酶学基础概论

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1、第一•章酶学基础概论辅酶或辅基全齡'酶蛋门j■接触残基{活性部位辅助残基催化基团(部位)底物结伶基团(部位〉'结构残基(活性部位以外的必需残基〉非贾献残基(“)非必需的:这些氮基酸对催化过程不起克接的或间接的作用。在某种情况下,把它们除去也不会使阳丧失活力。常常可以在腮的表面发现这些残基。(b)必需残基:与维持酶分子完整的三级结构有关的,这些残基的改变虽然并不氏接与底物的结合或它的转化有关,但还是会由于活性部位的空间定位消失而导致丧失催化活力。(C)结介残基。当底物与酶分子紧密接近时,这类残某使得底物就位,而它这样定位以使被改变了的链能接近催化残基。(d)

2、催化残基。催化键的转化。活性中心:酶分子中结合底物并起催化作用的少数氨基酸残基形成的-•定空间结构。包括底物结介部位和催化部位。腮分子表面,通常都有一个内陷的凹穴(或称裂隙),为疏水区域,活性部位往往就在这里。,含辅基的酶,辅基分子常结合在这一区域,构成活性部位的一部分。无论底物是小分子化合物或是人分子化合物,酶与底物接触的部位仅局限于十儿个氨基酸残基。就体积而言,活性部位仅占酶分子的1%~2%面积,-•般不到酶分子表面积的5%。—•些酶的活性部位研究资料衣明,有7种氨基酸残基出现在活性部位的频率最高。它们是:Ser、His、Cys、Tyr、Asp、Glu

3、和Lys,其次是Asg、Asn和Gin;Trp也常出现于活性部位或其附近。这些残基侧链,在一定pH条件下可以离解而带电荷,它们是极性基团。一、酶的催化作用特性高催化效率、强专一•性及酹活性可调控1.酶是口然界中催化活性最高的-•类催化剂:生命体系中发工的化学反应在没有催化剂存在的情况下,许多反应实际上是难于进行的。酶的高效催化性:催化效率相对其它类型的催化剂而言,可达IO?〜10“倍,是无催化反应速率的108-102°倍催化剂2H4。►2H9+O。AarfAMAarfAM铁离子为催化剂,反应速度5.6XW4血红素:6.0X10这些反应如果用毗哆醛和铜催化,

4、则后面三种反应,即反应⑵一⑷都能加速,但用酎催化列,则不同的反应需要不同的酶。(2)底物专-•性(substratespecificity):一种酶只能作用于某一种或某一类结构相性质相似的物质。绝对专一性:有些酶只作用于一种底物,催化一个反应,而不作用于任何其它物质。相对专一性:这类陋对结构相近的一类底物都有作用。包括键专一性和基I才I专一性。立休专一性:这类酶不能辨别底物不同的立休异构体,只对其中的某一种构型起作用1何不催化其他异构体。包括光学专一性和几何异构专一性基团(group)专一性。如0•葡萄糖昔酶,催化由卩•葡萄糖所构成的糖昔水解,但对于糖昔的

5、另一端没有严格要求。键(Bond)专一性。如酯酶催化酯的水解,对于酯两端的基团没有严格的要求。•“锁和钥匙”学说早在1890年E.Fisher就提出了“锁和钥匙”的学说來解释酶的作用专一性。他认为酶和底物间必定存在看互补的结构特征,只有那些符合这种特征要求的物质才是底物,才能和酶结合。刚性学说。过氧化氢酶:3.5X1061.酶是具有高度选择性的催化剂:酶的选择特性表现在两个方而(1)反应专一,性(reactionspecificity):酶一般只能选择性地催化一种或一类相同类型的化学反应,且催化的反应几乎不产生副反应(1)L-谷氨酸卡NAD(P)」e=^—

6、酮戊二酸+NH3+NAD(P)H(2)L-谷氨酸十草酰乙酸—a-酮戊二酸十L-门冬氨酸(3)L-谷氨酸=丫-氨基J•酸+C02底输耀合物CH^N-CHrCHrOc-0-谷氨酸乙酰胆碱酯陋催化乙酰胆碱牛成乙酸和胆碱,并耍求底物中胆碱部分的氮带止电,根据这种特点,对推测在该酶分子中至少有一个阴离子部位与酯解部位。事实也的确如此。这两个部位问有严格的距离,胆•碱和酰基间多一个或少一•个YH2—的衍生物都不适于作底物。2.诱导契合学说1959,Koshland酶和底物在接触以前,二者并不是完全契合的,只有在底物和酚的结合部位结

7、合以后,产牛了相互诱导,酶的构象发生了微妙的变化,催化基团转入了冇效的作用位置,酶与底物才完全契合,陋才能高速地催化反应。柔性学说,手为手套。诱导契合学说认为:①酶分子具有一定的柔顺性;②酶的作用专一性不仅取决于酶和底物的结合,也取决于酶对底物的催化,取决于催化基团的正确取位。诱导契合学说认为催化部位要诱导才能形成,而不是“现成的”。2.扭曲和过渡态学说酶的作用专一性既寓于酶与底物的结介,也寓于酶对底物的催化,酶与底物的结介不仅促成催化基团的正确取位,同时也为下一步酶对底物的催化作了难备。过渡态学说:①任何一个化学反应的进行都必须经过活性屮间络介物阶段或者

8、说过渡态阶段,而H,反应速度与过渡态底物的浓度成比例;②酶的活性屮

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