高通量DNA测序技术在抗体新药研发中的应用

高通量DNA测序技术在抗体新药研发中的应用

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1、DOI:10.16438/j.0513-4870.2012.03.014·322·药学学报ActaPharmaceuticaSinica2012,47(3):322−331高通量DNA测序技术在抗体新药研发中的应用122*余馨,刘启刚,王明蓉(1.中山大学药学院,广东广州510006;2.中国医药集团总公司成都生物制品研究所有限责任公司,四川成都610023)摘要:自2005年首次报道了一种基于微乳液PCR技术的高通量DNA测序技术(high-throughputDNAse-quencingtechnology)以来,高通量DNA

2、测序平台已经发展为基因组和各种基因文库序列检测的强大工具。大容量的抗体基因库是目前获得抗体新药的基础,高通量DNA测序技术为从海量的抗体基因库中快速发现功能抗体分子提供了可能。本文就近几年高通量DNA测序技术在抗体基因库的多样性分析,抗体CDR3区的高通量测序、频率分析、功能基因发现及各种展示技术与高通量DNA测序技术的对接应用等方面进行了综述,以期为抗体新药的研发提供一条新的技术路线。关键词:高通量DNA测序技术;单链抗体库;抗体多样性;抗体CDR区;抗体新药中图分类号:Q755;R943文献标识码:A文章编号:0513-487

3、0(2012)03-0322-10Currentapplicationsofhigh-throughputDNAsequencingtechnologyinantibodydrugresearch122*YUXin,LIUQi-gang,WANGMing-rong(1.SchoolofPharmaceuticalSciences,SunYat-senUniversity,Guangzhou510006,China;2.ChengduInstituteofBiologicalProducts,ChinaNationalPharmac

4、euticalCorp.,Chengdu610023,China)Abstract:Sincethepublicationofahigh-throughputDNAsequencingtechnologybasedonPCRreactionwascarriedoutinoilemulsionsin2005,high-throughputDNAsequencingplatformshavebeenevolvedtoarobusttechnologyinsequencinggenomesanddiverseDNAlibraries.A

5、ntibodylibrarieswithvastnumbersofmemberscurrentlyserveasafoundationofdiscoveringnovelantibodydrugs,andhigh-throughputDNAsequencingtechnologymakesitpossibletorapidlyidentifyfunctionalantibodyvariantswithdesiredproperties.Hereinwepresentareviewofcurrentapplicationsofhig

6、h-throughputDNAsequencingtechnologyintheanalysisofantibodylibrarydiversity,sequencingofCDR3regions,identificationofpotentantibodiesbasedonsequencefrequency,discoveryoffunctionalgenes,andcombinationwithvariousdisplaytechnologies,soastoprovideanalternativeapproachofdisc

7、overyanddevelopmentofantibodydrugs.Keywords:high-throughputDNAsequencing;single-chainantibodylibrary;antibodydiversity;CDRregions;novelantibodydrug[2][3]DNA序列蕴藏着生物体的全部遗传信息。从以探索。2008年Kahvejian展望了DNA测序技术[1]1977年Sanger关于DNA测序技术的首次发表至对生命科学的影响。近几年高通量DNA测序技术带今,新一代高通量DNA测序技术

8、的蓬勃发展,似乎来的前所未有的DNA测序能力,使基因的研究有了[4][5]很多生物学问题都可以借助高通量DNA测序技术予革命性的进展。迄今在基因组测序、基因组重测[6][7,8]序、蛋白质-DNA/RNA相互作用、小分子RNA收稿日期:2011-1

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