RNA干扰技术地特点

RNA干扰技术地特点

ID:47738230

大小:1.95 MB

页数:25页

时间:2019-10-14

RNA干扰技术地特点_第1页
RNA干扰技术地特点_第2页
RNA干扰技术地特点_第3页
RNA干扰技术地特点_第4页
RNA干扰技术地特点_第5页
资源描述:

《RNA干扰技术地特点》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库

1、实用标准文案RNAi具有的特征①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;④RNAi抑制基因表达的效应可以穿过细胞界限,在不同细胞间长距离传递和维持信号甚至传播至整个有机体以及可遗传等特点;⑤dsRNA不得短于21个碱基,并且长链dsRNA也在细胞内被Dicer酶切割为21bp左右的siRNA,并由siRN

2、A来介导mRNA切割。而且大于30bp的dsRNA不能在哺乳动物中诱导特异的RNA干扰,而是细胞非特异性和全面的基因表达受抑和凋亡;⑥ATP依赖性:在去除ATP的样品中RNA干扰现象降低或消失显示RNA干扰是一个ATP依赖的过程。可能是Dicer和RISC的酶切反应必须由ATP提供能量。RNAi的生物特性RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关①发现蠕虫mut-7基因参与RNAi并且与转座子的转座抑制有关;②在果蝇中,参与RNAi的RNA解螺旋酶Spindle-E的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性

3、。RNAi抵御病毒感染在拟南芥中研究转基因引起基因沉默时发现,sgs2/sde1基因突变的拟南芥对病毒的侵染表现出高度的敏感性。RNAi参与异染色质的形成和维持Hall等研究表明,着丝粒同源重复序列和RNAi组分一起正负调节着异染色质的形成并共同促使异染色质组装成核;Vople等在敲除裂殖酵母(S.pombe)的RNAi途径基因(如Argonaute、Dicer、RDRP)时发现异染色质转录得到的dsRNA可以在RNAi途径的参与下,加工成siRNA,siRNA募集异染色质蛋白1(HP1),然后靶向性引起相应异染色质区域的转基因沉默。RNAi参与机体的发育调

4、控及生理代谢RNAi只抑制转录后的基因,所以RNAi在生物体发育学研究中具有优势。Chuang文档大全实用标准文案等用RNAi技术进一步证实了AG、CLV3、AP1、PAN等已知功能基因在拟南芥花发育过程中的功能。在RNAi过程中形成的RISC复合物可根据不同情况分别利用siRNA或stRNA行使不同的功能,但最终均导致特定基因沉默。1.高效性:Elbashir等在研究中发现分别为25nmol/L与100nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的,只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大,只有当浓度降

5、低到0.05nmol/L时,沉默的效果才消失。Holen等也证实1~100nmol/L的双链RNA浓度对基因沉默的效果是一致的。这说明双链RNA介导的基因沉默效率是相当高的。需要ATP:Zamore等认为RNAi过程中至少有2个步骤需要能量的供给:一是长的双链RNA被Dicer所酶切产生双链RNA;二是在双链RNA与RISC结合解链后形成有活性的RISC。⒉特异性:Elbashir等和Brummelkamp等发现在21~23个碱基对中有1~2个碱基错配会大大降低对靶mRNA的降解效果。⒊位置效应:Holen等根据人TF(tissuefactor)不同的位置各

6、合成了4组双链RNA来检测不同位置的双链RNA对基因沉默效率的影响。在不同浓度和不同类型的细胞中,hTF167i和hTF372i能够抑制85%~90%的基因活性,hTF562i只能抑制部分基因活性,而hTF478i则几乎没有抑制基因的活性。他们还以hTF167为中心依次相差3个碱基对在其左右各合成了几组双链RNA,有趣的是它们所能抑制该基因活性的能力以hTF167为中心依次递减。特别是hTF158i和hTF161i只与hTF167i相距9个和6个碱基,但它们几乎没有抑制该基因活性的能力。结果还表明双链RNA对mRNA的结合部位有碱基偏好性,相对而言,GC含量

7、较低的mRNA被沉默效果较好。⒋竞争效应:Hoten等将10nmol/L和30nmol/L的hTF167i相比,两者的沉默基因效果无差异,但将20nmol/L基因抑制效果很差的PSK314i和10nmol/L的hTF167i相混和后,hTF167i产生的抑制效果明显降低。⒌可传播性:在线虫中,双链RNA可以从起始位置传播到远的地方,甚至于全身。Feinberg和Hunter在线虫细胞膜上发现一种跨膜蛋白SID1,它可以将双链RNA转运出细胞,因此系统性的RNAi包括了SID1介导的双链RNA在细胞间的运输。但在果蝇上并未发现有此基因的同源物,因此在果蝇上通过

8、注射产生的RNAi不能扩散。文档大全实用标准文案植物

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文

此文档下载收益归作者所有

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文
温馨提示:
1. 部分包含数学公式或PPT动画的文件,查看预览时可能会显示错乱或异常,文件下载后无此问题,请放心下载。
2. 本文档由用户上传,版权归属用户,天天文库负责整理代发布。如果您对本文档版权有争议请及时联系客服。
3. 下载前请仔细阅读文档内容,确认文档内容符合您的需求后进行下载,若出现内容与标题不符可向本站投诉处理。
4. 下载文档时可能由于网络波动等原因无法下载或下载错误,付费完成后未能成功下载的用户请联系客服处理。