《数量遗传学》PPT课件

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1、第二章数量遗传学基础第一节群体遗传结构群体（population）：指在一定的时间和空间范围内，具有特定的共同特征和特性的个体集群。可以是一个种、亚种、变种、品种或品系等。孟德尔群体（Mendelianpopulation）：个体间可以通过交配进行基因交流的有性繁殖群体。因此，最大的孟德尔群体应该是一个种。基因频率和基因型频率基因频率（genefrequency）概念：一个群体中某一等位基因的数量占同一基因座所有等位基因总数的比例。取值范围：0～1，通常用小数表示；表示方法：小写字母，如p、q、r等；性质：全部等位基因频率之和等于1。基因型频率（geno

2、typefrequency）定义：某一基因座特定基因型占全部基因型的比例。取值范围：0~1，用小数表示表示方法：大写字母，如D、H、R等。性质：同一基因座所有基因型之和等于1。基因频率和基因型频率的关系p=D+1/2Hq=R+1/2HHardy—Weinberg定律在随机交配的大群体中，若没其它因素的影响，基因频率始终保持不变。任何一个大群体，无论基因频率如何，只要经过一代随机交配；一对常染色体基因的基因型频率就达到平衡状态；若无其它因素影响，以后一代一代随机交配下去，这种平衡状态始终保持不变。平衡状态下，D=p2H=2pqR=q2Thedistribu

3、tionofgenotypesinapopulationinHardy-WeinbergequilibriumHW定律的推广复等位基因(Multiplealleles)k个等位基因A1、A2……Ak，其基因频率分别为p1、p2……pk，可形成k种纯合基因型和k(k-1)/2种杂合基因型。遗传平衡状态下，基因频率和基因型频率的关系为:(∑pi)２=∑pi2+2∑pipj其中，∑pi2表示纯合子的频率,∑pipj表示杂合子的频率。多基因座(Multipleloci)达到遗传平衡的速度主要取决于各基因座间的连锁程度；连锁越紧密，达到平衡所需世代数越多。连锁不平

4、衡(Linkagedisequilibrium)实际观察的基因型频率偏离理论平衡频率的现象，也叫配子相不平衡（Gameticphasedisequilibrium）。它常用连锁不平衡系数（D）表示，等于实际配子频率和平衡时的理论配子频率之差。配子相(Gameticphase)或连锁相(Linkagephase)两个基因座Ａ和Ｂ，每个基因座两个等位基因，分别为A1、A2和B1、B2：可形成４种配子：A1B1、A1B2、A2B1、A2B2相引相（Couplingphase）：A1B1/A2B2相斥相（Repulsionphase）：A1B2/A2B1配子频率

5、（Gameticfrequency）：某一配子所包含的各个基因座上等位基因频率的乘积。p(A1B1)=p(A1)p(B1);p(A2B2)=p(A2)p(B2)连锁平衡（Linkageequlibrium）：一个基因座上的一个等位基因与另一基因座上的一个等位基因相互独立，即：p(AB)=p(A)p(B)连锁不平衡（Linkagedisequlibrium）：一个基因座上的一个等位基因与另一基因座上的一个等位基因不相互独立，即不同基因座的等位基因间存在非随机关联：p(AB)p(A)p(B)D=p(AB)-p(A)p(B)D的取值范围是-0.25~0.

6、25。连锁不平衡系数随世代的变化：Dt=Do(1-r)t其中，Do、Dt分别为初始和随交t个世代后的连锁不平衡系数，r为二基因座间的重组率。连锁越紧密，r越小，LD下降速度越慢，反之，越快。影响群体遗传结构的主要因素系统性因素(Systematicfactors)引起遗传结构的变化方向和量可以预测。包括选择、突变、迁移、交配方式等。选择(selection):有利基因频率增加，不利基因频率降低。突变(mutation):如突变基因具有选择优势，则其基因频率提高；如是中性突变(Neutralmutation)，则其频率大小取决于遗传漂变。迁移(Migrat

7、ion):通过不同频率的群体间基因流动引起基因频率变化。可以是单向的，也可以是双向的。交配体制(Matingsystem):例如，近交提高纯合基因型频率；杂交提高杂合基因型频率；随交则对大的遗传平衡群体的遗传结构无影响。非系统性因素(Nonsystematicfactors)引起遗传结构的变化量可以预测，但其方向是随机的，不可预测。遗传漂变(Geneticdrift):有限群体，特别是小群体中，因配子的随机抽样导致的基因频率在世代间的随机变化，称为随机遗传漂变（Randomgeneticdrift），简称遗传漂变。群体越小，遗传漂变的作用越大。第二节数量

8、性状的遗传基础性状的分类质量性状(Qualitativetraitsorchar