环状RNA研究进展_刘军强

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1、第34卷第1期江苏师范大学学报(自然科学版)Vol.34,No.12016年2月JournalofJiangsuNormalUniversity(NaturalScienceEdition)Feb.,2016文章编号:2095-4298(2016)01-0047-06环状RNA研究进展刘军强,吴慧,朱诗琪,房兴堂,陈宏,张春雷*(江苏师范大学生命科学学院,江苏徐州221116)摘要:环状RNA(circularRNAs,circRNAs)是一类通过反向剪接(backsplice)方式形成的非编码RNA,因其剪接来源不同,主要分为外显

2、子来源环状RNA(exoniccircRNAs)和内含子来源环状RNA(ciRNAs).长期以来,由于环状RNA较低的表达量和科研条件的限制,相关研究较少.近年来,科研工作者借助高通量测序技术,结合其他现代分子生物学手段对其进行研究,取得了重要进展.目前已发现,环状RNA较线性RNA更加稳定,且有调控转录等作用.本文对环状RNA的研究历程、形成机制及一般特征、检测方法、功能等方面的最新研究进展进行了综述.关键词:环状RNA;非编码RNA;miRNA海绵;外显子来源的环状RNA;内含子来源的环状RNA中图分类号:Q1文献标识码:Ado

3、i:10.3969/j.issn.2095-4298.2016.01.013ResearchprogressofcircularRNAs*LiuJunqiang,WuHui,ZhuShiqi,FangXingtang,ChenHong,ZhangChunlei(CollegeofLifeScience,JiangsuNormalUniversity,Xuzhou221116,Jiangsu,China)Abstract:CircularRNAs(circRNAs)areonekindofnon-codingRNAthatproduc

4、edbybacksplice,theyaredividedintoexoniccircRNAsandciRNAsbysplicingresource.TheexpressionlevelofcircRNAsisverylow,anddifficulttoisolate,sotherelatedworksarelimited.Inthepastfewyears,theapplicationofhigh-throughputsequencingtechnologytogetherwithmolecularbiologytechnique

5、shaspromotedsignificantprogressincircRNAs.Recentex-perimentshavemadeitapparentthatcircRNAsmaybemorestablethanlinearRNAs,andtheevidencesuggestedthatcircularRNAsplaydifferentrolesinregulatingtotranscription.Thispapermainlyreviewedtheresearchhisto-ry,formationmechanism,ge

6、neralfeatures,detectionmethodsandthelatestfunctionalresearchprogressoncircR-NAs.Keywords:circularRNA;non-codingRNA;miRNAsponge;exoniccircRNA;ciRNA[7]20世纪70年代在RNA病毒的研究中首次发发现了环状RNA.[1]现了环状RNA(circRNAs)的存在,同时也开启随着时间的推移,环状RNA在人类细胞、小了该类RNA的研究历程.1979年,Hsu和Coca-鼠、线虫等生物中存在的事实也

7、得以验证.近年来,Prados报道利用电子显微镜在真核生物细胞质中RNA测序(RNAsequencing,RNA-seq)和生物信[2]发现了环形的RNA,进一步说明了环状RNA可息学技术的快速发展,使大规模分析转录组数据成能是一类广泛存在于真核生物和病毒之中的物质.为可能.2013年Jeck等发现在人类成纤维细胞中[8]1980年,Arnberg等在酵母线粒体中发现了非编码存在25000多种环状RNA,同年,Memczak等报[3]的环状RNA;1990年,环状RNA也被证实存在道在HEK293细胞中存在1950种环状RNA,小鼠

8、于酿酒酵母中,且发现其特性与肝炎病毒有相似脑组织中存在1903种环状RNA,线虫体内表达[4][9]性.由于当时科研条件的限制,并没有对环状724种环状RNA.且一项研究证实,人类的大量RNA进行进一步的研究,其一直被认为是RNA异基

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