质粒提取步骤

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1、煮沸法快速提取质粒以及DNA酶解和琼脂糖电泳一.实验目的:1、掌握质粒DNA分离,纯化的原理2、学习煮沸法快速提取质粒DNA的方法3、学习DNA的限制性酶切的基本技术4、学习利用琼脂糖电泳测定DNA片段的长度二、实验原理在基因工程中,DNA分子的切割是由限制性内切酶来完成的。限制性内切酶能识别特定的DNA序列,在一定的条件下切断双链DNA。限制性内切酶的作用效率是受多方面因素影响的,如反应温度,缓冲体系,离子种类与浓度,DNA的纯度和甲基化程度等。对DNA进行酶切时,首先要选择适合的缓冲液。对于单酶切,应选用该酶的最适缓冲液

2、;对于双酶切或三酶切,应选用一种能使所有酶都充分作用的缓冲液。DNA的纯度对于酶切的效果的影响也很大,因为蛋白质。酚。氯仿。SDS等杂质都会抑制限制性内切酶的活性。琼脂糖凝胶电泳是分离,鉴定和纯化DNA片段的常规方法。利用低浓度的荧光嵌入染料-溴化乙锭进行染色,可确定DNA在凝胶中的位置。如有必要,还可以从凝胶中回收DNA条带,用于各种克隆操作。琼脂糖凝胶的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范围较广。用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长度为200bp至近50kbp的DNA。长度100kb或更大的DNA,可以通过电场方向呈周期

3、性变化的脉冲电场凝胶电泳进行分离。在基因工程的常规操作中,琼脂糖凝胶电泳应用最为广泛。它通常采用水平电泳装置,在强度和方向恒定的电场下进行电泳。DNA分子在凝胶缓冲液(一般为碱性)中带负电荷,在电场中由负极向正极迁移。DNA分子迁移的速率受分子大小,构象。电场强度和方向,碱基组成,温度和嵌入染料等因素的影响。三.实验材料和试剂:1.菌种:含pUC18的大肠杆菌JM107菌株。2.化学试剂和溶液(1)LB培养基:NaCl10g/l酵母提取物5g/l胰蛋白胨10g/l氨苄青霉素50μg/ml(培养基灭菌后加入)pH7.0(2)7

4、0%乙醇(-20℃)及无水乙醇(-20℃)(3)STET缓冲液(pH8.0)(8%蔗糖,0.5%Triton,50mmol/LEDTA,,10mmol/LTris)(4)5%CTAB(十六烷基三甲基溴化氨)(5)1.2M氯化钠(6)TE缓冲液(10mmol/LTris-HCl,1mmol/LEDTA)(7)电泳缓冲液(50XTAE)Tris242g,冰醋酸57.1ml,EDTA(0.5mol/LpH8.0)100ml使用时用蒸馏水稀释50倍。(8)样品缓冲液(6X)0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,40%(W/V)蔗糖(

5、9)溴化乙锭10mg/ml(10)琼脂糖(电泳级)(11)限制性内切酶(12)溶菌酶(50mg/ml,溶于10mmol/LTris-HCl,pH8.0)3.仪器设备:台式离心机、超净工作台、高压灭菌锅、恒温振荡培养箱、恒温水浴箱等。Eppendorf离心管,Tip头,三角瓶等灭菌备用。电泳仪,电泳槽,样品梳,微波炉,水浴锅,移液器(20ul,200ul和1000ul),离心管,Tips(200ul,1000ul)。四.操作步骤:1.质粒提取(1)将2ml含相应抗生素的LB培养基加入到容量为15ml的试管中,接种一单菌落,用棉

6、塞封口,在37℃剧烈震荡(250rpm)培养过夜。(2)将1.5ml培养物转入离心管中,用台式离心机在4℃条件下离心30秒(12,000×g)。(3)弃上清液,用滤纸吸干离心管中的液体培养基,将细菌沉淀物悬浮于200mlSTET缓冲液,用涡旋混合器充分混匀。(4)加入4ml新鲜配制的溶菌酶液,混匀,置室温下5min。(5)用漂子架住离心管,置于沸水浴中,精确记时45秒,取出后立刻离心10min。(6)用无菌牙签挑取离心管中的沉淀物弃去,离心管的上清液中加入8ml5%CTAB,用混合器混匀后,高速离心5min,弃上清液,用滤纸

7、吸干离心管中的液体。(7)加入1.2M氯化钠300ml,充分溶解沉淀物,再加入750ml的冷乙醇,充分混匀后,离心15min,弃上清液。(8)取1ml70%冷乙醇,缓慢淋洗离心管内壁,离心5min。弃上清液,用滤纸吸干管壁上的液体,置室温中使核酸沉淀自然干燥5-10min。(9)沉淀物溶于50mlTE缓冲液中,混合器混匀。(9)即成质粒制备液,制备的质粒供下一步实验使用2.DNA的酶解设置DNA的酶切反应,按下列顺序加样(体积:ml):反应管对照管置备的质粒DNA22酶反应液(10′)22双蒸水1516限制性内切酶(5U)1

8、0总体积2020加完反应液,混匀,离心1分钟,置于370C水浴中,反应2小时。加入加样缓冲液(10′)2ml3.质粒DNA的琼脂糖电泳1)量取100毫升TAE电泳液,加入0.7克琼脂糖,混匀后,置于微波炉中,加热3分钟,充分溶解琼脂糖。注意观察,当心煮沸的液体,溢出!2)用灭菌后的橡皮胶,

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