海洋天然产物与细胞周期蛋白激酶的分子对接研究【毕业设计】

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1、本科毕业设计（20__届）海洋天然产物与细胞周期蛋白激酶的分子对接研究目录中英文摘要1引言11.1细胞周期蛋白依赖性激酶（cyclin-dependentkinases,CDKs）11.1.1细胞周期蛋白依赖性激酶4（cyclin-dependentkinase4,CDK4）11.1.2细胞周期蛋白依赖性激酶5（cyclin-dependentkinase5,CDK5）21.1.3细胞周期蛋白依赖性激酶9（cyclin-dependentkinase9,CDK9）21.2细胞周期蛋白依赖性激酶(CDKs)抑制剂21.2.1Fascaplysin31.2.2VariolinB31.2.3Meri

2、olins和Meridianins31.3分子对接(MolecularDockingMethod)31.3.1分子对接原理41.3.2分子对接方法41.3.3分子对接软件41.4三维定量构效关系（3D-QSAR）41.4.1比较分子场分析法(comparativemolecularfieldanalysis,COMFA)42计算方法52.1化合物选择52.2分子对接62.2.1CDK4与fascaplysin的分子对接62.2.2CDK4与15b的分子对接62.2.3CDK9与Merionlin3的分子对接62.2.4CDK9与variolinB的分子对接62.2.5CDK5与Merionli

3、n3的分子对接72.33D-QSAR研究72.3.1通过分子对接确定Merionlin类化合物的药效构象72.3.2COMFA模型建立83结果与讨论83.1CDK4与抑制剂结合模式83.2CDK9与抑制剂结合模式103.3CDK5与抑制剂结合模式123.4COMFA模型133.5COMFA模型的三维等势图154结论16致谢17参考文献18附录19摘要：细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependentkinases,CDKs)是重要的药物设计靶点。其中CDK4影响DNA的复制和细胞的有丝分裂，成为抗癌药物设计中最吸引人的一个靶标；CDK5影响中枢神经系统的发育和神经元的正常功能，是防治中

4、枢神经系统疾病的一个重要靶标；CDK9影响基因转录，是治疗癌症、心脏病、艾滋病的一个重要靶标。分子对接技术已在海洋天然产物药物设计中发挥重要的作用。本文主要介绍CDK4、CDK5和CDK9以及他们分别与海洋天然产物fascaplysin、meriolins、variolinB和meridianins的分子对接，并提出对Merionlin抑制剂的结构修改思路。关键词：CDK4；CDK5；CDK9；分子对接；Merionlin抑制剂Abstract:Cyclin-dependentkinases(CDKs)areanimportanttargetfordrugdesign. CDK4 affect

5、s DNA replication andcell mitosis,andhasbeenoneofthemost attractive targetsforanti-cancer drugdesign;CDK5affectsthedevelopmentofthecentralnervoussystemandthenormalfunctionofneurons,andhasbeenanimportanttargetforthetreatmentofcentralnervoussystem;CDK9 affectsgene transcription,andhasbeenanimportant t

6、argetforthetreatmentofcancer、heartdiseaseandAIDs.Molecular dockinghasplayedanimportantrolein thedesignof marinenaturalproducts.ThispapermainlyintroducesCDK4、CDK5andCDK9,andthemolecular dockingwithmarinenaturalproducts,suchasfascaplysin,meriolins,variolinBandmeridianins,respectively,andputsforwardani

7、deaofhowtochangethestructureofMerionlininhibitors.Keywords:CDK4;CDK5;CDK9;moleculardocking;Merionlininhibitors1引言1.1细胞周期蛋白依赖性激酶（cyclin-dependentkinases,CDKs）细胞周期蛋白依赖性激酶（cyclin-dependentkinases,CDKs）是重