大岩桐花萼和幼叶转录组研究

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1、园艺学报，2015，42(12)：2519–2525.ActaHorticulturaeSinicadoi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0105；http：//www.ahs.ac.cn2519大岩桐花萼和幼叶转录组研究1121,*费元，韩雪，余红，庞基良12（杭州师范大学生命与环境科学学院，杭州310036；杭州市农业科学研究院生物技术研究所，杭州310024）摘要：利用新一代高通量测序技术平台IlluminaSolexaGAⅡx对大岩桐花萼和幼叶进行转录组测序和数据从头组装

2、及生物信息学分析，获得了长度大于100bp的转录物22821条；转录本总长度28.63Mb，N50长度1548bp，序列平均长度953bp。转录物注释结果显示，15053条有同源比对信息；7768条无匹配序列信息，可能为大岩桐特有的基因序列。通过对花萼、幼叶中与激素代谢、信号转导相关的差异KEGG通路比较，推断在花萼中促进生长激素合成基因的表达比幼叶中强，激素信号转导组分基因的表达也比幼叶中强。关键词：大岩桐；花萼；幼叶；转录组；生物信息学分析中图分类号：S682文献标志码：A文章编号：0513-353X（20

3、15）12-2519-07SequencingandCharacterizationofTranscriptomeofSinningiaspeciosaSepalsandYoungLeaves1121,*FEIYuan，HANXue，YUHong，andPANGJi-liang12（CollegeofLifeandEnvironmentalSciences，HangzhouNormalUniversity，Hangzhou310036，China；InstituteofBiotechnology，Hangzho

4、uAcademyofAgriculturalSciences，Hangzhou310024，China）Abstract：ThetranscriptomeofSinningiaspeciosasepalsandyoungleaveswassequencedbyusingIlluminaSolexaGAⅡx，andthefunctionalannotationsandmetabolicpathwayanalysesofsomeunigeneswereconductedinthisstudy.And22821uni

5、genes，longerthan100bp，wereobtainedbydenovoassemblymethod.Thetotalscaffoldsequencelengthreached28.63Mbwiththe1548bpofN50，theaverageunigeneslengthwas953bp.Annotationanalysisofunigeneindicatedthat15053unigeneshadhomologinpublicproteindatabase；However，7768sequen

6、ceswerenohitandmightbeSinningiaspeciosaspecific.ThestudyofdifferentKEGGpathwaysrelatedtohormonemetabolismandsignalinginsepalsandyoungleaves，inferredthattheexpressionofhormonesynthesisgenesofpromotinggrowthinsepalsisstrongerthaninleaves，sowastheexpressionofth

7、esignaltransductioncomponentgenes.Keywords：Sinningiaspeciosa；sepal；youngleaf；transcriptome；bioinformationanalysis植物开花机理是植物学科的研究热点。利用拟南芥、金鱼草等模式植物已克隆了上百个与开化诱导、开花时间、花分生组织形成、花器官形成、花形等相关的基因（Xu&Chong，2002），并提出了花器官发生的“ABCDE”模型（Krizek&Fletcher，2005）。但仍存在许多需要进一步探索的问收

8、稿日期：2015–06–02；修回日期：2015–12–11基金项目：国家自然科学基金项目（31071818）；浙江省重点科技创新团队项目（2010R50039）*通信作者Authorforcorrespondence（E-mail：pangrenshuiliang@aliyun.com）FeiYuan，HanXue，YuHong，PangJi-liang.Sequencingandc