肝癌原发灶及胆管癌栓样本.ppt

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1、肝癌原发灶及胆管癌栓样本差异基因表达谱的分析东方肝胆外科医院胆道一科谭蔚锋罗祥基姜小清第六届中国肿瘤学术大会现状合并胆管癌栓（Bileducttumorthrombi，BDT）的肝细胞癌(Hepatocellularcarcinoma,HCC)约占原发性肝癌病人总数的1.66%～4.9%。据此推算，我国每年合并胆管癌栓的肝细胞癌（Hepatocellularcarcinomawithbileducttumorthrombi，HCCBDT）的新发病例约为5000～15000人，因此，虽然HCCBDT发生率相对较低，但是罹患者

2、的绝对数量较大。第六届中国肿瘤学术大会HCCBDT是HCC中的一种特殊类型，它具有很强的侵袭和转移能力，术后早期复发和转移率高，术后1年复发率高达50%，5年生存率在20%左右，总体预后差，该病疗效亟待改善。第六届中国肿瘤学术大会1.临床资料4例原发性肝癌伴胆管癌栓患者，男性3例，女性1例，均经手术切除肝癌原发灶，并切开胆管取出癌栓。材料和方法：第六届中国肿瘤学术大会2.实验方法采用GIBCOBRC公司Trizol试剂盒及其方法抽提肝(肝癌)组织总RNA，采用RNeaSyMini试剂盒及其操作手册方法纯化RNA。核酸定量后

3、，采用美国Agilent公司的WholeHumanGenomeOligoMicroarray芯片和有关试剂盒及其方法，样本RNA使用cy3荧光标记后检测肝癌原发灶和胆管癌栓样本中等量RNA的转录水平。材料和方法：第六届中国肿瘤学术大会差异基因筛选：4组数据进行配对t检验，1-samplet-test。P-value<0.05且averagefoldchange>2or<0.5的基因为差异表达基因。我们定义foldchange为胆管癌栓/癌原发灶，比值取2的对数后大于1为上调基因，比值小于1为下调基因。材料和方法：第六届中国

4、肿瘤学术大会与GeneBank比对，随机选择其中的差异表达基因，采用RT-PCR进行验证材料和方法：第六届中国肿瘤学术大会结果：Agilent公司WholeHumanGenomeOligoMicroarray芯片共捡测41000个人类基因，共筛选到150个差异表达基因（其中胆管癌栓样本中49个基因上调，101个基因下调，P<0.05）。散点图第六届中国肿瘤学术大会GeneOntology分析通过使用GO（GeneOntology）分析方法结合国外文献相关报道，分别按照生物学过程（biologicalprocess)，细胞组

5、分(cellularcomponent)，分子功能(molecularfunction)三种独立的方式对这些差异基因进行分类。并发现生物学过程分类中，差异基因与developmentalprocess,celladhesion,defenseresponse,inflammatoryresponse,secretion；在细胞组分分类中，与extracellularregion；在分子功能分类中，与carbohydratebinding,proteinbinding,transferaseactivity,transfer

6、ringacylgroups,glycosaminoglycan（糖胺聚糖）binding显著相关，p<0.05。这些结果提示我们差异表达基因可能通过影响细胞的粘附、炎症反应等具体生物学功能参与肝癌中胆管癌栓的发生发展过程。GO分析第六届中国肿瘤学术大会差异表达基因分子互作网络通过整合三种蛋白相互作用数据库的数据，建立了胆管癌栓中差异表达基因的相互关系网络图。150个差异表达基因通过两两之间的相互作用，共同组成了一个复杂的网络图。这一结果提示我们差异表达蛋白之间可能通过相互作用实现彼此之间的功能调节，同时还提示我们其中某些

7、重要基因的表达可能具有至关重要的作用，具体的功能还需要进一步的分子生物学实验来证实。差异表达基因分子互作网络第六届中国肿瘤学术大会部分RT-PCR验证结果第六届中国肿瘤学术大会部分RT-PCR验证结果2010开题报告部分重要差异基因的生物学功能BAXBCL2-associatedXprotein，BAX（蛋白凋亡家族成员）LIFleukemiainhibitoryfactor（白血病抑制因子）CXCL1chemokine(C-X-Cmotif)ligand1(melanomagrowthstimulatingactivit

8、y,alpha)生长调节致癌基因αIL2RAinterleukin2receptor,alpha（白介素2受体-α）THBS1(TSP-1)Thrombospondin-1(凝血酶致敏蛋白-1)ECM2extracellularmatrix-2(细胞外基质)HBBhemoglobin,beta(血红蛋白