资源描述：
《大黄鱼肌钙蛋白基因克隆及序列特征【毕业设计】》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、本科毕业设计（20__届）大黄鱼肌钙蛋白基因克隆及序列特征目 录摘要1关键词1Abstract1Keywords1引言11材料与方法11.1材料11.1.1实验材料11.1.2主要试剂、仪器21.1.3主要耗材21.2方法21.2.1EST方法的原理21.2.2质粒的提取21.2.3EST测序31.2.4目的基因的生物信息学分析32结果32.1质粒抽提检测结果32.2序列测定42.3序列分析52.3.1大黄鱼肌钙蛋白cDNA序列与其他鱼类的同源性52.3.2系统进化树92.4蛋白质结构分析102.4.1一级结构102.4.2二级结构102
2、.4.3三维结构113讨论123.1肌钙蛋白的特征123.2EST方法的不足124结论12致谢14参考文献14摘要：肌钙蛋白是横纹肌中起主要调节作用的蛋白质。有三个亚基：与原肌球蛋白结合的肌钙蛋白T、调节肌动球蛋白ATP酶活性的肌钙蛋白I和钙结合的肌钙蛋白C。肌钙蛋白复合体调节了肌动蛋白与肌球蛋白的结合，影响肌肉收缩。因此该基因的研究对经济鱼类性状的改良具有重大意义。本实验从大黄鱼肌肉cDNA文库，运用EST技术获得肌钙蛋白基因序列，得到一条长为一千四百多个碱基的基因序列。在NCBI上经BlastX比对后，证实这是大黄鱼的肌钙蛋白基因。再
3、同金头鲷、斑马鱼、大西洋鳕、鹌鹑、灰树蛙、原鸡、小家鼠、吐绶鸡、非洲爪蟾等进行同源性比较，发现大黄肌钙蛋白基因与金头鲷、斑马鱼的同源性很高，达到了100%，与原鸡、小家鼠、灰树蛙的同源性也比较高，有91%，同吐绶鸡、非洲爪蟾、鹌鹑也有90%。这些数据说明，肌钙蛋白序列相当保守。从系统进化树分析得到，大黄鱼编码的肌钙蛋白位于高等动物群体中，并且与金头鲷、大西洋大比目鱼、大西洋鲑、大西洋鳕的亲缘关系最近，与文昌鱼、裸盖鱼、黑头呆鱼的关系都较远。最后，通过EXPASY分析其编码蛋白质序列，以确定蛋白质一级结构，二级结构和三维结构。关键词：大黄鱼
4、；肌钙蛋白；EST；序列分析Abstract:Troponin isa proteininstriatedmusclethatplaysamajor rolein regulation.Ithasthree subunits:the troponin Tthatcombineswithtropomyosin, thetroponin Ithatregulates the activityoftheATP enzymeofActomyosin,and theTroponin C thatcombineswiththe calcium.Tro
5、ponincomplexregulatesthecombinationoftheactin and myosin,thenleadstothecontractionofmuscle.Therefore,the researchonthisgenes isofgreatsignificancetothetraitsimprovementofeconomicfish.Inthisstudy, thetroponin sequencesfromthe cDNA library ofLarimichthyscroceamusclebyESTtec
6、hnologyweregot,thenobtainedagenesequencewiththebaseofmorethanfourteenhundredatlength.On the NCBI,itwasconfirmedthatthis wasthe troponin geneofLarimichthyscroceaafterthecomparisionthroughBlastX.AfterthehomologywithSparusaurata,Daniorerio,Gadusmorhua,Coturnixcoturnixl,Hyla
7、chrysoscelis,Gallusgallus,Musmusculus,MeleagrisgallopavoandXenopus laevis,thegeneofLarimichthyscroceatroponinhadhighhomologywithSparusaurata,Daniorerio,reaching 100%,hadrelativelyhigh homologywithHylachrysoscelis,Gallusgallus,Musmusculus,reaching91%,andhadasmuchas90%highw
8、ithMeleagrisgallopavo,Xenopus laevisandCoturnixcoturnixwasfoundduringtheexperiment.These dataind
