全基因组关联分析GWAS.pdf

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1、‖攻克阿尔茨海默氏症专题———现状与展望‖在SORL1基因中确定了好几个与疾病有关的·生物百科·SNPs。他说：“很多人对此持怀疑态度，因为它是一种候选基因，但在最近的一些GWAS研究中获得了全基因组关联分析（GWAS）支持。”相关证据也支持了SORL1的作用———在蛋白质产生水平较低的小鼠中，其大脑中积聚的β淀粉样蛋白也更多。蒙蒂尼研究小组在血液或脑脊液（CFS）中寻找可能预示老年痴呆症发病的生理指标时，发现了另一个候选因子，即脑源性神经营养因子与其他多种神经系统疾病有关，而这种蛋白质水平被证明是预测阿尔茨海默氏症的一种强有力的指标

2、。然而，关于这种基因变异的致病作用还没有明全基因组关联分析（Genome-wideAsso-确的证据。蒙蒂尼说：“在我们的观察中还找不到ciationStudy，GWAS）是一种对全基因组范这其中的联系，但我们也还没有对这整个基因进围内的常见遗传变异（单核苷酸多态性和拷贝行测序。”数）基因总体关联分析的方法———在全基因组范有待实验科学家阐明机制围内进行整体研究，能够一次性对疾病进行轮廓性概览，适用于复杂疾病的研究。在全基因组层阿尔茨海默氏症风险的最后一个组成部分，可面上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾能源自于遗传易感性与一生

3、中积累起来的生理损病的关联研究，可以全面揭示疾病发生、发展与害之间的相互作用。蒙蒂尼说：“对于一种与老龄化治疗相关的遗传基因。密切相关的疾病来说，我们的生活环境和我们的人进行GWAS的前提是：基因组测序工作的完生经历，都将成为重要的影响因素。”成、基于序列变异-SNP单体型图谱构建和高通例如，糖尿病和中风可导致生产高活性的化合量基因分型技术的迅猛发展。物，这种被称为自由基的化合物反过来对脂肪、蛋优势：1.高通量———一次可以监测成百上白质和核酸诱导产生一些有毒的化学变化，这种氧千个SNPs；2.不只局限于“候选基因”，基因可化应激现象

4、似乎是阿尔茨海默氏症患者大脑中的以是“未知”的；3.GWAS研究不再需要在研究之一种普遍特征，其结果是有可能损害或杀死神经前构建任何假设。元。蒙蒂尼说：“这是人体老化的一个正常组成部GWAS为全面系统研究复杂疾病的遗传因分，但对于阿尔茨海默氏症患者来说，自由基会给素掀开了新的一页，为我们了解人类复杂疾病的他们造成更严重的损害。”作为细胞能量之源的线发病机制提供了更多的线索。目前，科学家已经粒体，通常对氧化应激起着调控作用，几项研究正在阿尔茨海默氏症、乳腺癌、糖尿病、冠心病、肺在对此作出评估，以确定线粒体DNA是否也包含癌、前列腺癌、肥

5、胖、胃癌等一系列复杂疾病中进了阿尔茨海默氏症的危险因子。行了GWAS并找到疾病相关的易感基因。在了解环境因素对疾病的影响方面，遗传学家由于形状与基因组之间的关系受很多种因面临着同样巨大的挑战。首先是数据的获得和分素的作用，因此，目前GWAS面临着一些问题，如析，然后还要构建出对诊断和治疗有意义的理论假获得的结果似是而非，不能完全解释某些病因等设，这些都费时费力且代价高昂。“遗传学有可能定等。但作为一种趋势，随着表观遗传图谱、蛋白表义某种相关性，但却无法确定其机制，”蒙蒂尼说，达谱以及生理学等学科综合推进，作为一种综合“现在是需要实验科

6、学家去努力弄明白这类机制的性的分析方法，GWAS必将迎来一个更广阔的发时候了。”展空间。[资料来源：Nature][责任编辑：则鸣]28世界科学2011.9