《RNA剪接和加工》PPT课件

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1、第五节RNA剪接和加工大多数真核生物编码蛋白质的基因是不连续基因,内元与编码序列一起被转录。因此mRNA的原初转录产物是分子量很大的前体,分子大小极不均一。这些高分子量、不均一的核内RNA称为核内不均一RNA(heterogeneousnuclearRNA,hnRNA).hnRNA经加工和选择性拼接,产生有功能的成熟的mRNA,释放到细胞质中。1细胞核内的RNA平均长度比mRNA大得多,且长短差异大,称为核不均一RNA(heterologousnuclearRNA,hnRNA)。hnRNA通常与蛋白

2、质形成核蛋白颗粒,称为hnRNP。其中蛋白组分很多。2翻译转录末端修饰剪接RNA剪接、加工均发生于核内3三类剪接系统:高等真核生物中,外显子-内含子边界、位于内含子内的短的保守序列,由一复杂的核蛋白组成的剪接器复合体对其识别,并切除内含子。有两组不同的内含子可发生自我剪接。酵母核前体tRNA内含子的切除。除核前体tRNA外,RNA的剪接都通过酯基转移(transesterification)反应切除。4(一)核RNA剪接的模式内含子两端没有长的同源或互补序列,但有极短的保守的共有序列,左端(上游)为

3、GT,右端(下游)为AG。这一现象称为GT-AG规则。在RNA中则为GU-AG。左端的位点也叫供体位点(donorsite)或者5',右端也叫受体位点(acceptorsite)或者3'。一、核RNA的剪接5原则上5′可以和任何3′位点进行剪接。剪接位点是通用的;剪接器无组织特异性。6exon-trapping7内含子切除存在优先途径原初转录物缺少内含子5、6缺少内含子4、5、6、7只有内含子3mRNA8剪接的第一步,是内含子5’端与上游外显子之间断裂;5’端与内含子中靠近3’端的一A残基2’-OH

4、形成一索套形中间产物;A所在位点称为分支位点(branchsite);第二步,在3’位点切割,释放出内含子,连接两个外显子。索套(lariat)结构9两步反应都通过酯基转移(transesterification)进行分支位点A残基2'-OH攻击5'位点上游外显子3'-OH攻击3'位点10(二)剪接体(spliceosome)剪接器含蛋白与核内小RNA,称为snRNA(核内小RNA,smallnuclearRNA),大小为100~300(高等真核生物)或者100~>1000(yeast).以核蛋白形

5、式存在。该核蛋白称为snRNPs.scRNA(胞质内小RNA,smallcytoplasmicRNA),其形成的核蛋白称为scRNPs.snoRNA(核仁小RNA,smallnucleolusRNA):参与rRNA加工。11snRNP与其它蛋白形成剪接体(spliceosome)。参与剪接的snRNA都很保守,参与剪接的snRNA为U1,U2,U4,U5,U6。每个snRNP含一个snRNA和多个蛋白,其结构核心都有一组8个蛋白。除U6外,都含有保守序列PuAU3-6GPu。snRNA的功能:参与核

6、蛋白复合体的结构构建;通过与靶位点RNA或在snRNA之间的碱基配对来执行剪接功能。12U1snRNA可直接与内含子5'位点配对,这是为剪接所必须的。13剪接体的组装和剪接过程E复合体A复合体B1复合体B2复合体C1复合体C2复合体145’ofIntron剪切与lariat的形成同步3’ofintron剪切与lariat切除,exons连接同步spliceosome解体与lariat降解同步Cut-ligate15U6与U4、U2通过碱基配对相互作用由于U4和U2都是通过与U6的同一段碱基序列互补配

7、对进行作用,因此U6/U4和U6/U2不能相容。16二、自我剪接的RNA核酶(ribozyme):通指具有催化活性的RNA。核酶P是一核蛋白,只一条与蛋白结合的RNA。RNA具有催化tRNA切割的功能;而蛋白的功能是间接的,可能是维持RNA的结构。拟病毒类小RNA可进行自切割反应。尽管是分子内反应,也可分为催化部分和底物部分。I类和II类内含子具有把自己从前体mRNA中剪接出的能力。ThomasCech,Nobelprizein198917一类内含子(GroupI)35SRNA在体外可自发剪接,内含

8、子剪下为线型,然后进一步环化。这一反应只需一种二价阳离子和鸟苷酸(GNP);GNP必须具自由3'-OH。出现于低等真核生物四膜虫核内编码rRNA的基因。在真菌线粒体中很普遍。也存在于噬菌体T4和细菌中。这类内含子具有自我剪接(self-splicing/autosplicing)的能力。18GNP的3’-OH攻击内含子5’端,形成G-内含子,和外显子部分;分离的外显子3’-OH攻击下一个外显子的5’端;释放的内含子3’-OH攻击自身5’端15碱基处。反应通过三步酯基转

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