环介导等温扩增技术

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1、环介导等温扩增技术胡星星201505112015.10.20主要内容定义原理操作步骤优缺点及定义环介导等温扩增技术(loop-mediatedisothermalamplification,LAMP)是指在等温(60-65℃)条件下,利用链置换DNA聚合酶短时间(通常<1h)内进行核酸扩增,是一种“简便、快速、精确、低价”的基因扩增方法。其检测结果可直接肉眼观察白色沉淀或者绿色荧光,是一种适合现场、基层快速检测的方法。原理扩增启动阶段循环扩增阶段延伸循环阶段扩增启动阶段FIPF3(5):有1个环状构造(Fc1末端5’端游离)的单链BIPB3(8):有2个环状构造(F1

2、末端即3’端游离和Bc1末端即5’端游离)的单链循环扩增阶段FIPF1末端延伸至形成一个环状构造(B1末端即3’端游离);FIP退火到茎环结构(8)上,引导链置换DNA合成反应,产生结构(9)的产物;随后产物(9)的B1末端即3’端自动引导链置换DNA的合成,生成产物(10)和茎环结构(8’)(与开始的产物(8)序列互补的);BIPB1末端延伸至形成一个环状构造(F1末端即3’端游离);BIP退火到茎环结构(8’)上,引导链置换DNA合成反应,产生结构(9’)的产物;随后产物(9’)的F1末端即3’端自动引导链置换DNA的合成,生成产物(10’)和茎环结构(8),产物

3、(8)开始新一轮的循环扩增。延伸循环步骤产物(10)和(10’)进入延伸循环步骤,分别形成(11)和(11’);内部引物又可以(11)和(11’)作为模板,引导链置换DNA的合成,使产物的序列不断延伸、环化、再延伸,最终的产物是一些具有不同茎长度茎环结构的DNA和带有许多环的折叠结构的DNA的混合物。LAMP法实验室常规操作步骤抽取、提纯样本DNA或RNA环介导等温扩增技术(LAMP)法扩增实时浊度检测或目视检测绿色荧光优缺点优点:灵敏度高(比传统的PCR方法高2~5个数量级);反应时间短(30~60分钟就能完成反应);临床使用不需要特殊的仪器(试剂盒研发阶段推荐用实

4、时浊度仪);操作简单(不论是DNA还是RNA,检测步骤都是需将反应液、酶和模板混合于反应管中,置于水浴锅或恒温箱中63℃左右保温30~60分钟,肉眼观察结果)。缺点:灵敏度高,一旦开盖容易形成气溶胶污染,故在进行试剂盒的研发过程中可采用实时浊度仪,不要把反应后的反应管打开;引物设计要求比较高,有些疾病的基因可能不适合使用环介导等温扩增方法。应用LAMP技术因其快速、高效、特异、灵敏和经济等优点,已经应用于病原菌、寄生虫、病毒、疾病和转基因产品检测等领域,并且还将广泛应用于临床诊断、环境监测、食源安全等领域,具有更为广阔的发展应用前景。

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