SRA数据库使用说明书

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1、SRA数据库帮助1.简介..............................................................................................................................-1-2.数据库查询与结果展示..............................................................................................-1-2.1.Run数据搜

2、索与结果展示.....................................................................................-1-2.2.Sample数据搜索与结果展示...............................................................................-3-2.3.Experiment数据搜索与结果展示..........................................

3、...............................-4-2.4.Study数据搜索与结果展示...................................................................................-5-3.数据下载....................................................................................................................

4、..-5-4.数据提交......................................................................................................................-6-5.数据格式......................................................................................................................-6-6

5、.常见问题......................................................................................................................-8-7.附录..............................................................................................................................-9-7

6、.1.GSFLX系统超高通量测序...................................................................................-9-7.2.Solexa高通量测序法原理..................................................................................-10-7.3.HeliScope测序技术简介...................................

7、..................................................-11-2008年11月17日1.简介近年来，随着科技的进步，新一代大规模平行测序技术诞生了，如454、Solexa和HeliScope等。这些测序技术可以同时对大量的短片段测序，由于其数据的复杂性及结果的高通量性，使原有的数据库不能适应新的测序结果。而一些小型实验室自身也不具备处理和管理这些复杂数据的能力。因此生命数据中心创建了SRA数据库，帮助用户管理这些测序数据，同时有助于科研界共享数据。SRA与Trace最大

8、的区别是将实验数据与元数据分离。元数据现在可以划分为以下几类。•Study--study包含了项目的所有metadata，并有一个NCBI和EBI共同承认的项目编号（universalprojectid），一个study可以包含多个实验（experiment）。•Experiment--一个实验记载实验设计（Design），实验平台（Platform）和结果