chemdraw的使用方法

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1、Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.ChemDraw使用指南(6.0&7.0版)陈华祥、马汝建药明康德新药开发有限公司一、Chemdraw界面简介Scheme1：Chemdraw界面(6.0&7.0)打开Chemdraw6.0（图左），将可以看到其标准界面如（Scheme1），蓝条下第一排为主菜单，从左到右依次有：“File”，“Edit”，“Tools”，“Tools”等。第二排为工具栏，为一排图标，从左到右依次有：“新建”，“打开”，“复制”等快捷工具图标。左边印有“T

2、ools”的可移动长条为工具条，我们将主要使用它来绘制结构，其功能在以下应用时可看到。如果需要，您还可在主菜单“Tools”中选“ShowCrosshair”，“ShowRulers”将分别显示绘图网格和标尺。Chemdraw7.0界面（图右）基本一样，少了一个“Estimate”，其中的功能放到了“Structure”中；并且“Tools”改名为“View”，功能差不多。两个版本各主菜单中的内容小有差别。二、新建Chemdraw文档我们公司要求使用统一的Chemdraw格式（见Scheme2，“File”主菜单下，“Dra

3、wingSettings”,“CaptionTextSettings”and“LabelTextSettings”；7.0版本中，其功能被整合成“DocumentSettings”活页夹的形式，见Scheme2上排右边），这个格式可在内部网上下载，文件名为“pharmatech.cds”，建议大家把它存在桌面上，应用时双击打开即可。如果要将它应用到已有的Chemdraw文档中则可参照以下操作：依次点击主菜单“File”“ApplySettings”“Other…”随后会弹出一个对话框，选择您所存的文件药明康德内部保密资料第1

4、页共15页Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.“pharmatech.cds”打开即可（见Scheme3）。注意：字体不能自动被应用，需要自己手动调整。不过，因为字体是统一的“Arial10号字”，所以，全选后，统一调整即可。Scheme2:“页面设置”“结构式格式设置”，“文档中文字格式设置”和“结构式中的文字格式设置”Scheme3:应用标准格式到已有Chemdraw文档中三、结构绘制格式定好后就可以进行结构绘制了，Chemdraw的操作比较简单、方便，基本上只需应用工

5、具条（Tools）中的功能就可以将一幅完整的结构式绘出，其中的功能大都比较简单明了，简要介绍如Scheme4。药明康德内部保密资料第2页共15页Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.135791113151719212324681012141618202224Scheme4：Tools功能介绍（依次为上下左右）按钮1、选定结构（呈方框状选定）；2、选定结构（自由圈定，和1配合使用）；3、删除；4、单键（在两个原子之间重复使用即为双键，再重复则为三键）；5、在结构中输入文字；6

6、、虚线；7、画曲线；8、粗虚线；9、箭头（各式各样）；10、虚楔形线（用于手性中心）；11、纺锥形；12、粗实线；13、括号（各式各样，其中一头细一头粗的椭圆方形常用于目标分子的圈定）；14、粗楔性实线（用于手性中心）；15、在原子上标电子（自由基等）或正负电荷；16、空心楔形键；17、不同角度圆弧；18、配位键；19、？？；20、波浪线（用于不确定的手性原子）；21、？？；22、？？；23、模板（内有极丰富的结构模板：氨基酸、糖、RNA、DNA、构象等等）；24、画长链；25以下很直观略。绘图技巧：a.在画结构中，使用任何

7、画结构的功能时，您只需在您指定的地方点一下，这样它将自动形成默认的效果（键角，形状等），而不必用鼠标拖着，这样反而不能保证您画出结构是想要的效果。b.当要对某原子进行编辑时（如：延伸碳链或输入元素符号），光标所到处一定会变黑，如果没变黑则编辑没到位，即您想接上的原子或链没有到位，在Chemdraw中会显示红色。换句话说，只要您画的结构在Chemdraw中呈红色，那您画的结构肯定哪里出错了，赶紧检查吧。（参Scheme5）Scheme5：欲被编辑的原子呈黑色；出错的结构呈红色（左，苯环）；欲移动的结构呈闪烁的虚线（右，环己烷）

8、药明康德内部保密资料第3页共15页Chemdraw使用指南(6.0&7.0版)WuXiPharmaTechCo.,Ltd.c.当您欲移动某个结构时，您将它选定后会呈闪烁的虚框（参Scheme5），这时您就可以自由移动它了。当结构比较大时，有时很难一下将其圈住，这时您可以只圈住结构的一部分，