垂体双向凝胶电泳图谱的计算机分析

《垂体双向凝胶电泳图谱的计算机分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、万方数据第4卷第2期2000年6月生命科学研究LifeScienceResearchV01．4No．ZJun．2000文章绾号：l007—7847(2000)02一oll806小鼠垂体双向凝胶电泳图谱的计算机分析张晓元，廖艳阳，梁宋平(湖南师范大学生命科学学院，中国湖南长抄4l008I)摘要：以小文垂体蛋白盾为材料．用固相pH梯度等电聚焦和sDs-pAGE获得蛋白质组兢向囊腔电泳图谱．以已知等电点和相对分子质量的外标和内标做为参照物．经过PDQuEsT软件对凝艘阗像进行计鼻机分析，获得了小鼠垂体蛋

2、白质组的等电点、相对分子质量和相对音量等枣敷．关键词：小爰垂体；2一DPAGE图谱}计算机分析；蛋白盾组中围分类号：Q5L2．7；Q959．837文献标识码：AComputerAnalysisof2一DPAGEImagesofMouseHypOphysisProteomeZHANGXia。一yuan，LIAoYan—yang，LIANGSong—ping(CoUegeofLifeScknces，HunanNormalUniversjty，Cha“gsha4L0081，Hunan，China)Abs

3、t瑚ct：Employingisoelectr．cfocusingonimm。biIizedpHgradientsfonowedbySDS—PAGE，asilverstained2D—gelofmousehypophys-s啪sobtained．Theim89eofthe2D—gelwasprocessedbycomputer．Theproteinspotsweredetectedan奏主￡i摹蠹j：jt李毫§；』i匡主薹毫要善趔5

4、i}N÷；i茎jj妻ij—i；型；g￡：≥蠹?主；jj蠢雪薹ii

5、g鏊i莲jg：≤；_二!目l善§羊：；J=；j二i；；要÷；；}主；]；ii薹i‘器；4；要￡垂；；b睦震怿*羹窆；i#爿=；}￡#窜i}奏辇¨l?：§i．囊写=?=；目ij÷雪}!；}警；i掌i～；i÷州?；≤j誊§lg!iIiil攀平上的抑制；或者是通过反义链RNA和mRNA的非编码区，如s—D序列上游形成复合物，从而导致mRNA失活；或者在转录水平上起作用，如结合在编码cAMP受体蛋白DNA5’端摄外侧的反义链RNA可以类似于转录衰弱子的方式阻碍靶mRNA的转录．根据上述原理，人们设计了植物

6、病毒不同基因的反义链基因，转入植物体内，希望利用病毒的反义链RNA在控制植物病毒病中发挥作用，但所获得的转基因植物的抗病效果都不明显．晟近Nelson用TMv为材料的研究发现，只有表达病毒基因组的3’端非编码区的反义链的转基因植株才对TMv有较强的抗性o⋯．总之，利用病毒反义链RNA作为抗病毒基因工程的策略有待于进一步完善．3其他策略3．1干扰素万方数据万方数据生由科芏竹嚣口3ji羹馒冀毪垂盛挂磊营爱握塔堡55i：

7、豁爨靠薹巍鍪fg；l{ii※＆}驰～狂黝韩蓄皆冀妻蓬享黄藿摄凝?胶誉芝雾霹蔫萎昌}

8、冀；憾馐萋翳孵丽鳕∽抛型誊茬旺要拜藿薹蛙吲壤墼誊暨：蠢薯鼙争蛩器萋兰裹翻手如：卮磬篓挣t班鹱擎萋融翳曼囊要鬟曩垂型攀害蓁盎确÷得斑篱¨班霪季蟊妻霪

9、攀}}曼显鬟鬻瞄嚣j纛篓磊薰萋囊鬃嚣融篓鬟篓羹毫测斟鹫学j琵联簦曼曼馨瞽奔；鬟．D掣㈣矗蛰；蠹麓毫演薹一疆喝：毒鐾丝．基霉毫?矗L霜鳍舞Wi嚯蠢蓉薹锄藉萋豇羹鏊鲥砌中“H誊毒晴光蹙j篓营罐壹为驻粢萋蘩蓄i璺融晶萄透蒌毫孚童琶蠹鼋^器蠢藩’萄8；带娄手蠹孙越萋型熨簿渺尊在凝厨譬专庄盎馏氇：塑”骘耄斟蝥}}蕾霸副霉囊誊蠢萄．i．；齑F黔蠢笪誊是萎鏊辩掣薹斟

10、萎薹蠢葡省吲蔗灞斟蠹嚣；鍪警篓鲤夔引蛋羹壤羹，攀答黜■i草善鼬锉塑霉匹冀薯蕊辩并萎彗蛩史坠蛾孽懂囊j童霄镒塑点一簇描掣妻掘崾奏萋曼鐾兰j4。i；馏簿薹蕈愿罐显誊螽矿蠢羹”翮譬毒销甜未爨Fi象嚣、塌难霎垂善习睾帛萎∥导争薹擂薹i薹萎疆嚆憎蠹鐾i稿嚣莲蒸羁两婆篇事争；鏊彝嚣霪羹蛩霜苫罄整裂霉善鏊=墓jij=§-t“ni砻嘲遂喜誊醛㈦鬻器鞠囊!囊耋霎蠢；雾藻蒂薹羹趔幕篓攀÷g'l蠢藜被动!量毒i爹妻瑚擂毫廛囊；壁囊遴窖鼙雏孙阳¨蓦夸喜鬟五美藩冀到‘8；靳釜謇簦善雾翥譬扛鑫酗警袭孺蓦”“：薹誊建霉争}萝i

11、露磐舔坚妻囊“薹再羹j赫珀蹦攀蒜薹沈I，通蠹羹l}毒；薪蕊姜嚣美雾B垒藿弱囊蔫四篙融’5；铂n弧蓦j万方数据生命科学研究^‘，对于该斑点的肽谱和Internet的数据库中蛋白质肽谱的比较是非常有用和方便的．PDQuEsT还可对鉴定的斑点或其它的斑点根据自己的研究的需要进行命名．在建立数据库时，由于一个凝胶中的斑点多达数干，难以同时比较分析，就可以将凝胶分为多个部分进行分析，将一个部分的数据建立为一个文件，这对于比较蛋白质样品的差异以及基因表达的强度(或丰度)的研究是非常有用的．衰l