化工学院高性能计算机集群（HPC）使用说明教案.ppt

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1、化工学院高性能计算机集群（HPC）使用说明浙江大学化工学院曙光计算机公司6/15/2015本项目由18个曙光I620-G20高性能节点构成了基于Linux系统并行环境，以千兆快速TCP/IP以太通信网为基础，以NFS共享存储方式组的高性能并行计算系统；其中TC5000与TC5001为登录及管理节点、node1~node16为计算节点；其中TC5000与TC5001同时承担集群共享I/O服务，所有节点必须有共享/public目录；其中/public/software/下面为集群软件安装路径，所有软件安装到该目录下面，不同的软件安装

2、到该目录下面的不同文件目录，文件目录最好以软件名为名以进行区分。系统物理组成开机顺序：1、先开以太网交换机，FC光纤磁盘阵列电源；2、1分钟后打开TC5000与TC5001节点电源；3、3分钟后打开node1~node16电源；关机顺序：1、先关闭node1~node16电源;2、等待3分钟以后，关闭TC5000及TC5001电源；3、等待红3分钟后，关闭交换机及FC光纤磁盘阵列电源。开关机顺序管理节点登录IP：10.14.83.152用户名：（需要申请）密码：（需要申请）登录方式：ssh命令行登录、VNC图形化界面登录；登录工

3、具：putty命令行登录、VNCViewer图形化登录；LinuxtoWindows文件传输工具：winscp系统登录命令行登录-putty工具命令行登录命令行登录图形化登录使用VNCViewer工具输入服务器IP:端口号，然后点击OK图形化登录输入登录密码图形化登录-图形化界面登录成功右键、openterminal打开命令操作窗口图形化登录-图形化界面命令窗口启用VNC步骤：1、su-username2、vncserver（注意，第一次运行会提示设置密码）运行完后，注意生成的ID号,然后即可以用VNCviewer客户端工具连接

4、了。高级操作：1、vncserver-kill:ID号（杀掉刚刚生成的图形连接ID号）2、示例使用：vncserver-geometry1920x1080-depth24:5指定分辨率1920x1080，指定端口ID为5；3、改图形化登录密码：vncpasswd图形化登录开启方法文件传输工具文件传输工具操作系统：RedHatEnterpriseLinuxServerrelease6.4系统位数：64位编译器：Intel14，安装路径/public/software/intel，也可以使用whichicc或whichifort查看

5、详细路径；GCC编译器，使用whichgcc查看详细路径；Open-MPI1.6.3安装路径/public/software/mpi/openmpi1.6.3-intel/，也可以使用whichmpirun查看详细路径作业调度系统：torque；并行软件环境集群操作命令集群状态显示：pestat集群状态显示：pestst查看IP：ifconfig查看文件系统挂载：df-h显示当前所在文件夹路径：pwd显示当前所在文件夹下文件及文件夹：ls-a显示当前文件夹大小：切换文件夹：cd文件夹路径创建文件夹：mkdir文件夹名删除文件夹：

6、rm-rf文件夹名删除文件:rm-rf文件名查看文本文件内容:cat文件名编辑配置文件：vi配置文件名载入软件环境变量：source环境变量文件绝对路径系统基本操作命令集群管理命令：clusconf【添加账号：clusconf-au账号名】【删除账号：clusconf-du账号名】【同步文件：clusconf-yf路径加文件名】【批量执行命令：clusconf【测试IP：cluster-n】【集群文件系统显示：-yd命令】cluster-s-yddf-h

7、grep-E"node

8、public"】集群操作命令[root@node1

9、5~]#clusconf-autestuserREMOTE_SHusingssh/scpOperationisdoneinfollowinghosts:node1node2node3node4node5node6node7node8node9node10node11node12node13node14node15Nowadduser:testuserontheWholecluster5..4..3..2..1..InputtheHomedirectoryforuser:testuser[/public/home/testuser

10、]:直接回车InputtheGroupNameforuser:testuser[users]:直接回车Inputtheuidforuser:testuser[505]:直接回车Changingpasswordforusertestuser.NewUNIXpass