生物信息学研究分析软件

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1、生物信息学软件配置必须在满足课题分析需求的前提下，具备更快，更灵活，更系统性的进行大规模数据的处理和管理能力。同时最重要的要让拥有较少计算学，生物信息学背景的生物学家们更好的使用软件，查看，分析，管理自己的科研数据，世界领先的生物信息分析方案供应商CLCBio的高通量测序解决方案-CLC基因组平台（CLCGenomicsWorkbench/Server）比较好的解决了这些分析瓶颈。比较一些主流的生物信息学分析软件，它同时具备如下优势：1、支持目前所有主流测序平台的数据和操作系统包括Sanger,454,

2、IlluminaGenomeAnalyzer,Helicos，IonTorrent/Proton以及Solid。无论是从头测序，重测序，还是RNA-Seq或者Chip-Seq,甚至是多平台混合数据分析，CLC高通量数据分析平台都能帮你快速完成高质量的专业数据分析并提供丰富的图表报告。在Linux，Windows，Macs不同操作系统下都可以流畅运行。1Sanger2、强大的生物信息学分析功能和综合性分析工具CLC高通量数据分析平台能够高效的提供Sanger和高通量测序数据的mapping、从头组装、基因

3、组的SNP和DIP检测、ChlP-seq分析、RNA-seq分析、小RNA分析等一体化工作流程的解决方案。拥有近100多种执行下游分析和设计相应实验的工具，集成了的分析工具包括：基因表达分析、Primer设计、分子克隆、标签表达谱、BLAST、EST程序库的构建、Alignment、系统树、先进的RNA预测和编辑、结合3D分子分析、蛋白质二级结构的预测等。23、美观、友好的可视化操作界面，丰富的图表结果针对生物学家，设计了美观的可视化界面和简易的操作界面，无需运行复杂的生物信息命令脚本，就可直接进行分析

4、。方便用户查看关于Contig的各类统计学图形报告和分析结果。3丰富的图表结果可以直接用于科研交流和文章的撰写4、大大提高了大规模数据序列拼装的质量和分析速度最新的SIMD加速拼装算法，大大提高了大规模数据序列拼装的质量和速度：439,000reads的E.Coli基因组重测序拼装只需要不到3分钟（2GB内存双核，2.13GHz，32位PC机）。8600万pairedendreads的人基因组重测序只需要不到7个小时（32GB内存8核，2.5GHz，64位PC机）。自建适合自己个性化分析流程的workf

5、low，随用随调。45、提供服务器Server和云计算解决方案服务器计算资源的分布--拥有灵活队列系统的中枢执行平台，合理分配计算资源和服务设计；服务器共享数据管理--保存数据在中枢存储器上。可以是文件系统、CLC生物信息学数据库或用户定制设计的数据库结构。云平台的运算解决方案—基于GenomicsServer的云计算解决方案。56、保证数据安全性，同时具备可定制化和可扩展性数据安全性--基于三层架构的系统，设置管理权限和数据加密，确保数据的安全。可定制化--在确保数据安全的同时，易于操作，兼容与其它分

6、析工具或资源的整合，例如Soap，Velvet。根据个体科研研究的差异性，应用我们的SDK（软件开发工具包）或各种命令行工具可实现客户端和服务器端的高度定制化，满足个性化的深度分析需求；可扩展性--随着需求的改变，可以实现CLC服务器节点支持下的高度可扩展性。即在现有软件架构上，通过提高计算节点，增加客户端等方式可轻松实现数据分析能力和服务群体的性能提升和扩容。7、完善的产品售后支持和培训丹麦CLCBio作为世界领先的生物信息方案供应商，产品使用出现任6何问题用户可实时提交运行错误代码给CLCBio售后

7、，在正常工作日，即可及时得到CLCBio公司产品工程师的快速回复和解决方案建议。同时CLC中国区总代理---北京路思达生物信息科技有限公司在产品售出后，免费提供1年时间的产品技术培训和售后支持服务。更多内容请参看公司官网：www.lucidusbio.com丹麦CLCBio公司---CLCBio为世界领先的生物信息方案供应商。CLCBio的高通量测序解决方案-CLC基因组平台（CLCGenomicsWorkbench/Server），可同时支持多种测序平台的数据结果，包括Sanger，Roche454，

8、IlluminaGenomeAnalyzer，Helicos，Solid，IonTorrent以及Pacificbioscience的PacBioRS等所有主要测序平台的基因组、转录组和表观遗传学数据。让生物学家通过一个美观可视化，简易操作界面，能快速准确的得出丰富的生物学图表报告；目前全球已有超过2000多家实验室，科研院所，农业制药等研发公司在使用CLCBio提供的产品及服务。更多内容请参看CLCBio公司官网：www.clcbio.c