从156尾草鱼GH基因的3′部分序列中共筛选到9个变异位点(分

2、别命名为SNP1~SNP9：G2825A、G2914T、T2966G、A3002T、T3022C、A3301G、C3463T、C3547T、C3620T)。卡方检验结果显示，9个位点均未显著偏离Hardy-Weinberg平衡，且均表现为中等多态性(0.25

3、对草鱼GH基因中9个SNPs多态性与早期生长性状和肌肉成分进行相关性分析，发现SNP2和SNP3位点的纯合突变型在体质量、体长和粗脂肪性状上均显著高于野生型和杂合突变型；在双倍型分析时得出了相似的结果，同时含有SNP2和SNP3位点纯合突变的双倍型组合在生长和粗脂肪性状上均显著性高于其他组合。研究表明，草鱼GH基因中SNP2和SNP3位点与早期生长性状及肌肉成分存在显著性相关，可作为草鱼生长及肉质改良的候选辅助分子标记，并且为进一步对相关变异位点的功能验证奠定研究基础。关键词:草鱼；GH基因；多态性；生长性状；肌肉成分中图分类号:Q785；S965文献标

4、志码:A草鱼(Ctenopharyngodonidella)隶属于鲤形目(AFLP、RAPD、RFLP、SSR)，其具有数量多、(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、草鱼属，和分布广泛、遗传稳定、可进行自动化检测等优鲢(Hypophthalmichthysmolitrix)、鳙(Aristichthys点，已成为研究表型和基因型之间关联的最好nobilis)、青鱼(Mylopharyngodonpiceus)一起构成载体[3]。我国著名的“四大家鱼”。草鱼已有1700多年的养生长性状包括体长、体质量、肌肉成分含殖历史[1]，201

5、4年，其年产量在世界淡水鱼品种量等，是水产品重要的经济性状之一，性状的中名列第一[2]。虽然中国的草鱼产量高，但由于优劣将会直接影响其经济价值[4]。生长激素其个体大、难操作、性成熟周期长等原因，至(GH)作为一种脑垂体前叶合成并分泌的单链多今还没有人工选育出性状优良的新品种。利用肽，具有广泛的生理作用，对动物的躯体生长分子标记进行辅助育种可以缩短育种的年限、有着重要的作用[5]，生长激素能促进鱼类肌肉中提高育种的效率、加快新品种的育成，这成为蛋白质的合成，并能促进骨骼的生长和性腺的目前动物育种过程中的重要辅助手段之一。成熟，提高饵料的转化率[6-7]，

6、在现有的研究中SNP作为第三代分子标记，比起传统的分子标记已发现鲫(Carassiusauratus)、牙鲆(Paralichthys收稿日期：2016-09-19修回日期：2017-03-03资助项目：现代农业产业技术体系专项(CARS-46-04)；上海市工程中心提升项目(16DZ2281200)；通威产学研项目(TW2014F003)通信作者：李家乐，E-mail：jlli2009@126.comhttp://www.scxuebao.cn1330水产学报41卷olivaceus)、半滑舌鳎(Cynoglossussemilaevis)GH基1.3

7、草鱼GH基因变异位点筛选及验证因的多态性与生长性状具有显著性相关[8-11]，而草鱼GH基因的cDNA(GenBank登录号：草鱼的生长性状及肌肉成分与GH基因多态性之JN711124.1)和DNA(GenBank登录号：X60419.1)间的相关分析未见报道。已有相关研究发现，序列从NCBI上获取，运用Primer5.0软件设计引草鱼载脂蛋白A-I-1基因3′端存在着与其生长性状物，上游引物：5′-CTAGTTTTCTGAAGCCTCC相关的SNPs[12]，褚敏等[13]也发现大通牦牛G-3′，下游引物：5′-TGGTCATTTTTTTCGGTCMy

8、oD1基因3′端SNPs的多态性与生长性状有关，C-3′，选取10尾草鱼进行草鱼