各种软件名称.doc

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1、文献管理与分析：EndNoteX1，文献管理软件，平时方便论文管理，写文章的时候插入文献也是相当的方便；RefViz2.1，文献分析软件，与EndNote结合使用，分析文献，可以省掉大把自己看自己归纳的时间；ReferenceManager似乎很久没有更新了，Thomoson看来以后可能只管EndNote了。分子生物学综合软件：VectorNTI10.3，分子生物学的综合软件，什么功能几乎都全了；BioEdit7，杂七杂八的功能凑在一起的一个分子生物学软件，有些罕见的VectorNTI所没有的功

2、能；DNAMAN6，与VectorNTI类似的一个软件，但是图型化上做的很差，集成度和序列的管理功能比VectorNTI差的不是一点点，罕用，但有时候有些序列的格式非得要用它的样子排，没有办法；大分子二维/三维结构绘图软件：PyMol0.99，有1.0，可惜要钱了，也没有P-J。蛋白质三维结构查看软件，神奇的就在于它可以编辑小范围内的结构；DeepViewer3.7，PDBViewer的换汤不换药升级版，在预测功能上有所突破，期待新版本的出现令其可与PyMol有的一拼，谁叫PyMol在Windo

3、ws下开始收钱呢？为了一个PyMol装个Linux似乎还没有这样大的动力；RNADraw1.1，RNA和DNA二级结构的分析软件，可以分析做PCR的时候的引物的二聚体，更直观一些；AcceleryInsightII，Linux下的大型三维结构模拟软件，2.1G！据称是非常强大。为了这个装个Linux似乎还说的过去。质粒绘图软件：VectorNTI和DNAMAN其实也可以画，但是不如下面这几个来的专业或方便：SimVector4，与PrimerPremier同一家公司的软件，画质粒的一个软件，效果

4、还行，与VectorNTI画出来的风格不一样，有的杂志喜欢；WinPlas2.7，很老的质粒绘图软件，很久没有升级了，画出来的质量非常差，可是小，比较快；VisualCloning3.2.4，一个界面豪华的质粒及克隆整个过程的画图软件，大而慢，选用。引物设计软件：Primerpremier5，引物设计软件，大家都用，我也用；Oligo6.7包1，引物设计软件，大家都用，我还用，设计FusionPCR和In-Fusion连接的引物的时候，比Primerpremier直观一些；AlleleID6.0

5、/BeaconDesigner7.0，RT-PCR设计软件，与PrimerPremier同一家公司的软件，软件界面非常相似，到现在也没有搞清楚两个有什么区别，不知道有什么意思，具体还需要试一下；办公软件：MicrosoftWORD2003，不说了；MicrosoftExcel2003，不说了；MicrosoftPowerPoint2003，不说了；AdobeAcrobatProfessional8.1，不说了；PDF2Office2.0，把PDF转成WORD，中文支持大大的好，但页面格局往往破坏

6、的一塌糊涂；AdultPDFPasswordRecovery2.3，看名字就知道干什么的了，相当强大，加密的PDF往往不能取词不能打印；SolidPDFConverter3.0，把PDF转成WORD，中文支持大大的不好；凝胶分析软件：QuantityOne4.6.2，BioRad的凝胶成像仪自带的电泳图像软件，算很好上手的了；GelProAnalyzer4.5，跑胶和杂交以及菌落的分析软件，已有6.0版，可惜我这里没有破解版；PDQuest8.0.1Advance，BioRad的二维电泳分析软件

7、，算好用的，功能上没用过其它的，真的不好说；代谢网络和信号传导分析软件：CellNetAnalyzer6.0，以前叫FluxAnalyzer，基于MatLab的代谢网络和信号传导网络分析模块，大部分论文中的代谢网络分析都是或明或暗的用这个分析的；PathwayStudio5.0，蛋白质相互作用、细胞信号转导和代谢分析的软件；图片处理：图片是用来表达思想最有力的工具了，所以在这里就多了一些。AdobePhotoshopCS3Extended，修改图片，可以做出以假乱真的效果，功能非常强大，但在画示

8、意图上不是很方便，对线条和几何图形的支持尤为不便；AdobeStreamline4，好久没有升级的一个软件，把位图转成矢量图的一个软件，很好用；Image-ProPlus6.0，对图象进行加工处理并得到数据的软件，专业，相当的专业，已有6.2版，可惜我这里没有破解版；AdobeFireworksCS3/IllustratorCS3，矢量图和位图工具二合一，可以画一些复杂的图，像GENE，MCB上面的很多图都可以很轻松的用Fireworks/Illustrator画出来，流程图，细胞结构，各种复杂