生物技术前沿进展作业.doc

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1、Identificationofgenomicalterationsinoesophagealsquamouscellcancer研究内容:研究人员在广东汕头收集了158个患有食道癌的病人的ESCCDNA样本，对部分样本进行全基因组测序和外显子基因组测序，在17全基因组和71个外显子序列发现了7182个单个核昔酸突变和97个插入和删除，发现了8个与食管鳞癌发生相关的重要的基因突变，其小FAM135B是首次发现的肿瘤相关基因；同吋获得了食管鳞癌拷贝数变异的重要数据，发现位于染色体llql3.3-13.4扩增区域的MIR548K参与食管鳞癌的恶性表型的形成,,这些突变都和Wnt、ce

2、llcycle和Notch通路有关,通过基因分析发现ESCC和头颈鳞状细胞癌在致病机理上有些相似之处，研究还发现ESCC的发展和吸烟酗酒的相关性。研究人员还将ESCC和其他肿瘤细胞比较发现一些突变位点上的异同点，这些基因突变和拷贝数的变杲是食管癌发生发展的重要因素，与预后密切相关。■SynonymousNon-synonymous■Nonsense■Splicesite■Frameshift■Inframeindel■MlssenseSynonymousIndividuals3withmutationTP53CDKN2ARB1NFE2L2ADAM29FAM135BPIK3CANO

3、TCH110(q-value)35如上图所示，研究人员发现了ESCC屮8个有意义的突变基因和不同的基因突变的频率。其屮研究样本屮有83.0%的样本体细胞TP53发生突变，85%的突变发生在DNA-bindingdomain；FAM135B在样本的突变率是6.8%,在检测在九个ESCC细胞系屮FAM135B的表达是发现，所有的细胞系均出现FAM135B的大量过表达。研究人员还发现53.4%的样本的48个组蛋白相关的基因发生了突变，突变频率最高的是组蛋白修饰的赖氨酸甲基转移酶。研究人员还发现ESCC和HNSCC的共同之处,RAF1和RASA1的缺失,EGFR、MYC、KRAS和AKT

4、1的扩增出现在相同序列，这表明MAPK路径的激活在ESCC和ENSCC是相同的事件，另外也包括cellcycle和JAK-STAT路径，这些发现说明ESCC和HNSCC有着相同的致病机理，同吋也暗示他们之间有着类似的治疗方法。研究历史：在此前屮国医学科学院肿瘤研究所也对食管鳞状细胞癌进行过研究发表于《NatureGenetics》上，在这篇文章屮，为了阐明食管鳞状细胞癌发生发展的遗传病因，研究人员对2,031例食管鳞状细胞癌患者和2,044个正常对照组进行了全基因组遗传变杲的关联研究，并分析了全基因组基因与环境的相互作用。进而在独立的一组&092个食管鳞状细胞癌患者和&620个正

5、常对照屮进行了验证，确定了9个新的食管鳞状细胞癌易感位点，其屮七个分别定位在4q23、16ql2・l、17q21、22ql2、3q27、17pl3和18pll染色体区域,具有显著的边际效应；另外两个定位在2q22和13q睨染色体区域，只在基因与饮酒和互作用屮具有显著相关性。4q23位点内的变异，包括ADH基因簇，每-•个与食管鳞状细胞癌风险具有相关性的均与饮洒有显著的相互作用。研究人员还证实了12q24上ALDII2位点与食管鳞状细胞癌的相关性，II联合分析显示具有ADH1B和ALDH2风险等位基因的饮酒者相比于没有这些等位基因的饮酒者食管鳞状细胞癌风险增加了4倍。新研究阐明了食

6、管鳞状细胞癌风险的直接遗传贡献因子，以及通过与饮酒的相互作用促成食管鳞状细胞癌的遗传因子。这些研究结果推进了对食管鳞状细胞癌发牛发展机制的认识，同吋也为食管鳞状细胞癌的预防和治疗提供了潜在的靶点。由此可见，再次基础上此次研究人员的发现有了重大的突破与进展。研究方法：研究人员通过高通量测序、比较基因组杂交芯片分析、生物学功能和临床验证研究等方法，全面系统揭示了食管鳞癌的遗传突变背景，发现了与食管鳞癌发生发展进程和临床预后相关的基因。研究意义：该研究为了解食管鳞癌的发病机理、寻找食管鳞癌诊断的分子标志物、确定研发临床治疗的药物靶点以及制定有效治疗方案提供了理论和实验依据。面临的问题：

7、H前，学界对食管癌发生和发展的机制尚不明了，临床治疗缺乏特异性的分子靶点和有效的治疗药物。还北衣林哥牧大学NORTHWESTA&FUNIVERSITY生命科学前沿进展作业学院：生命科学学院专业：生物技术班级：生技113姓名：李欢乐学号：2011014026时间：2014.06.07