背角无齿蚌不同组织的基因组DNA甲基化分析

《背角无齿蚌不同组织的基因组DNA甲基化分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、生态环境学报2009,18(6):2011-2016http://www.jeesci.comEcologyandEnvironmentalSciencesE-mail:editor@jeesci.com背角无齿蚌不同组织的基因组DNA甲基化分析1，21，2*曹哲明，杨健1.南京农业大学无锡渔业学院，江苏无锡214081；2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心//中国水产科学研究院内陆渔业环境与资源重点开放实验室，江苏无锡214081摘要：用甲基化敏感扩增多态性（MSAP）对背角无齿蚌（Anodon

2、tawoodiana）腮、唇瓣、闭壳肌、外套膜和斧足五个组织基因组DNACCGG区域的甲基化水平进行了分析。结果表明，背角无齿蚌腮基因组DNA甲基化比例为47.9%，唇瓣甲基化比例为35.5%，闭壳肌甲基化比例为50%，外套膜甲基化比例为46.3%，斧足甲基化比例为56%；基因组中CCGG区域存在甲基化现象。不同组合甲基化比例不同说明该区域甲基化可能参与到基因的调控中。通过比较不同地点的采集的背角无齿蚌，发现污染严重地区(太湖三山岛水域)采集到的样品和非污染地区（南泉养殖水域）采集的蚌样甲基化区域略

3、有变化。其中的相关性有待进一步的研究。关键词：背角无齿蚌；甲基化；甲基化敏感扩增多态性中图分类号：171.5文献标识码：A文章编号：1674-5906（2009）06-2011-06[16]背角无齿蚌（Anodontawoodiana）属软体动物auratus）基因组DNA甲基化水平的影响；王丙莲门，瓣鳃纲，蚌科，为我国常见的种类，广泛分布等用高效液相色谱分析了镉、铅等对泥鳅于各省的江河、湖泊、水库、沟渠及池塘中。前苏（Misgurnusanguillicaudatus）基因组DNA甲基化水[17]

4、联、日本、朝鲜、泰国、柬埔寨、印度境内也有分平的影响；Vandegehuchte等分析了镉对大圣虱布。肉可食，也可以作为鱼类、禽类、家畜的饲料；（Daphniamagna）基因组DNA甲基化的影响。结果有的地区用为淡水育珠蚌。目前国内关于背角无齿一致认为重金属离子可以对这些动物的基因组蚌的研究报道主要集中在重金属或有机农药的积DNA甲基化产生影响。现已表明从细菌到植物和真[1-5][6-7][8-9]累和毒理学、及其免疫学、形态学、饲养菌、从无脊椎动物到脊椎动物等几乎所有生物体内[10-12]驯化等

5、方面。国外对该种的研究相对较少，更都存在DNA启动子CpG岛甲基化，只是不同物种甲多的是对相同属中其它种重金属和有机污染物的基化方式和作用不尽相同而已。由于大部分甲基化[13-14]积累方面。背角无齿蚌在重金属及其他污染物研究报道集中在脊椎动物上，无脊椎动物这方面的监测和毒理研究方面具有很大的优势，已被笔者的研究比较少，所以甲基化在无脊椎动物基因调控中研究室用做“淡水贝类观察”的生物指示贝种。然而，的作用仍需进一步深入研究。有关该种类种群遗传，基因表达调控等方面却鲜见对基因组甲基化进行整体研究的技术

6、最常用研究。这些背景知识的不足可能会阻碍对该种类在的是甲基敏感扩增多态性技术（MethylationSensi-污染物生物积累和毒理学方面机理的解释，也可能tiveAmplifiedPolymorphism，MSAP），该方法是限制它在相关领域进一步的应用前景。AFLP技术的延伸，利用具有相同识别位点（CCGG）前述的研究显示，背角无齿蚌及相关种类可以的不同限制性内切酶（HpaⅡ和MspⅠ）对目标位积累和残留较高浓度的重金属等污染物，而这种积点甲基化与否的敏感性不同，对基因组消化的结果累和残留有可能

7、对其基因表达产生一定的影响。重有差异，在连接上设计好的接头，通过特异扩增不金属污染和基因组的相互作用会涉及到基因组表同的图谱，以辨别哪些位点存在甲基化。该技术有观修饰，其中甲基化是基因组DNA的一种主要表观效地检测出了猪（Susscrofadomestica）、牛（Bos[18-19][20]遗传修饰形式，是调节基因组功能的重要手段。有tarurs）、水稻（OryzasativaL）等基因组关重金属对水生动物基因组DNA甲基化的影响，国DNA甲基化状态。然而相关方法是否在贝类研究上[15]内、国外已

8、有一些相关研究报道。如周新文等分完全适用，尚待进一步确认。析了铜、锌、铅、镉等重金属离子对鲫鱼（Carassius本研究利用甲基敏感扩增多态性技术对背角基金项目：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2009JBFB02)；江苏省自然科学基金项目(BK2006030)作者简介：曹哲明（1972年生），男，副研究员，博士，从事渔业种质资源保护以及水产动物遗传育种研究。E-mail:caozm@ffrc.cn*通讯作者：杨健，E-mail:jiany@ffrc.